Font size
WorksheetsKonwersatorium
Total questions: 17
Worksheet time: 10mins
Szukając publikacji naukowej skorzystasz z bazy:
arabidopsis.org (TAIR)
Google Scholar
PubMed
Ensembl
Formatem, w którym zapisywane są sekwencje nukleotydowe oraz aminokwasowe jest:
Fasta
CSV
Docx
Pttx
Co to jest analiza BLAST?
Sprawdzanie poziomu ekspresji danego genu
Wyszukiwanie sekwencji homologicznych u innych gatunków
Wyszukiwanie mutacji w regionie kodujących
Sprawdzanie struktury potencjalnego białka
Co to jest sekwencja CDS?
Sekwencja całego genu
Sekwencja składająca się z egzonów
Sekwencja składająca się z intronów
Element regulatorowy
Bazą danych struktury białek nie jest:
RCSB-PDB
CATH
EMBL-EBI
ArrayExpress
Do baz danych sekwencji DNA można zaliczyć:
clinVar
dbSNP
ArrayExpress
CATH
Specyficzną dla Arabidopsis bazą danych jest:
EnsemblPlants
TAIR
Plant Express
Chcąc sprawdzić poziom ekspresji danego genu możesz skorzystać z bazy:
GEO
TAIR
SIB (Swiss Model)
ClinVar
Przyjmuje się, że aminokwasowe sekwencje homologiczne muszą mieć minimum ..... podobieństwa, aby uznać je za podobne
65%
40%
80%
90%
Poziom ekspresji genów możesz sprawdzić za pomocą:
Sekwencjonowania transkryptomu
Sekwencjonowania genomu
qPCR
Wszystkie odpowiedzi są poprawne
Do największych baz danych sekwencji DNA należą:
EMBL-EBI. CATH, NCBI
DDBJ, CATH, GEO
NCBI, EMBL-EBI, DDBJ
ArraxExpress, NCBI, PDB
Korzystając z bazy GEO możesz znaleźć takie informacje jak:
Datę i dane o submisji
Opis doświadczenia
Sekwencję genomu
Dane eksperymentalne
Trzeciorzędowa struktura białka to:
sekwencja aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym
lokalne formacje w obrębie łańcucha polipeptydowego obejmujące alfa-helisy i beta-harmonijki
trójwymiarowe ułożenie całego łańcucha polipeptydowego, uwzględniając wszystkie pętle, zwoje i inne formy przestrzenne, które tworzą się w wyniku oddziaływań między bocznymi łańcuchami aminokwasów
Jakie informacje nie zawiera format .pdb
Informacji o wiązaniach w białku
Informacji o kolejności nukleotydów
Informacji o kolejności aminokwasów
Różne kodony (różniące się na ogół tylko trzecim nukleotydem) mogą kodować ten sam aminokwas oznacza, że kod genetyczny jest:
Uniwersalny
Trójkowy
Zdegenerowany
Kolinearny
Repozytoria genomiczne i genetyczne możesz wykorzystać do:
PORÓWNYWANIA GENOMÓW
PRZEWIDYWANIa EKSPRESJI GENÓW
PRZESZUKIWANIA BAZ DANYCH SEKWENCJI
PRZEWIDYWANIA STRUKTURY BIAŁEK
W celu zbudowania struktury 3D białka na podstawie sekwencji aminokwasowej skorzystasz z:
SwiftModel
SwissModel
SModel
Żadne z powyższych
