NEW
Font size
WorksheetsPretest - Analisis Filogenetika I
Total questions: 10
Worksheet time: 8mins
1. Sekuens-sekuens molekuer yang digunakan dalam konstruksi filogenetika memiliki asal-usul bersama (common origin) dan kemudian berpisah sepanjang waktu evolusi. Sekuens molekuler tersebut disebut bersifat...
Homolog
Analog
Ortholog
Heterolog
2. Pada pohon filogeni spesies, titik percabangan pada nodus internal mewakili peristiwa _______, sedangkan pada pohon filogeni gen nodus internal menunjukkan peristiwa _______.
Evolusi, duplikasi gen
Spesiasi, mutasi gen
Evolusi, mutasi gen
Spesiasi, duplikasi gen
3. Urutkanlah pekerjaan diatas ini hingga menjadi prosedur berurutan dalam pembuatan pohon filogenetik!
B, C, A, E, D
C, B, E, A, D
E, A, B, C, D
A, B, C, D, E
4. Pilihlah pernyataan yang benar mengenai pemilihan penanda molekuler dalam pembuatan pohon filogeni!
Untuk mempelajari organisme yang berkerabat dekat digunakan sekuens nukleotida, sedangkan untuk kelompok organisme yang jauh lebih divergent digunakan sekuens rRNA atau protein.
Pada banyak kasus, sekuens protein tidak lebih baik dibandingkan sekuens nukleotida karena sekuens nukleotida relatif lebih terkonservasi.
Sekuens nukleotida memungkinkan alignment yang lebih sensitif daripada sekuens protein karena sekuens nukleotida memiliki 4 karakter, sedangkan sekuens protein memiliki 20 karakter.
Sekuens protein kadang-kadang lebih bias daripada sekuens DNA oleh karena penggunaan kodon bias pada organisme berbeda.
5. Lengkapilah tabel di atas ini!
(A) Maximum Parsimony, (B) Neighbor-Joining, (C) Minimum Evolution
(A) Neighbor-Joining, (B) Maximum Parsimony, (C) Minimum Evolution
(A) Minimum Evolution, (B) Neighbor-Joining, (C) Maximum Parsimony
(A) Neighbor-Joining, (B) Minimum Evolution, (D) Maximum Parsimony
6. Pilihlah pernyataan yang benar mengenai pohon filogenetik!
Pohon filogenetik adalah fakta definitif, bukan hipotesis.
Merotasikan pohon pada nodus internal akan merubah informasi yang ditampilkan pohon.
Pohon filogenetik dapat dibuat dari data morfologi, anatomi, jalur biokimia, sekuens DNA dan protein, dan karakteristik fosil.
Jukes-Cantor dan Kimura Two-Parameter Model adalah metode-metode untuk mengevaluasi reliabilitas pohon filogenetik.
Tentukanlah apakah pernyataan mengenai filogenetika berikut adalah benar atau salah!
7. Cladogram menampilkan informasi mengenai hubungan kekerabatan dan laju evolusi dari beberapa spesies, sedangkan Phylogram menampilkan informasi mengenai hubungan kekerabatan tanpa dapat diketahui laju evolusi antar spesies.
Benar
Salah
Pernyataan dibawah ini Benar atau Salah?
8. Pemilihan marker molekuler yang tepat sangat penting dalam pembuatan pohon filogenetik. Marker berupa sekuen DNA yang conserve dapat digunakan untuk menganalisis laju evolusi antar spesies dalam kelompok familia yang sama, sedangkan marker berupa sekuen DNA yang variatif (noncoding regions) dapat digunakan untuk menganalisis laju evolusi antar spesies dalam tingkatan taksa tertinggi, seperti pada kingdom.
Benar
Salah
Pernyataan dibawah ini Benar atau Salah?
9. Berdasarkan hipotesis molekular clock, dimana sekuen molekular diasumsikan berevolusi dengan laju konstan, maka panjang branch dari suatu spesies pada pohon filogenetik dapat digunakan untuk mengestimasi laju dan waktu evolusinya.
Benar
Salah
Pernyataan dibawah ini Benar atau Salah?
10. Salah satu tahap yang dilakukan dalam pembuatan pohon filogenetik adalah Multiple Sequence Alignment. Keberadaan daerah gaps pada hasil alignment memperlihatkan adanya mutasi pada sequence tersebut, sehingga mempertahankan gap di daerah tertentu pada hasil alignment untuk kemudian dianalisis guna membentuk pohon filogenetik adalah tepat karena daerah gaps pada setiap spesies berbeda/ unik sehingga dapat digunakan untuk mengidentifikasi subgroup antar spesies yang dianalisis.
Benar
Salah
