Quiz Teknologi Sekuensing

Teknologi sekuensing generasi pertama yang dikembangkan oleh Fredrick Sanger dikenal dengan sebutan …

• Maxam-Gilbert Sequencing

• Illumina Sequencing

• Sanger Chain Termination Method

• Nanopore Sequencing

• Pyrosequencing

Metode Ion Torrent pada second-generation sequencing mendeteksi …

• Fluoresensi pewarna

• Pelepasan pyrophosphate

• Pelepasan ion hidrogen (H⁺)

• Hamburan cahaya

• Arus listrik nanopore

Platform Roche 454 menggunakan prinsip …

• Sequencing by ligation

• Pyrosequencing

• Real-time sequencing

• Nanopore detection

• Chain termination

Teknologi third-generation sequencing yang menggunakan SMRT (Single Molecule Real-Time) adalah …

• Illumina

• Ion Torrent

• SOLiD

• PacBio

• 454 Pyrosequencing

Oxford Nanopore sequencing mendeteksi urutan DNA berdasarkan …

• Warna fluorofor

• Perubahan arus listrik saat DNA melewati nanopore

• Pelepasan pirofosfat

• Enzim ligase

• PCR berulang

Keunggulan utama teknologi third-generation sequencing dibanding generasi sebelumnya adalah …

• Membaca fragmen DNA pendek

• Membutuhkan PCR untuk amplifikasi

• Memberikan long-read sequencing

• Lebih mahal daripada semua metode

• Tidak memerlukan bioinformatika

Whole-genome sequencing (WGS) bertujuan untuk …

• Membaca hanya gen yang diekspresikan

• Mendeteksi protein pada jaringan

• Menentukan seluruh urutan DNA dalam genom

• Mengukur metilasi DNA

• Membaca RNA saja

Whole-exome sequencing (WES) hanya fokus pada …

• Genom non-koding

• RNA dan cDNA

• Ekson (protein coding region)

• Genom mikroba

• Promotor

Targeted sequencing banyak digunakan untuk …

• Menentukan epigenom

• Membaca seluruh genom

• Menganalisis gen tertentu terkait penyakit

• Menyusun ulang genom baru

• Analisis proteom

Salah satu aplikasi penting NGS dalam penelitian mikrobioma adalah …

• Analisis keanekaragaman bakteri usus

• Identifikasi struktur protein

• Prediksi fenotipe manusia

• CRISPR gene editing

• Uji toksikologi