Molekularna biologija - doktorski

Katera trditev glede izražanja (ekspresije) genov NE drži (trije pravilni odgovori)

• velika večina genov se izraža v vseh tipih celic in v vseh tkivih
• znaten delež genov se izraža samo v procesu embrionalnega razvoja in ti geni pri odraslem organizmu niso več transkripcijsko aktivni
• celica spremeni repertoar izraženih genov kot odgovor na vplive iz okolja
• izražanje hišnih genov je omejeno na mitohondrije
• za vsak gen je značilno, da se ves čas izraža z značilno konstantno intenziteto

Kaj pomeni, da so genetske kompleksne bolezni multifaktorske in poligenske?

• da so možne komplikacije, ki nastanejo pri zdravljenju določene bolezni odvisne od števila okvarjenih genov
• da bolezen nastane zaradi mutacij v poligenskih kompleksih
• da bolezen nastane zaradi mutacije v večih genih, ki kodirajo za rastne faktorje
• da bolezen nastane kot seštevek dejavnikov okolja in delovanja večih genov

Za kvantitativno analizo izražanja genov je pomembno

• da izoliramo DNA iz tkiva in celic, v katerih želimo izmeriti izražanje genov
• da izoliramo DNA iz katerihkoli celic, saj so geni v vseh celicah enaki
• da izoliramo kompletno RNA ali mRNA iz tkiva in celic, v katerih želimo izmeriti izražanje genov
• da izoliramo kompletno RNA ali mRNA iz katerihkoli celic, saj so geni v vseh celicah enaki
• da izoliramo rRNA ali tRNA iz katerihkoli celic, saj so geni v vseh celicah enaki

Opravili smo biopsijo črevesne sluznice in kolenskega sklepa in iz pridobljenih celic izolirali RNA. Pripravili smo 2 cDNA knjižnici, eno iz RNA izolirano iz celic črevesne sluznice in drugo iz RNA izolirano iz celic hrustanca kolenskega sklepa. Katera trditev JE pravilna?

• v obeh cDNA knjižnicah bodo prisotne sekvence vseh človeških genov, saj je v vseh celica posameznega človeka prisotna identična DNA.
• v cDNA knjižnici črevesne sluznice bodo zastopane sekvence vseh genov, saj v črevesnih celicah poteka intenzivni metabolizem, medtem ko bodo v cDNA knjižnici kolenskega sklepa zastopane samo sekvence posamičnih genov, saj v celicah hrustance ne poteka aktivni metabolizem
• v cDNA knjižnici so zastopane samo sekvence odsekov DNA, ki se ne prepišejo (nekodirajoča DNA), medtem, ko najdemo sekvence genov samo v genomskih knjižnicah
• v cDNA knjižnici črevesne sluznice bodo zastopane sekvence vseh genov, ki se izražajo v črevesnih celicah
• v cDNA knjižnici črevesne sluznice bodo zastopane samo sekvence genov, ki se izražajo v črevesnih celicah in ki so se aktivno izražali v trenutku, ko smo opravili biopsijo

Kaj je transkriptom?

• proteinski kompleks, ki sodeluje v procesu transkripcije
• nabor vseh mRNA prisotnih v celici v določenem trenutku
• napaka pri transkripciji

• stopnja v procesu transkripcije
• encim, ki sodeluje v sintezi proteina

Mutacija v katerih genih najverjetneje ne bo pomembno prispevala k nastanku raka?

• genih popravljalnih mehanizmov
• genih za regulacijo apoptoze
• genih za metabolne encime
• genih vključenih v signalno transdukcijo

• genih za receptorje rastnih faktorjev

Metilacija DNA

• spremeni zaporedje nukleotidov v DNA in če je ta sprememba v genu tudi nastanek drugačnega proteina
• vpliva na izražanje gena, če je metiliran gvanin v CpG otočku v promotorju tega gena
• sodeluje pri inaktivaciji X kromosoma
• je ireverzibilen proces, torej odstranitev metilne skupine ni možno
• se odstrani v procesu mitoze

V čem se miRNA razlikuje od siRNA

• zrela miRNA nastane s procesiranjem dsRNA
• pri procesiranju sodeluje encim RNAza III (dicer), ki cepi RNA na kratko RNA dolgo cca 22 bp

• se specifično veže na tarčno mRNA
• celica jo uporablja predvsem za regulacijo lastnih genov
• pri aktivaciji in vezavi na tarčno mRNA pomaga kompleks RISC

ZA Diagram Manhattan velja da

• vsaka točka v diagramu predstavlja enega bolnika
• prikazuje negativni log p vrednosti za povezavo vsakega posameznega polimorfizma SNP z boleznijo
• prikazuje rezultate analize genetske vezave (LOD score vrednosti) s katero ugotavljamo povezavo posameznega genetskega markerja z bolezenskim genom
• prikazuje rezultate sekvenciranja NGS s katerim ugotavljamo redke mutacije za monogenske bolezni
• prikazuje za vsak polimorfizem SNP njegovo alelno frekvenco v skupini bolnikov

Kaj pomeni v genetskih študijah kratica GWAS

• asociacijska študija v celotnem genomu
• analiza genetske vezave
• sekvenciranje naslednje generacije
• sekvenciranje celotnega genoma
• sekvenciranje celotnega eksoma