02 Jenis-jenis PCR

Seorang ATLM sedang memeriksa dugaan infeksi virus HPV menggunakan teknik PCR yang dapat mendeteksi banyak tipe virus sekaligus dalam satu reaksi. Manakah jenis PCR yang paling tepat digunakan?

• Nested PCR

• Real-Time PCR

• Multiplex PCR

• RT-PCR

• Touchdown PCR

ATLM melakukan PCR untuk mendeteksi mutasi gen BRCA1 pada pasien kanker payudara. Untuk meningkatkan sensitivitas dan spesifisitas, digunakan dua pasang primer yang bekerja secara berurutan. Jenis PCR yang digunakan adalah:

• Conventional PCR

• Nested PCR

• Real-Time PCR

• Digital PCR

• Multiplex PCR

Seorang ATLM melakukan deteksi ekspresi gen mRNA dari virus dengue dalam darah pasien. Sebelum PCR dilakukan, RNA harus diubah menjadi cDNA. Jenis PCR yang digunakan adalah:

• Nested PCR

• RT-PCR

• qPCR

• Touchdown PCR

• Digital PCR

Dalam laboratorium biologi molekuler, ATLM sedang mengamati amplifikasi DNA secara kuantitatif dalam waktu nyata dengan bantuan pewarna fluoresen SYBR Green. Jenis PCR yang sedang dilakukan adalah:

• RT-PCR

• Multiplex PCR

• Conventional PCR

• Real-Time PCR

• Nested PCR

ATLM mendeteksi jumlah salinan gen target dalam sampel pasien dengan teknik PCR yang dapat menghitung molekul DNA secara absolut dan membagi reaksi ke dalam ribuan partisi kecil. Jenis PCR ini dikenal sebagai:

• Digital PCR

• Real-Time PCR

• RT-PCR

• Touchdown PCR

• Multiplex PCR

Dalam pengujian ketahanan antibiotik bakteri, ATLM menggunakan PCR yang dapat mengamplifikasi lebih dari satu gen resisten dalam satu tabung. Jenis PCR yang tepat digunakan adalah:

• Real-Time PCR

• Multiplex PCR

• RT-PCR

• Touchdown PCR

• Digital PCR

Seorang ATLM mengalami kendala dalam proses PCR karena hasil amplifikasi tidak spesifik. Ia lalu menggunakan metode PCR yang menurunkan suhu annealing secara bertahap. Jenis PCR tersebut adalah:

• Real-Time PCR

• Nested PCR

• Touchdown PCR

• Digital PCR

• RT-PCR

ATLM sedang mengerjakan pemeriksaan ekspresi gen pada pasien kanker dengan metode kuantitatif berbasis cDNA. Ia menggunakan probe khusus yang dapat mendeteksi satu gen target. Jenis PCR yang digunakan adalah:

• Conventional PCR

• Digital PCR

• RT-qPCR

• Multiplex PCR

• Touchdown PCR

Dalam pemeriksaan SARS-CoV-2, ATLM menggunakan PCR yang mendeteksi RNA virus dan hasilnya bisa diketahui secara kuantitatif dalam waktu nyata. Jenis PCR tersebut adalah:

• RT-qPCR

• Nested PCR

• Multiplex PCR

• Touchdown PCR

• Digital PCR

ATLM ingin memastikan hasil amplifikasi hanya berasal dari target yang benar, bukan dari DNA kontaminan. Ia menggunakan dua putaran PCR dengan primer internal. Jenis PCR yang digunakan adalah:

• Multiplex PCR

• RT-PCR

• Nested PCR

• qPCR

• Touchdown PCR