MGMP Biologi Asniar, Linda, Riama dan Indah

Di samping ini ditampilkan data pengamatan level ekspresi gen GFP dari pustaka mutan berdasarkan perbedaan karakter codon adaptation index (CAI) dan perubahan energi bebas (ΔG) pembentukan struktur sekunder daerah 10 kodon awal. Semakin tinggi nilai CAI, semakin tinggi komposisi codon usage bias dari mutan tersebut

• Variasi level ekspresi gen tidak dipengaruhi oleh karakter CAI dari daerah N-terminal

• Kodon-kodon langka kemungkinan memiliki preferensi basa A/T pada daerah kodon wobble nya

• Kehadiran struktur sekunder di daerah N-terminal menurunkan level ekspresi gen

• Mutan-mutan dengan level ekspresi GFP yang rendah kemungkinan memiliki daerah N-terminal yang kaya akan basa G/C

• Semakin tinggi nilai CAI suatu mutan, semakin besar perbedaan komposisi basa Nterminal mutan tersebut dengan komposisi basa pada wild type

Sejumlah bakteri diketahui memiliki kemampuan untuk melakukan N-Glikosilasi pada protein yang sebelumnya dipercaya hanya dapat dilakukan oleh eukarya. Adapun enzim yang bertanggung jawab untuk mengkatalisis reaksi tersebut pada bakteri adalah PglB, suatu oligosaccharyl transferase, yang memasangkan substrat oligosakarida ke asam amino aspargin protein target. Namun tidak seperti enzim oligosaccharyl transferase pada Eukarya, PglB mengenali motif daerah glikosilasi yang berbeda pada protein targetnya (D/E-X-N-X-S/T pada PglB, N-X-S/T pada oligosaccharyltransferase eukarya).

Di samping ini ditampilkan hasil analisis homologi daerah substrate-binding pocket protein oligosaccharyl transferase dari kedua kelompok organsisme. Data ini dijadikan sebagai referensi studi awal untuk mengidentifikasi perbedaan mekanisme pengenalan substrat oleh enzim masing-masing kelompok organisme.

Tentukanlah mana pernyataan di bawah ini yang tepat terkait glikosilasi protein pada kedua kelompok organisme di atas

• Oligosaccharyl transferase kedua kelompok organisme tersebut memiliki struktur primer protein yang sama

• Asam amino/motif lestari yang ditemukan pada oligotransferase kedua kelompok organisme kemungkinan memiliki fungsi kunci yang berbeda dalam mendukung aktivitas enzim tersebut

• Glikosilasi protein pada bakteri kemungkinan terjadi di daerah organel sebagaimana yang terjadi pada eukarya

• Oligosaccharyl transferase pada kedua kelompok organisme memiliki motif lestarinya masing-masing yang kemungkinan berperan besar dalam menentukan spesifisitas substrat enzim tersebut

• Glikoprotein umumnya ditemukan pada protein-protein yang berfungsi di sitosol

Suatu pot berisi tanaman disirami air dan pot tersebut dibungkus dengan kantong plastik dan disegel pada bagian pangkal batang untuk mencegah kebocoran (lihat gambar). Pot tanaman diletakkan di tempat terbuka di bawah pencahayaan alami. Tumbuhan ditimbang tanpa bungkus plastik pada jam 9 pagi dan jam 4 sore. Selama selang waktu tersebut, bobot segar tanaman berkurang 32 gram

Manakah kesimpulan berikut ini yang TIDAK tepat berdasarkan hasil percobaan di atas?

• Laju transpirasi tanaman tersebut adalah sekitar 4,6 g air per jam

• Hasil yang sama akan diperoleh pada percobaan yang dilakukan di tempat terang dan di tempat gelap

• Penyiraman tanaman dengan air bertujuan untuk memastikan tersedianya sumber air

• Penutupan pot dengan kantong plastik berguna untuk mencegah difusi karbon dioksida dari lingkungan

• Jawaban A dan C

Data di bawah ini menunjukan pertumbuhan mikroba ketika dua tikus mutan dan tikus normal di suntik dengan mikroba pathogen. Mutan I mengalami mutasi yang menyebabkan endosom dan lisosom pada sel makrofag tidak dapat berfusi. Mutant II mengalami mutase pada gen-gen yang terlibat pada pembentukan antibody sehingga di dalam darahnya tidak di temukan sel B

Berdasarkan keterangan tersebut, kurva yang menunjukan pertumbuhan mikroba pada tikus mutan I, mutant II dan tikus normal secara berturut-turut adalah……

• X-Y-Z

• Y-X-Z

• Y-Z-X

• Z-X-Y

• X-Z-Y

Warna bulu pada mamalia dikendalikan oleh reseptor hormon yang disebut oleh reseptor melanocortin. Ketika reseptor ini berikatan dengan hormon MSH, sel-sel pigmen memproduksi eumelanin yang berwarna gelap. Ketika reseptor ini berikatan dengan antagonis MSH yang mencegah pengikatan MSH, sel-sel pigmen menghasilkan pheomelanin yang berwarna kuning/merah. Pada suatu hewan mamalia, warna bulu yang berwarna merah dapat disebabkan mutasi pada

• Reseptor yang mencegah pengikatan dari antagonis pada reseptor tersebut

• Reseptor yang mencegah MSH berikatan dengan reseptor

• Protein MSH sehingga protein ini dapat lebih efisien berikatan dengan reseptor

• Antagonis sehingga tidak dapat berikatan dengan reseptor

• Tidak ada jawaban yang benar

Seorang laki-laki dan wanita dengan penglihatan normal menikah dan memiliki 4 orang anak. Frekuensi alel buta warna pada laki-laki dari populasi kedua pasangan tersebut yaitu 0.40. Kemungkinan anak pertama dari pasangan tersebut menderita buta warna adalah

• 0.500

• 0.285

• 0.250

• 0.240

• 0.165

Seorang peneliti bernama Mr. Strange memperkirakan bahwa pada silsilah tersebut terdapat individu yang memiliki genotip untuk penyakit tersebut tapi tidak mengekspresikannya. Jika individu dari kiri ke kanan dinotasikan dengan angka arab, kemungkinan individu yang memiliki genotip penyakit tapi tidak mengekspresikannya adalah

• I-1

• I-2

• II-1

• II-4

• III-9

Jane mengisolasi RNA total pada sel yang diambil dari dua jaringan yang berbeda yaitu jaringan A dan B. Sampel RNA tersebut kemudian dilakukan Northern Blotting menggunakan probe berukuran 20 bp. Sampel A menghasilkan band berukuran 8 kb, sedangkan sampel B berukuran 5 kb. Protein tertentu yang berkaitan dengan RNA tersebut kemudian diisolasi dan dianalisis menggunakan SDS-PAGE. Hasilnya sampel A menunjukkan band yang bermigrasi lebih jauh dibandingkan sampel B. Berdasarkan penelitian tersebut kesimpulan berikut ini yang paling dapat menjelaskan hal tersebut adalah

• RNA dari kedua sampel memiliki urutan yang sama setidaknya sebanyak 30%

• Sampel A kemungkinan memiliki DNA yang termutasi

• Lebih banyak segmen yang tidak ditranslasikan pada sampel A daripada sampel B

• Sampel B kemungkinan memiliki protein dengan quartenary structure

• Fenomena tersebut merupakan akibat dari frameshift mutation

Sebuah peternakan di Neverland memelihara kelinci dalam jumlah yang banyak selama bertahun-tahun. Tahun ini, peternakan tersebut memiliki 500 ekor kelinci berwarna hitam dan putih. Seorang pembeli akan membeli kelinci dari peternakan tersebut tahun depan. Namun, pembeli tersebut hanya menginginkan anakan sebanyak 800 ekor dengan warna hitam semua. Peternak tersebut terpaksa membuang 21 ekor kelinci yang berwarna putih sehingga didalam kandang hanya tinggal kelinci berwarna hitam semua. Untuk membantu memenuhi pesanan, peternakan tersebut membeli kelinci hitam dari Wonderland sebanyak 321 ekor. Kelinci hitam Wonderland tersebut dihasilkan dari perkawinan indukan putih dan hitam galur murni. Jika warna ditentukan oleh satu gen dan perkawinan terjadi secara acak, maka perkiraan keturunan pada generasi berikutnya adalah

• Semua berwarna hitam

• Semua berwarna putih

• Warna hitam dan warna putih dalam jumlah yang sama

• Warna hitam lebih banyak daripada warna putih

• Warna hitam lebih sedikit daripada warna putih

Perhatikan pedigree berikut ini

Pedigree tersebut menunjukkan pola penurunan suatu penyakit. Warna gelap menunjukkan individu yang mengekspresikan penyakit tersebut. Selain itu, pada pedigree tersebut juga terdapat data mengenai lokus SNP yang memiliki alel 1 dan 2. Alel yang dimiliki oleh masing-masing individu ditunjukkan pada bagian bawah simbol. Berdasarkan keterangan tersebut, berikut ini pernyataan yang berkaitan dengan hubungan antara lokus SNP dan alel penyakt adalah...

• Gen penyebab penyakit dan lokus SNP terpaut dengan jarak kurang dari 25 cM

• Alel penyakit berada di kromosom yang sama dengan alel SNP 1 pada semua generasi

• Terjadi pindah silang pada laki-laki yang merupakan keturunan pada generasi kedua

• Rekombinasi hanya terjadi satu kali selama 4 generasi pada pedigree tersebut

• Kedua sifat tersebut tidak terpaut sama sekali