18.02.2021 Prof. Dr. Sümer Aras test-1

Rekombinant DNA teknolojisi ile ilgili verilen ifadelerden hangisi doğrudur?

• Klonlar, tek bir atadan kök alan, birbirine özdeş organizmalar, hücreler ya da moleküllerdir.

• Virüslere karşı bir savunma mekanizması olarak kullanılırlar.

• Primerler kullanılmalıdır.

• Bilinen bir bölgeye komşu olan karakterize edilmemiş bir DNA bölgesine araştırmak için uygundur.

Aşağıdakilerden hangisi bir vektörde bulunması gereken özelliklerden biri değildir?

• Taşıdığı herhangi bir DNA parçasını bağımsız olarak replike edebilmelidir

• Klonlanacak DNA parçasının insersiyonuna olanak tanıyan tanıma dizisi içermelidir

• Cos dizileri içermeliler

• Seçicilik sağlayan bir marker gen bulunmalıdır.

Restriksiyon enzimleri ile ilgili verilen ifadelerden hangisi yanlıştır?

• Enzim, DNA’nın iki zincirini özgül bir kesim kalıbı oluşturacak şekilde keser.

• Restriksiyon parçalarının büyüklüğü, söz konusu restriksiyon enzimlerinin DNA’yı ne kadar sıklıkla kestiğine göre hesaplanır

• Tanımlanan ilk restriksiyon enzimlerinden biri E. coli’nin R suşundan izole edilmiş olan Eco RI’dir.

• Restriksiyon enzimi DNA’yı yalnızca asimetrik olarak keserek tek zincirli kuyrukları olan parçalar oluşturur.

DNA parçası içerme kapasitesine göre aşağıda verilen sıralamalardan hangisi doğrudur?

• pYAC3 < pBAC < kozmit < M13 < pBR322

• pBR322 < M13 < kozmit < pBAC < pYAC3

• pYAC3 < pBAC < kozmit < λ < pUC18

• pUC18 < pET LIC < λ < pYAC3 < pBR322

Ökaryotik genlerin ifadesi ve klonlanması için kullanılan Saccharomyces cerevisiae mayası ile ilgili verilen bilgilerden hangisi yanlıştır?

• Maya ökaryotik bir organizma olmasına rağmen bakteri hücreleri gibi manipüle edilebilir (yönlendirilebilir) ve üretilebilir.

• Replikatif formu bulunmaktadır

• Tüm genomunun dizi analizi yapılmış ve organizmadaki genlerin çoğu belirlenmiştir.

• Saf YAC DNA’sı fare yumurta hücresine mikroenjeksiyon yoluyla sokulabilmektedir.

Ti plazmiti ile ilgili verilen bilgilerden hangisi yanlıştır?

• Memeli organizmalara gen aktarmak için vektör olarak kullanılır.

• Tümör oluşumu, bakterinin taşıdığı tümör-indükleyici (Ti) plazmit sayesinde olur.

• Yabancı genler, T-DNA parçasının içine sokulabilir

• Rekombinant Ti plazmiti taşıyan hücreler, kültür ortamında kallus (callus) olarak bilinen hücre kitlesi oluşturarak büyüyebilir.

PCR ile ilgili verilen bilgilerden hangisi doğrudur?

• Konak hücre olmadan DNA kopyaları yapamaz.

• Birleşme (annealing) sıcaklığında Taq polimeraz tek zincirli DNA’ya bağlanır.

• Nükleotitler 3’den 5’ne doğru eklenerek primerlerin uzamasını sağlar.

• Farklı DNA molekülleri karışımında, yok denecek kadar az miktarda bulunan hedef DNA dizisini çoğaltabilir.

Problar ile ilgili verilen ifadelerden hangisi yanlıştır?

• Prob, kütüphanedeki klonlanmış bir dizinin bir kısmına eşlenik (komplementer) olan ve bir şekilde işaretlenmiş DNA ya da RNA dizileridir.

• Hibridizasyon reaksiyonunda kullanılan prob, bir ya da daha fazla klonda bulunan komplementer DNA dizlerine bağlanır.

• Problar yalnızca tek bir kaynaklardan hazırlanabilir.

• Eğer bir genomik kütüphaneden, belirli bir tip hücrede ifade olan bir gen elde edilecekse, cDNA probları kullanılabilir

Nükleik asit blotlaması ile ilgili verilen ifadelerden hangisi doğrudur?

• Birbirinin tamamlayıcısı (komplementeri) olan nükleik asit (DNA ya da RNA) molekülleri arasındaki hibridizasyona dayanır

• Nourthern blot hibridizasyonu ile belirlenen DNA, genomik DNA ya da bir kütüphaneden seçilmiş klonlar gibi çeşitli kaynaklara ait olabilir.

• Western blot seçenekli sıplays (splice) sonucu oluşan mRNA’ları saptar.

• DNA probuna komplementer mRNA varsa probla hibridize olacağından, film üzerinde bant şeklinde beliremez.

Sanger dizileme yöntemi ile ilgili verilen ifadelerden hangisi yanlıştır?

• Dizisi belirlenecek DNA molekülü bir seri eşlenik zincirlerinin sentezlenebilmesi için önce tek zincirli hale dönüştürülür

• Reaksiyonda ilk adım, DNA’nın ısıyla denatüre edilerek tek zincirli duruma getirilmesidir.

• Tek zincirli DNA, 5’ ucuyla birleşecek olan primerler ile karıştırılır.

• Primer bağlı tek zincirli DNA örnekleri dört ayrı tüpe pay edilir. Bir sonraki adımda, tüplere DNA polimeraz ve dört tip deoksiribonükleotit trifosfat (dATP, dCTP, dGTP, dTTP) ilave edilir.