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Bioinformática II: Teórico 2

Total questions: 12

Worksheet time: 12mins

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1.

Un read es

a)

Un fragmento de ADN que se genera durante la preparación de la librería

b)

Una secuencia de ADN que fue "leída" por el secuenciador

c)

Una secuencia de ADN que encuentro en la base de datos de PubMed

2.

Un read PE corresponde a:

a)

Un par de reads que son leídos por el secuenciador a partir del mismo fragmento de ADN

b)

Un par de reads que son leídos por el secuenciador a partir de diferentes fragmentos de ADN

c)

Un read que es leído por el secuenciador

3.

Un read SE corresponde a:

a)

Un read de Segunda Edición

b)

Un read leído desde un extremo de un fragmento de ADN

c)

Un read leído desde ambos extremos de un fragmento de ADN

4.

El término "Base calling" se refiere a:

a)

La traducción de la señal captada por el detector en el secuenciador a la base correspondiente

b)

La búsqueda de variantes en una secuencia de ADN

c)

Un método de secuenciación masiva

5.

La calidad de una base se reporta como:

a)

Q-score

b)

P-score

c)

p-valor

6.

Mapeo se refiere a:

a)

La búsqueda de genes en el ADN

b)

El "matcheo" de reads contra una secuencia de referencia

c)

El "matcheo" de reads contra reads

7.

El "matcheo" de reads solapantes genera:

a)

super reads

b)

contigs

c)

scaffolds

8.

Los archivos SRA

a)

Contienen secuencia y calidad

b)

Contienen sólo secuencia

c)

Contienen sólo calidad

9.

La calidad de las secuencias

a)

Se reporta en un archivo .fasta

b)

Se reporta en un archivo .fastq

10.

La calidad en un archivo fastq

a)

Se reporta como un valor numérico para cada base

b)

Se reporta como un valor alfabético para cada base

c)

Se reporta como un carácter ASCII para cada base

11.

Ensamblado de novo se refiere a

a)

"matchear" reads contra una referencia para generar mapeos

b)

"matchear" reads contra reads para generar mapeos

c)

"matchear" reads contra reads para generar contigs

12.

Si una secuencia de 1000 bases tiene 1 base errónea, su Q-score es:

a)

20

b)

30

c)

40

d)

50