NEW
Font size
WorksheetsPrediksi Gen dan promoter
Total questions: 13
Worksheet time: 13mins
Terdapat tiga metode untuk melakukan prediksi gen. Salah satu metode dengan prinsip memprediksi gen berdasarkan struktur sekuen DNA-nya saja, yaitu dengan mendeteksi sinyal gen (start dan stop codon, intron splice, TF, RBS, dan situs poli-A) dan coding region gen tersebut. Metode ini disebut ...
Ab initio-based
homology-based
consensus-based
Eukariot (sebagian besar kelompok vertebrata) menggunakan start kodon translasi berupa sekuen ATG dan memiliki conserve sequence CCGCCATGG. Sekuen ini disebut …
Shine-Delgarno sequence
Ribosomal binding site
Kozak sequence
CpG Island
Struktur umum gen eukariot ialah transcription start, ribosomal binding site (Shine-Delgarno sequence), 5’ UTR, start codon, exon, stop codon, 3’ UTR, poly-A signal. Apakah pernyataan tersebut benar/salah?
Benar
Salah
Untuk melakukan prediksi dan analisis gen, diperlukan pengetahuan akan struktur suatu gen. Namun, terdapat perbedaan struktur antara gen Prokariot dan Eukariot. Struktur umum gen Prokariot ialah ...
Start codon merupakan salah satu bagian penting dalam analisis struktur gen. Pada bakteri sering kali ditemukan start codon dengan urutan seperti dibawah ini, kecuali …
GTG
ATG
TAG
TTG
RNA polymerase merupakan komplek subunit enzim yang berperan pada proses transkripsi DNA menjadi RNA. RNA Polymerase yang berperan di dalam proses transkripsi tRNA adalah …
RNA Polymerase I
RNA Polymerase II
RNA Polymerase III
RNA Polymerase V
Transkripsi merupakan suatu proses transkrip DNA menjadi RNA yang diinisiasi oleh RNA Polymerase. Berikut yang merupakan skema proses inisiasi transkripsi yang terjadi pada eukariot adalah
Promoter merupakan elemen DNA yang dikenali oleh DNA polymerase dan faktor-faktor transkripsi untuk dimulainya proses ekspresi gen. Prokariot maupun Eukariot memiliki struktur gen yang dikendalikan oleh satu promoter pada setiap gen yang dimiliki.
Benar
Salah
Berikut yang merupakan program prediksi gen berbasis ab initio adalah...
FGENESH
EST2Genome
GENOMESCAN
DIGIT
TATA Box sering digunakan sebagai indicator keberadaan promoter karena TATA Box merupakan tempat dimulainya proses transkripsi
Benar
Salah
Prediksi gen menggunakan metode Homology-based mengacu pada similaritas sekuen yang dimiliki dengan gen yang telah ada pada database. Website yang tidak digunakan untuk prediksi gen metode homology based adalah
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
http://www.softberry.com
http://www.ebi.ac.uk/Tools/Wise2/
Pada sel prokariot dikanel kelompok gen yang disebut operon. Dengan adanya system ini, pada prokariot mRNA hasil transkripsi bersifat ...
monosistronik
polisistronik
Berikut merupakan prediksi struktur gen sekuen Homo sapiens beta globin yang dihasilkan menggunakan FGENESH. Ada berapa coding sequence yang dihasilkan berdasarkan prediksi tersebut?
TSS: Position of transcription start; CDS: coding sequence; polA: poli A tail (AAA…..)
2
3
4
5
