Praktikum LGL

In welcher Phase befindet sich die DNA bei der Phasentrennung?

• obere wässrige Phase
• Interphase
• untere organische Phase
• Pellet

Unter welchen Bedingungen komplexiert Cetyltrimethylammoniumbromid (CTAB) die DNA?

• hohe Salzkonzentration
• niedrige Salzkonzentration
• in Kombination mit Alkohol
• in Kombination mit SDS

In welcher Reihenfolge werden die Phasen der PCR durchlaufen?

• Elongation - Annealing - Denaturierung
• Annealing - Denaturierung - Elongation
• Denaturierung - Elongation - Annealing
• Denaturierung - Annealing - Elongation

Wie erhalte ich den Cq-Wert?

• Schnittpunkt der Amplifikationskurve mit der Basislinie
• Schnittpunkt der Basislinie mit dem Threshold
• Schnittpunkt der Amplifikationskurve mit dem Threshold
• Schnittpunkt der Amplifikationskurve mit der Y-Achse

In welche Richtung laufen die DNA-Banden bei der Gelelektrophorese?

• vom Plus- zum Minuspol
• vom Minus- zum Pluspol
• von oben nach unten
• von unten nach oben

Wieso kommt man bei der PCR irgendwann in ein Plateau?

• Die optimale Temperatur kann nicht mehr erreicht werden
• Es sind zu viele Produkte vorhanden, die sich direkt wieder zusammenlagern und daher nicht vervielfältigt werden können
• Das Gerät kann nur eine bestimmte DNA-Maximalmenge detektieren
• Die Polymerase und Primer sind aufgebraucht

Wie kann ich die (absolute) Kopienzahl des Ziel-Gens in der real-time PCR bestimmen?

• Standardgerade mit Proben bekannter Konzentration und Vergleich mit der gemessenen Probe
• Quotient aus Cq des Ziel-Gens  und Cq des Referenzgens
• Kopienzahl ist direkt aus der Amplifikationskurve ablesbar
• Die Höhe der Amplifikationskurve gibt die DNA-Kopienzahl an

Welche Komponente gehört NICHT in den PCR-MasterMix?

• Primer
• MgCl₂
• Restriktionsenzym
• dNTPs

Was passiert bei der DNA-Extraktion wenn hochkonzentrierter Alkohol zugegeben wird?

• Alkohol zerstört die Wasserstoffbrücken zwischen den DNA-Strängen und die DNA fällt aus
• Alkohol entfernt die Hydrathülle um die DNA, so dass die DNA nicht mehr löslich ist und ausfällt
• Alkohol bindet an die Wasserstoffbrücken der DNA und trennt dadurch die DNA vom Wasser, wodurch die DNA ausfällt
• Alkohol verändert die Braun'sche Molekularbewegung, wodurch die DNA nicht mehr zirkuliert und ausfällt

Ich messe zwei Proben mittels real-time PCR. Probe 1 hat einen Cq von 30. Probe 2 hat einen Cq von 34. Welche Aussage können Sie bezüglich der DNA-Kopienzahl von Probe 2 im Vergleich zu Probe 1 treffen?

• 4x weniger Kopien als in Probe 1
• 16x weniger Kopien als in Probe 1
• 4x mehr Kopien als in Probe 1
• 16x mehr Kopien als in Probe 1