Quiz conclusivo corso Biochimica Avanzata

Quali sono gli amminoacidi ramificati sul carbonio beta?

• S-A-C

• V-T-I

• D-E-K

• F-W-H

A quale di queste proteine si riferisce il Ramachandran plot in figura?

• Emoglobina

• immunoglobulina

• Triosofosfato isomerasi

• p53

Quali tra le seguenti strutture si assomigliano maggiormente?

• 1mbn - 1nz2

• 1nz2 - 1ag1

• 1ag1 - 1bb3

• 1bb3 - 1cj5

Qual è la classificazione CATH della porina?

• 1.10.530.40

• 4.7.22.15

• 3.20.20.70

• 2.40.160.10

Quale tra questi parametri rientra tra le Ebond del force field Amber?

• Energia di torsione del legame peptidico

• Energia di legame idrogeno che stabilizza le alfa eliche

• Energia di interazione tra residui apolari

• Energie calcolate sui restrains derivanti da NMR

Qual è il codice corrispondente al dominio legante il cofattore dell'enzima aspartato amminotransferasi umano citosolico?

• IPR011644

• IPR015424

• IPR005286

• IPR011538

Quali sono i tre residui catalitici della tripsina 1 umana?

• E75 - N77 - E85

• C30 - C48 - C160

• H63 - D107 - S200

• A16 - D22 - K23

Se tramite una ricerca in BLAST trovo una proteina con un Evalue di 1, posso considerare il risultato statisticamente significativo?

• SI

• NO

Quale approccio applica PSIPRED per fare predizioni di strutture secondarie?

• Un approccio statistico

• Un approccio di fold recognition

• Un approccio di machine learning

• Un approccio di template-based modelling

Quale contributo energetico aumenta la specificità di interazione proteina-ligando?

• Interazione elettrostatica

• Legami idrogeno

• Interazione di van der Waals

• Interazione idrofobica