Konwersatorium

Szukając publikacji naukowej skorzystasz z bazy:

• arabidopsis.org (TAIR)

• Google Scholar

• PubMed

• Ensembl

Formatem, w którym zapisywane są sekwencje nukleotydowe oraz aminokwasowe jest:

• Fasta

• CSV

• Docx

• Pttx

Co to jest analiza BLAST?

• Sprawdzanie poziomu ekspresji danego genu

• Wyszukiwanie sekwencji homologicznych u innych gatunków

• Wyszukiwanie mutacji w regionie kodujących

• Sprawdzanie struktury potencjalnego białka

Co to jest sekwencja CDS?

• Sekwencja całego genu

• Sekwencja składająca się z egzonów

• Sekwencja składająca się z intronów

• Element regulatorowy

Bazą danych struktury białek nie jest:

• RCSB-PDB

• CATH

• EMBL-EBI

• ArrayExpress

Do baz danych sekwencji DNA można zaliczyć:

• clinVar

• dbSNP

• ArrayExpress

• CATH

Specyficzną dla Arabidopsis bazą danych jest:

• EnsemblPlants

• TAIR

• Plant Express

Chcąc sprawdzić poziom ekspresji danego genu możesz skorzystać z bazy:

• GEO

• TAIR

• SIB (Swiss Model)

• ClinVar

Przyjmuje się, że aminokwasowe sekwencje homologiczne muszą mieć minimum ..... podobieństwa, aby uznać je za podobne

• 65%

• 40%

• 80%

• 90%

Poziom ekspresji genów możesz sprawdzić za pomocą:

• Sekwencjonowania transkryptomu

• Sekwencjonowania genomu

• qPCR

• Wszystkie odpowiedzi są poprawne