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Worksheetsomics
Total questions: 26
Worksheet time: 25mins
¿Qué es GWAS?
Son estudios longitudinales de colecta de datos clínicos
Son estudios de asociación de variantes genéticas
Un Sofware de Bioinformática, ampliamente usado en genomica
Son revisiones sistemáticas de estudios epidemiológicos
Cual es la diferencia entre GWAS convencional y Mapeado fino
Encontrar variantes genéticas en la población general
Reemplazar los estudios con modelos animales.
Encontrar variantes en el grupo de casos que se puedan considerar causales
Estudiar los controles sanos
¿En qué tipo de Array se ocupa ADNc?
De dos canales
De oligonucleotidos
De CGh
¿ Que tipo de Array no se basa en hibridacion competitiva?
De CGh
De oligonucleotidos
De SNPs
¿ Que es un microarray?
Un formato experimental
Un chip de ADN
Una superficie sólida
Si uno quiere secuenciar una muestra para poder obtener una mejor información de transcrito, qué secuenciador utilizaría?
Sanger
NGS
Pacific BioSciences
Nanopore tech
todas las anteriores
Si necesitamos secuenciar el genema de un organismo pero no queremos realizar el proceso de amplificación del material genético, qué técnica utilizaríamos? Seleccionar las alternativas correctas
Sanger
Solexa-Illumina
Pacific Biosciences
Nanopore tech
La técnica que nos permite secuenciar utilizando fragmentos largos de ADN o ARN al mismo tiempo
Sanger
Solexa-illumin
Pacific Biosciences
Nanopore tech
La técnica que nos permite realizar la secuenciación utilizando un detección de corriente y traslocación es
Sanger
Illumina
Pac-Bio
Nanopore tech
Para poder realizar un protocolo de metilación de ADN para epigenome, es necesario qué pasos'? Seleccionar las alternativas correctas
Metilación ADN
secuenciar todo el genoma sin metilar
secuenciar todo el genoma metilado
secuenciar el ADN metilado u islas CpG necesarias
En el RNA-seq que tipo de información se puede obtener. Seleccionar las alternativas correctas
Lecturas cortas y completas
Formación de Librerias que permite alinear con el genoma de referencia
solo expresión de transcritos codificables
expresión de transcritos codificables y no codificables
Definición de Microbioma
Comunidad de microorganismos vivos residentes en un nicho ecológico determinado.
Conjunto formado por microorganismos, sus genes y sus metabolitos en un nicho ecológico dado. En el microbioma fecal humano se han identificado unos 9,9 millones de genes microbianos.
También llamado superorganismo, es la totalidad de organismos en un ecosistema dado (en nuestro caso, los seres humanos y el ecosistema microbiano compartidos).
La diferente entre Microbioma y Microbiota es (seleccione las alternativas correctas)
Microbioma se refiere al conjunto de genes que se encuentran en las comunidades de microorganismos que habiatan en un ecosistema u organismo.
Microbiota se refiere a las comunidades de microorganismos que ahbian en un ecosistema u organismo.
Microbiota se refiere a los microorganismos que se encuentran en un ecosistema definido, como intestio, piel, estómago, etc.
Microbioma se refiere a los microorganismos que se encuentran en un ecosistema definido, como intestio, piel, estómago, etc.
¿Cuáles son las características del estudio de
la metagenómica?. Seleccione todas
aquellas que apliquen.
Los datos se pueden archivar y recuperar de
nuevo más tarde para volver a analizarlos.
Los datos de secuenciación de ADN se pueden
proporcionar en un formato estandarizado.
Los datos de secuenciación de ADN se pueden
compartir entre laboratorios y disciplinas.
El ADN de una variedad de organismos (por
ejemplo, bacterias, hongos, parásitos, virus) en
una muestra se puede detectar
simultáneamente.
Es indispensable una buena recolección de muestra para el desarrollo de metagenómica?
Si
No
En qué puede afectar la colección y preservación de las muestras, señale todas las alternativas correctas
Calidad
Presición de los datos para analizar
Cantidad de material genético
No afecta
Cuales serían las claves para poder obtner un buen resultado en metagenómica, indique todas las alternativas correctas
Suficiente biomasa microbiano
Minimizar contaminación de las muestras
Validación de la colecta de muestras y almacenamiento de las mismas
Métodos de enrequesimiento, en caso de que sea necesario.
Una de las ventajas del WGAS en metagenómica son las siguientes. Seleccione todas las alternativas que considere correctas
Genera suficiente ADN para la secuenciación incluso a partir de pequeñas cantidades de material de partida.
Se puede aplicar directamente al ADN ambiental extraído.
Coloca los datos genómicos dentro de su contexto filogenético correcto
Puede amplificar el ADN de toda la gama de especies presentes en una muestra determinada
Ofrece medios de alto rendimiento para clasificar las celdas de interés.
La Tecnologías de captura de secuencias se caracteriza por
Usar sondas de oligonuclétidos para identificar especies de interes.
Es costoso
Puede lograr una mayor sensibilidad al enfocarse solo en especies de interés, particularmente cuando hay grandes cantidades de contaminación del hospedador
Puede fallar cuando los organismos diana varían en comparación con las secuencias de referencia utilizadas para diseñar las sondas
Todas las anteriores
¿De qué maneras el epigenoma marca el genoma?
Metilación del ADN
Modificación de histonas
Metilación del ADN y modificación de histonas
Ninguna de las anteriores
¿Cual de las ciencias ómicas aplica la técnica de micromatrices?
Proteómica
Metabolómica
Epigenómica
Transcriptómica
¿Qué son los ARNs de interferencia en el contexto de la epigenética?
Moléculas pequeñas de ARNs que pueden silenciar la expresión de los genes
Proteínas que regulan la transcripción del ADN
Complejos proteicos que activan la traducción del ARN
Enzimas que reparan el ARN dañado
¿Qué función tienen los mecanismos epigenéticos en la expresión génica?
Regulan la expresión de los genes sin alterar la secuencia de ADN
Modifican la secuencia de ADN para adaptarse al ambiente
Controlan la replicación del ADN en las células
Eliminan por completo la expresión de ciertos genes
¿Cuál de las siguientes metodologías de secuenciación se utiliza principalmente para estudiar las modificaciones epigenéticas en el ADN, como la metilación del ADN?
A) Secuenciación de ARN (RNA-seq)
B) Secuenciación de escopeta (Shotgun sequencing)
C) Secuenciación de bisulfito (Bisulfite sequencing)
D) Secuenciación de próxima generación (Next-generation sequencing) sin modificación adicional
¿Cuál es la técnica de secuenciación que utiliza la detección de corriente y traslocación?
Sanger
Illumina
Pac-Bio
Nanopore tech
¿Qué diferencia hay entre la secuenciación de ARN (RNA-seq) y la secuenciación de escopeta (Shotgun sequencing)?
RNA-seq se enfoca en la expresión génica, mientras que Shotgun sequencing se enfoca en la secuencia completa del genoma
RNA-seq utiliza fragmentos cortos de ARN, mientras que Shotgun sequencing utiliza fragmentos largos de ADN
RNA-seq es una técnica más antigua que Shotgun sequencing
No hay diferencia entre RNA-seq y Shotgun sequencing
