Identification and Taxonomy of Actinomycetes

Define the characteristic of actinomycete bacteria

• Actinomycete bacteria are unicellular and primarily found in water.
• Actinomycete bacteria are anaerobic and do not produce antibiotics.
• Actinomycete bacteria are primarily gram-negative and harmful to plants.
• Actinomycete bacteria are filamentous, gram-positive, and important for soil ecology and antibiotic production.

List common environments in which these microbes can be found

• Outer space
• Mountains
• Deserts
• All are correct.

Describe the methodologies to classify these microbes

• Physical and chemical properties
• Historical and geographical classification
• Morphological, biochemical, genetic, and ecological classification.
• Cultural and environmental factors

Average nucleotide identity (ANI) / digital DNA-DNA Hybridization (DDH)

• ANI and DDH are methods for measuring genetic similarity between organisms.
• ANI and DDH are techniques for studying metabolic pathways.
• DDH is a method for analyzing RNA sequences.
• ANI is used for measuring protein structure similarity.

ข้อใดไม่ใช่คุณสมบัติที่บ่งบอกว่าเชื้อ actinomycetes ถูกจัดเป็นในกลุ่มแบคทีเรีย ไม่ใช่เชื้อรา

• Ribosome 70S

• Cell wall มี peptidoglycan

• Cell wall มี Chitin

• Filamentous ขนาด น้อยกว่า 2 ไมโครเมตร

ค่า cutoff ที่นิยมใช้ในการบ่งชี้ว่าจีโนมของสองสายพันธุ์อยู่ในชนิดเดียวกันคือข้อใด

• ANI ≥ 90%

• ANI ≥ 95–96%

• 16S rRNA similarity ≥ 90%

• dDDH ≥ 50%

ข้อใด ไม่ใช่ ลักษณะทางสัณฐานวิทยาที่ใช้ใน phenotypic analysis  

• สี aerial mycelium

• รูปร่างสปอร์และผิวสปอร์

• ค่า G+C content ของจีโนม

• สี pigment ที่เกิดใน medium

นักศึกษาพบ isolate หนึ่งที่ 16S rRNA similarity 98.5% และ ANI 94% กับ Streptomyces griseus การตีความที่ถูกต้องคือข้อใด  

• จัดเป็นสายพันธุ์เดียวกันแน่นอน

• เป็นชนิดใหม่ที่ต้องวิเคราะห์ต่อ

• ไม่ใช่แอคติโนมัยซีท

• ไม่มีข้อมูลพอที่จะสรุป

Whole-cell sugar pattern และ phospholipid profile เป็นตัวชี้วัดของอะไร  

• Genotypic analysis

• Phenotypic analysis

• Chemotypic analysis

• Growth tolerance

เส้นใยชนิดใดของ Streptomyces สร้างสปอร์และยกตัวขึ้นเหนือผิว medium

• Substrate hyphae

• Aerial hyphae

• Rhizoidal hyphae

• Vegetative hyphae