Uji Kompetensi Bab 1 Berfikir Komputasional (Tematis)

Fitur yang dimiliki Cluster Development Kit sangat lengkap sehingga bila ingin melakukan komputasi dapat dilakukan dengan ....

• computational prosessing

• hybrid prosessing

• parallel prosessing

• serial prosessing

Answer explanation

Cluster Development Kit memiliki feature yang lengkap bila ingin melakukan komputasi dengan paralel prosessing, karena software ini telah mensupport MPI dalam melakukan perhitungan komputasi.

Perhatikan pernyataan berikut!

(1) Penyebaran proses (spawn proccess).

(2) Display fungsi-fungsi waktu.

(3) Inisialisasi dan collection.

(4) Display input terstuktur.

Berdasarkan pernyataan di atas, program master bertugas dalam ....

• (1) Penyebaran proses (spawn proccess).

  dan

  (3) Inisialisasi dan collection.

• (2) Display fungsi-fungsi waktu.

  dan

  (4) Display input terstuktur.

• (1) Penyebaran proses (spawn proccess).,

  (2) Display fungsi-fungsi waktu.,

  dan

  (3) Inisialisasi dan collection.

• 2) Display fungsi-fungsi waktu.,

  (3) Inisialisasi dan collection.,

  dan

  (4) Display input terstuktur.

Answer explanation

Model Crowd Computation terdiri atas kumpulan proses yang sangat erat berhubungan dengan cara melakukan komputasi pada bagian-bagian yang berbeda dari workload. Misalnya pola yang digunakan pada model Master-Slave. Program master bertugas penyebaran proses (spawn proccess), inisialisasi, collection, display hasil, dan display fungsi-fungsi waktu. Adapun program slave bertugas melaksanakan komputasi yang sebenarnya dengan menerima alokasi task (workload) dari master secara statis maupun dinamis serta melakukan komputasi task-task dari alokasi dirinya sendiri.

Perhatikan pernyataan berikut!

(1) Uniform Memory Access (UMA).

(2) Startup time dab per-hop time.

(3) Non Uniform Memory Access (NUMA).

(4) Per-word transfer time.

Berdasarkan data di atas, shared memory berdasarkan frekuensi akses dikategorikan menjadi ....

• (1) Uniform Memory Access (UMA).

  dan

  (3) Non Uniform Memory Access (NUMA).

• (2) Startup time dab per-hop time.

  dan

  (4) Per-word transfer time.

• (1) Uniform Memory Access (UMA).,

  (2) Startup time dab per-hop time.,

  dan

  (3) Non Uniform Memory Access (NUMA).

• (2) Startup time dab per-hop time.,

  (3) Non Uniform Memory Access (NUMA).,

  dan

  (4) Per-word transfer time.

Answer explanation

Terdapat ada dua jenis shared memory berdasarkan frekuensi akses yaitu Uniform Memory Access (UMA) untuk setiap prosesor memiliki hak pengaksesan yang seragam dengan prosesor lain dan Non Uniform Memory Access (NUMA) dimana tidak semua prosesor memiliki hak yang sama dalam mengakses memori. Kelebihan dari arsitektur ini antara lain pengaksesan memori yang user friendly dan performansi dalam penggunaan data bersama antar task. Adapun kekurangannya antara lain minimnya skalabilitas pada saat terjadi penambahan prosesor, di mana terjadi peningkatan traffic antara prosesor ke shared memory dan antara cache coherent system dengan memori sebenarnya.

Perhatikan pernyataan berikut!

(1) Sekuens DNA.

(2) Analisis statistik.

(3) Asam amino.

(4) Karakteristik tubuh.

Bioinformatika juga mempelajari penerapan teknik komputasi untuk memecahkan masalah- masalah yang terkait pada penggunaan sesuai

dengan nomor ....

• (1) Sekuens DNA.

  dan

  (3) Asam amino.

• (2)Analisis statistik.

  dan

  (4) Karakteristik tubuh.

• (1) Sekuens DNA.,

  (2)Analisis statistik.,

  dan

  (3) Asam amino.

• (2)Analisis statistik.,

  (3) Asam amino.,

  dan

  (4) Karakteristik tubuh.

Answer explanation

Bioinformatika memelajari penerapan teknik komputasi untuk mengelola dan menganalisis informasi hayati yang mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologi, terutama yang terkait penggunaan sekuens DNA dan asam amino. Misalnya analisis ekspresi gen, analisis filogenetik, pangkalan data untuk mengelola informasi hayati, sequence alignment (penyejajaran sekuens), dan prediksi struktur untuk meramalkan struktur protein dan struktur sekunder RNA.

Tree Computation menggunakan adalah pola hubungan antarnode sebagai hubungan tipe ....

• parent-child

• branch-bound

• divide-conquer

• alpha-beta search

Answer explanation

Tree Computation adalah pola pemrograman di mana proses disebar secara dinamis seperti tree (pohon). Hubungan antarnode sebagai hubungan parent-child, sehingga sesuai untuk aplikasi dengan total proses yang terbentuk tidak diketahui sebelumnya. Pada umumnya, model jenis ini dipakai untuk algoritma dengan tipe branch and bound, tipe alpa beta search, serta tipe recursive divide and conquer.

Software yang diperlukan untuk komputasi parallel adalah ....

• PGI CDK

• Parallel Virtual Machine (PVM)

• Office Package

• Message Passing Interface (MPI)

Answer explanation

Kegunaan dari NFS pada komputasi parallel adalah untuk melakukan sharing data sehingga setiap node slave dapat mengakses program yang sama pada node master. Software yang diperlukan untuk komputasi parallel adalah PGI CDK yang telah dilengkapi dengan Cluster Development Kit. Cluster Development Kit memiliki fitur yang lengkap bila ingin melakukan komputasi dengan parallel prosessing, karena software ini telah mensupport MPI dalam melakukan perhitungan komputasi

Standar Message Passing Interface dan standar Parallel Virtual Machine bekerja diatas jalur ....

• TCP/IP

• LAN NETS

• IPX/SPX

• HUB

Answer explanation

Komunikasi data pada sistem paralel memori terdistribusi memerlukan alat bantu komunikasi. Dalam hal ini, alat bantu yang digunakan oleh PC jaringan berupa standar MPI (Message Passing Interface) atau standar PVM (Parallel Virtual Machine). Keduanya piranti tersebut bekerja diatas ja TCP/IP communication layer sehingga memerlukan fungsi remote access agar dapat menjalankan program pada masing-masing unit prosesor.

Bioinformatika yang ditemukan pada pertengahan tahun ....

• 1990-an.

• 1980-an

• 1970-an

• 1960-an

Answer explanation

Ilmu terapan yang lahir dari perkembangan teknologi informasi di bidang molekular disebut bioinformatika yang ditemukan pada pertengahan 1980an. Biologi molekular modern sebagai salah satu bagian di bidang bioinformatika ini tidak terlepas dari perkembangan biologi molekular modern, salah satunya peningkatan pemahaman manusia dalam bidang genomic yang terdapat dalam molekul DNA. Perkembangan teknologi DNA rekombinan (rDNA) memainkan peranan penting dalam lahimya bioinformatika Teknologi tersebut memunculkan pengetahuan baru dalam rekayasa genetika organisme yang dikenal dengan istilah biotechnology. Kemampuan para peneliti dan ilmuwan dalam memahami dan memanipulasi kode genetik DNA sangat didukung teknologi informasi melalui perkembangan hardware dan software yang berkaitan dengan produksi perangkat lunak.

Pangkalan data utama untuk sekuens asam nukleat dari Jepang adalah ....

• DDBJ

• EMBL

• GenBank

• UniProt

Answer explanation

Pangkalan data utama untuk sekuens asam nukleat di masa sekarang adalah DDBJ (DNA Data Bank of Japan) dari Jepang, EMBL (the European Molecular Biology Laboratory) untuk kawasan Eropa, dan GenBank dari Amerika Serikat Ketiga pangkalan data tersebut saling bekerja sama dan bertukar data harian guna menjaga keluasan cakupan masing-masing pangkalan data.

Skema rangkaian arsitektur memori pada komputer paralel berikut dinamakan ....

• workload memory

• shared memory

• down sizzing memory

• distributed memory

Answer explanation

Kelebihan dari arsitektur distributed memory adalah terjaganya skalabilitas ketika terjadi penambahan prosesor Sedangkan kekurangannya adalah programmer harus berurusan dengan detail komunikasi data antara prosesor dan memori nonlokal. Arsitektur jenis ini memiliki karakteristik di mana setiap prosesor memiliki memorinya masing- masing, sehingga eksekusi instruksi dapat berjalan secara independen antara satu prosesor dengan yang lain. Prosesor akan menggunakan jaringan ketika membutuhkan akses ke memori nonlokal. Akses ini sepenuhnya menjadi tanggung jawab penulis program.