Responsi Bioteknologi

Program ini bekerja dengan mencari homologi terbesar antara sekuens yang dimiliki dengan sekuens di database. Program apa yang dimaksud?

• BioEdit
• BLAST
• FASTA
• Mega11

Pengertian DNA yang tepat adalah

• Deoxyribbonucleic Acid yang berperan dalam mengkode protein pada makhluk hidup
• Ribbonucleic Acid yang berperan dalam sintesis protein pada makhluk hidup
• Deoxyribbonucleic yang tersusun atas asam nukleat
• Deoxyribbonucleic Acid yang tersusun atas asam amino yang dapat mengkode protein pada makhluk hidup

Sekuensing DNA merupakan metode yang digunakan untuk menentukan urutan...

• Adenin, Sitosin, Guanin, Timin
• Sitosin, Timin, Arginin, Guanin
• Sitosin, Urasil, Guanin, Adenin
• Arginin, Sitosin, Timin, Adenin

Mengapa sekuensing dua arah perlu dilakukan

• Agar spesies dapat ditentukan secara langsung
• Untuk meminimalisir kesalahan dalam proses sekuensing
• Agar proses sekuensing lebih singkat
• Untuk menentukan keluarga dari spesies DNA yang diperoleh

Sekuensing menggunakan primer dua arah (Forward and Reverse primers) dapat meminimalisasi kemungkinan kesalahan dalam proses sekuensing. Kedua hasil sekuensing tersebut selanjutnya dapat digabungkan untuk mendapatkan sebuah gen utuh, proses menyamakan posisi sekuens untuk analisis disebut....

• Forward primer
• Contig
• Alignment
• Reverse primer

Fungsi dari penggunaan software BLAST adalah, kecuali

• Identifikasi organisme
• Menemukan homolog dari sekuen tertentu
• Analisis dan manipulasi sekuens DNA, RNA dan protein
• Anotasi gen

Apa spesies yang diperoleh pada saat praktikum?

• Orchobacterium
• Diplococcus
• Bacillus
• E. Coli

Langkah yang dilakukan untuk membalik arah sekuen reverse menjadi komplementer, sehingga dapat disejajarkan secara biologis dengan sekuen forward yaitu....

• Pairwise alignment
• Reverse complement
• Compute pairwise distance
• Multiple sequence alignment

Nilai dugaan yang memberikan ukuran statistikyang signifikan terhadap kedua sequence

• Score
• Query coverage
• E value
• Max identity

Ukuran numerik dari kekuatan kecocokan (alignment) antara sekuens query dan sekuen target

• Accession number
• Score
• Query coverage
• Max identity