NEW
Font size
WorksheetsMODUL 7 ANOTASI GENOM DAN ONTOLOGI GEN
Total questions: 12
Worksheet time: 7mins
Anotasi genom merupakan salah satu proses penting dalam studi genomik. Anotasi genom adalah proses identifikasi dan penentuan lokasi gen dari sekuen mentah DNA, kemudian dilakukan penamaan dan karakterisasi fungsi gen tersebut. Apakah pernyataan benar atau salah?
Benar
Salah
Anotasi untuk hypothetical protein dilakukan terhadap sekuen genom sampel, yang fungsi -fungsi gennya tidak diketahui. Cara melakukan anotasi untuk hypothetical protein yaitu dengan pencarian homolog sekuen mRNA-nya dari database, serta prediksi dari struktur sekunder proteinnya. Apakah pernyataan tersebut benar atau salah?
Benar
Salah
Terdapat dua tahap dalam anotasi genom, yaitu :
prediksi gen dan penentuan fungsi gen
prediksi struktur gen dan penentuan similaritas sekuen proteinnya
eksperimen laboratorium dan input data hasil eksperimen tersebut
prediksi iekson-intron dan penentuan alternative splicing
penentuan produk gen dan lokasi gen tersebut dalam sel
Anotasi genom dilakukan setelah sekuensing seluruh genom dan sebelum penyatuan (assembly) sekuen-sekuen DNA tersebut. Apakah pernyataan tersebut benar atau salah?
Benar
Salah
Automated genome annotation (anotasi genom secara otomatis) dilakukan terhadap genom yang fungsi gennya tidak dapat diketahui dan proses anotasinya berjalan dengan sangat lambat. Apakah pernyataan tersebut benar atau salah?
Benar
Salah
Which of the following is incorrect regarding genome economy?
It is phenomenon of synthesizing more proteins from few genes
this is the major strategy that eukaryotic organisms use to achieve a myriad of phenotypic organisms
there are nomerous underlying genetic mechanisms to help account for genome economy
This is a major strategy that eukaryotic organism use to achieve a myriad of genotypic diversities only
Which of the following is incorrect regarding GeneQuiz?
It is a web server for protein DNA annotation
It is web server for protein sequence annotation
It compare a query sequence against databases using BLAST and FASTA to identify homologs with high similarities
It performs domain analysis using the PROSITEand Blocks databases
Conserved functional sites can be identified by profile and hidden Markov model-based motif and domain search tools such as SMART and InterPro.
True
False
Which of the following is incorrect regarding gene ontology?
It facilities grouping of proteins of related functions
It provides consistency in describing overall proteins functions
There is no standardization of associated pathways
There is standardization of the names and activities
Tiga set informasi yang disediakan oleh gen ontologi (GO) ialah proses biologis, komponen seluler, dan fungsi molekuler. Tiap set informasi tersebut memiliki kosa kata yang unik, namun tidak saling tumpang tindih agar terdapat standarisasi untuk penamaan gen. Apakah pernyataan tersebut benar atau salah?
Benar
Salah
In some circumstances, one mRNA transcripts can lead to the translational of more than one protein.
True
False
which of the following is incorrect regarding gene annotation?
The genome annotation of the human genome employ's combination of the theoretical prediction and experimental verification
Genes structures are first predicted by ab initio exon prediction programs
The predicted genes are compared with experimentally determined cDNA and EST sequences
The cellular components are described using limited vocabulary
