WorksheetsQuiz sur la structure des protéines
Total questions: 62
Worksheet time: 36mins
Combien d’acides aminés existent-t-ils ?
18
20
21
23
16
Quels sont les 2 types de protéines selon la structure ?
Protéines transmembranaires
Protéines globulaires
Protéines fibrillaires
Protéines périphériques
Protéines mixtes
Quelle structure parmi structure primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire est facultative ?
Structure primaire
Structure secondaire
Structure tertiaire
Structure quaternaire
Structure alpha
Quelle est la particularité du premier et du dernier acide aminé ?
Le premier a une fonction NH3+ engagée
Le premier a une fonction NH3+ non engagée
Le dernier a une fonction COO- non engagée
Le dernier a une fonction COO- engagée
Les deux sont engagés dans des liaisons peptidiques
Qu’est-ce que le principe de colinéarité ?
La séquence d’acides aminés détermine la séquence d’ADN
La structure tertiaire est dictée par l’ARN
La séquence de nucléotides permet de construire la séquence d’acides aminés
Les protéines sont traduites sans ordre précis
La traduction est aléatoire
Quelles sont les méthodes de séquençage des protéines ?
Séparation par chromatographie
Séquençage des gènes
Homologie des séquences peptidiques
Spectroscopie UV
Séquençage par microARN
Quelles sont les structures secondaires possibles ?
Hélice alpha
Feuillets bêta
Triple hélice
Coudes et boucles
Superhélice
Quelles sont les caractéristiques de rotation de l’hélice alpha ?
Rotation dans le sens antihoraire
Un tour contient 3,6 AA
Rotation dans le sens horaire
Stabilisée par des liaisons hydrogène
Pas de rotation
Quel acide aminé est généralement absent de l’hélice alpha ?
Glycine
Proline
Alanine
Valine
Tyrosine
Quelles sont les protéines riches en hélices alpha ?
Myoglobine
Hémoglobine
Kératine
Collagène
Insuline
Entre quelles parties de la chaîne se font les liaisons hydrogènes dans une hélice alpha ?
CO du n et NH du n+1
CO du n et NH du n+2
CO du n et NH du n+4
CO du n+4 et NH du n
Entre chaînes latérales opposées
Quelle est la structure formée généralement par les protéines fibrillaires à partir des hélices alpha ?
Boucle fermée
Feuillet parallèle
Superhélice
Tonneau bêta
Double hélice
Comment se fait la stabilisation des feuillets bêta ?
Ponts disulfures
Liaisons hydrogène entre CO et NH
Interactions ioniques
Interactions hydrophobes
Liaisons covalentes
Quels sont les types de feuillets bêta ?
Feuillet croisé
Feuillet parallèle
Feuillet antiparallèle
Feuillet torsadé
Feuillet inversé
Comment sont connectés les segments des feuillets bêta entre eux ?
Hélice alpha
Superhélice
Coudes
Boucles
Ponts disulfures
Quelle est la taille maximale d’un coude (structure secondaire particulière) ?
10 AA
15 AA
20 AA
25 AA
30 AA
Quelle est la particularité des boucles (structure secondaire particulière) ?
Toujours hydrophobes
Situées au centre de la protéine
Tendance à se situer vers l’extérieur des protéines
Engagent des liaisons hydrogène avec l’eau environnante
Rigidité élevée
Quels sont les motifs fréquents par associations de structures secondaires ?
Bêta-alpha-bêta
Alpha-alpha
Bêta-bêta
Tonneau bêta
Boucle-coude
Qu’est-ce que la dénaturation des protéines ?
Destruction des liaisons faibles
Transformation de la structure primaire
Inactivation de la protéine
Hydrolyse des acides aminés
Formation de nouveaux ponts disulfures
L’hémoglobine est un...
Dimère
Tétramère
Trimère
Monomère
Pentamère
La tubuline est un...
Tétramère
Monomère
Hexamère
Dimère
Pentamère
Quelles sont les caractéristiques du collagène ?
Protéine la plus abondante chez les mammifères
3 chaînes peptidiques
Propriété d’élasticité
Composé d’hélices alpha
Constitue les tissus conjonctifs
Quelle est la structure/le schéma qui se répète dans le collagène ?
Glycine - X - Y
Proline - Lysine - Glycine
Alanine - Glycine - Valine
Glycine - Proline - Hydroxyproline
Glycine - Glycine - Glycine
Quels sont les acides aminés abondants dans le collagène ?
Glycine
Proline
Lysine
Histidine
Alanine
Pourquoi une carence en vitamine C peut-elle entraîner une anomalie du collagène ?
La vitamine C est un cofacteur pour l’hydroxylation de la proline
La vitamine C est un acide aminé présent dans le collagène
Elle empêche la synthèse de la glycine
Elle permet l’hydroxylation de la lysine
Elle stabilise les feuillets bêta du collagène
Quel est le sens des hélices individuelles qui composent le tropocollagène ?
Horaire
Anti-horaire
Parallèle
Super-enroulé
Alterné
Quel est le sens des hélices du tropocollagène du collagène ?
Anti-horaire
Parallèle
Horaire
Alterné
Inversé
Comment la structure du tropocollagène est-elle stabilisée ?
collagène ?
Anti-horaire
Parallèle
Horaire
Alterné
Inversé
Comment la structure du tropocollagène est-elle stabilisée ?
Liaisons hydrogènes entre les 3 hélices
Ponts disulfures
Répulsion stérique des chaînes latérales volumineuses
Absence totale de glycine
Présence de glycine
À quoi servent les réactions de condensation dans une protéine comme le tropocollagène ?
Formation de liaisons covalentes entre chaînes
Augmenter l’élasticité
Apporter une résistance mécanique
Hydrolyser les acides aminés
Libérer des radicaux libres
Quelles sont les réactions de condensation possibles dans le tropocollagène à partir de l’allysine ?
2 allysines condensation aldol
Lysine + allysine lysinonorleucine
2 allysines + His condensation Histidine aldol
3 allysines + Lysine desmosine/isodesmosine
Lysine + glycine pont peptidique
Quelles sont les étapes de la synthèse des fibres de tropocollagène ? (question ouverte, transformée ici en QCM basé sur la synthèse classique)
Synthèse du préprocollagène
Hydroxylation des prolines/lysines
Sécrétion du tropocollagène
Clivage du préfixe glycosidique
Assemblage en fibrilles
Qu’est-ce que le domaine protéique ?
Une enzyme entière
Une chaîne latérale spécialisée
Une partie d’une protéine associée à une fonction précise
Une portion d’ADN non codante
Un site de repliement secondaire
À peu près combien d’acides aminés peuvent constituer un domaine ?
10–50 AA
50–100 AA
100–400 AA
400–800 AA
Plus de 1000 AA
Quelle partie du gène code en général pour les domaines de protéines ?
Introns
Promoteurs
Exons
Séquences non traduites
Enhancers
Quelle est l’importance des domaines pour les fonctions enzymatiques, récepteurs-ligands, etc. ?
Ils participent à la reconnaissance de l’ARN
Localisation des sites actifs entre plusieurs domaines
Ils réduisent l’expression du gène
Ils assurent la stabilité du repliement primaire
Ils remplacent la structure quaternaire
Vrai ou faux : L’association de domaines préexistants permet une évolution des protéines.
Vrai, les protéines partagent souvent des domaines communs
Faux, chaque protéine a une structure unique
Faux, les domaines sont toujours spécifiques à une protéine
Vrai, les domaines sont modulables dans l’évolution
Faux, les domaines ne participent pas à la fonction
Vrai ou faux : Une protéine peut assurer ses fonctions malgré la perte de sa structure tertiaire.
Vrai, si la structure primaire est intacte
Faux, la structure tertiaire est essentielle
Faux, les fonctions secondaires suffisent
Vrai, si les domaines sont conservés
Faux, les sites actifs nécessitent la conformation tertiaire
Quelles liaisons interviennent dans la structure tertiaire ?
Quelles liaisons interviennent dans la structure tertiaire ?
Liaisons hydrogène
Liaisons hydrophobes
Ponts disulfure
Liaisons peptidiques
Liaisons phosphodiester
Dans la structure tertiaire, quelles parties de la protéine établissent des liaisons hydrogène ?
Entre chaînes latérales hydrophobes
Entre CO et NH des liaisons peptidiques
Entre groupements SH
Entre atomes polaires des chaînes latérales
Entre NH2 terminaux et résidus acides
Dans la structure tertiaire, quelles parties de la protéine établissent des attractions hydrophobes ?
Entre chaînes latérales aliphatiques
Entre chaînes latérales aromatiques
Entre une chaîne latérale aromatique et une aliphatique
Entre groupements polaires
Entre COOH et NH3+
Quelle est la différence de repliement des protéines en milieu aqueux et en milieu lipidique ?
En milieu aqueux, les résidus polaires sont au centre
En milieu aqueux, les résidus polaires interagissent avec l’eau
En milieu lipidique, les résidus hydrophobes sont à l’extérieur
En milieu aqueux, les résidus non polaires sont au cœur
En milieu lipidique, les chaînes polaires sont exposées
Quel est le rôle du glutathion dans la formation des ponts disulfure ?
Favorise l’oxydation permanente
Active les ponts disulfure entre tous les AA
Régénère les groupes SH à l’état réduit
Stabilise les chaînes hydrophobes
Répare les liaisons peptidiques
Qu’est-ce que la structure quaternaire ?
Structure formée par un seul domaine
Assemblage de sous-unités protéiques en une protéine unique
Structure primaire repliée
Une hélice alpha stabilisée
Interaction entre enzymes et substrats
Quelles sont les types de chaînes individuelles qui peuvent composer le tropocollagène ?
Alpha-1-I
Alpha-1-II
Alpha-1-III
Alpha-2
Beta-1-I
Parmi les propositions suivantes, quelle est la maladie due à une mutation au niveau du gène qui code pour le collagène ?
Syndrome d’Ehlers-Danlos
Drépanocytose
Sclérose en plaques
Marfan
Lupus érythémateux
Quel est le type de collagène responsable d’une ostéogenèse imparfaite (dans le cas d’une mutation) ?
Type I
Type II
Type III
Type IV
Type V
Associer le type de collagène à sa structure et sa distribution tissulaire ?
Type I : os, tendons, peau
Type II : cartilage
Type III : tissus réticulaires
Type IV : lame basale
Type V : rétine
Quels sont les acides aminés qui composent en majorité l’élastine ?
Proline
Lysine
Acides aminés non polaires
Cystéine
Tryptophane
Quels sont les composants de la matrice extracellulaire ?
Collagène
Fibronectine
Laminine
Protéoglycans
Hémoglobine
Qu’est-ce que l’entonnoir du repliement des protéines ? (transformée ici en QCM basé sur l’idée principale)
Modèle illustrant la réduction progressive de l’entropie lors du repliement
Représente les interactions entre les protéines mal repliées
Montre les différents états de repliement d’une protéine
Fait référence au processus d’agrégation des protéines
Désigne la synthèse d’une chaîne polypeptidique
Quel rôle jouent les chaperons moléculaires dans le repliement des protéines ?
Empêchent la formation d’agrégats
Favorisent le repliement correct
Dégradent les protéines mal repliées
Assurent l’épissage des protéines
Interviennent dans la synthèse d’ARN
Quels sont les agents dénaturants ?
Acides
Bases
Sels
Agents oxydants
Agents réducteurs
Vrai ou faux : Une protéine dénaturée par un agent dénaturant peut retrouver sa conformation active (repliement) en enlevant l’agent dénaturant.
Vrai
Faux
Seulement si c’est une enzyme
Cela dépend du pH
Seulement chez les eucaryotes
Qu’est-ce que la « délinquance » moléculaire ?
Une protéine mal repliée entraîne le mauvais repliement d’autres protéines
Une protéine inhibée par un prion
Une mutation affectant l’ARN
L’agrégation contrôlée des protéines
L’activation d’enzymes de stress
Qu’est-ce qu’un prion ?
Exemple de délinquance moléculaire
Molécule mal repliée entraînant d’autres conformations anormales
Remplace les hélices alpha en feuillets bêta
Molécule d’ADN non codante
Protéine virale
Quelles sont les maladies à prions chez l’homme ?
Maladie de Creutzfeldt-Jakob
Maladie de Kuru
Syndrome Gerstmann-Sträussler-Scheinker
Chorée de Huntington
Encéphalopathie spongiforme bovine
Qu’est-ce que les amyloïdoses ?
Accumulation de protéines mal repliées
Dépôt extracellulaire de protéines insolubles
Formation de plaques riches en feuillets bêta
Destruction enzymatique des hélices alpha
Maladie auto-immune du tissu conjonctif
Quelles sont les causes de la maladie d’Alzheimer ?
Plaques d’amyloïde
Réseaux fibrillaires intra-neuronaux
Manque de vitamine D
Mutation du collagène
Déficit en dopamine
Qu’est-ce qui permet une diversité des fonctions des protéines ?
Diversité des chaînes latérales
Diversité des acides aminés soufrés
Diversité des interactions
Variabilité du groupement alpha
Modification du carbone central
