Prediksi Struktur Protein

Gambar struktur protein untuk soal 1-5

1. Poin B menunjukkan ... dari suatu protein.

• Alpha helix

• Beta sheet

• Beta turn

• N-terminal

• C-terminal

2. Sedangkan alpha helix ditunjukkan oleh poin ...

• D

• E

• B

• A

• C

3. Berdasarkan konsensus pembacaan urutan peptida, protein diatas berawal dari ujung ... hingga ujung ...

• A - E

• E - A

• B - C

• D - A

• A - B

4. Gambar diatas merupakan struktur ... protein

• Tersier

• Sekunder

• Primer

• Kuatener

• Dimer

5. Struktur poin C dinamakan ...

• Beta turn

• Beta sheet

• Beta barrel

• Beta strand

• Beta helix

6. Berdasarkan properti kimia dan fisika, kelompok rantai samping dari asam amino dapat dibedakan menjadi kelompok hidrofobik dan hidrofilik, dimana untuk kelompok hidrofobik dibedakan lagi menjadi kelompok aliphatic dan aromatic. Berikut ini pertanyaan yang benar berdasarkan kelompok asam amino tersebut adalah...

• Kelompok aliphatic dan aromatic tersusun dari hidrokarbon yang berbentuk cyclic (cincin)

• Kelompok aliphatic tersusun dari rantai hidrokarbon linear, sedangkan aromatic berbentuk cincin

• Kelompok aromatic tersusun dari rantai hidrokarbon linear, sedangkan aliphatic berbentuk cincin

• Kelompok aliphatic dan aromatic tersusun dari rantai hidrokarbon linear

• Kelompok aliphatic dan aromatic tersusun dari rantai hidrokarbon yang berubah-ubah bentuknya

7. Pernyataan berikut ini yang benar mengenai struktur protein adalah...

• Struktur primer protein terdiri dari residu asam amino yang tersusun linear yang dihubungkan dengan ikatan hidrogen

• Struktur sekunder tersusun dari bagian-bagian rantai polipeptida yang yang terkumpar membentuk beta-sheet dan terlipat membentuk alfa-helix

• Struktur tersier melibatkan seluruh konformasi dari rantai polipeptida dan merupakan hasil interaksi dari rantai samping (gugus R)

• Struktur kuartener merupakan keseluruhan struktur protein yang berupakan hasil dari pemisahan subunit-subunit polipeptida

• Semua jawaban diatas benar

8. pH isoelektrik (pI) adalah...

• pH ketika muatan total protein sama dengan nol

• pH yang terjadi akibat muatan bernilai nol

• pH ketika dua protein memiliki muatan yang sama

• Muatan ketika pH total protein sama dengan nol

• Keadaan ketika pH dan muatan protein sama

9. pH isoelektrik (pI) tidak perlu diketahui dalam SDS-PAGE, karena...

• Dalam SDS-PAGE, protein didenaturasi dan muatannya dibuat negatif

• Dalam SDS-PAGE, tidak ada pengaturan pH untuk gel dan buffernya

• pI tidak mempengaruhi migrasi protein yang berada di medan listrik

• Muatan protein dalam SDS-PAGE selalu bernilai positif

• SDS dapat menetralkan pH dalam proses SDS-PAGE

10. Agar dapat menembus membran sel, protein memerlukan bagian yang bersifat ...

• Hidrofobik

• Hidrofilik

• Netral

• Bermuatan negatif

• Dimer