Bases de Datos en Bioinformática

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¿Qué son las bases de datos primarias?

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Almacenan la información 'en bruto' generada directamente por las diversas técnicas experimentales. Ejemplos: GenBank, UniProt, PDB.

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¿Qué información contienen las bases de datos secundarias?

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Contienen información derivada del análisis y procesamiento de los datos primarios, incluyendo anotaciones, predicciones y relaciones entre los datos. Ejemplos: Pfam, PROSITE, KEGG.

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¿Qué son las bases de datos especializadas?

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Reúnen información específica sobre un área de interés, como organismos modelo, enfermedades o funciones moleculares. Ejemplos: FlyBase, SGD, TAIR.

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¿Cuáles son las principales bases de datos primarias de nucleótidos?

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GenBank, ENA (European Nucleotide Archive), DDBJ (DNA Data Bank of Japan).

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¿Qué es el Consorcio Internacional de Bases de Datos de Secuencias de Nucleótidos (INSDC)?

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Es un consorcio donde GenBank, ENA y DDBJ colaboran y comparten información, sincronizándose cada 24 horas.

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¿Cuál es la principal base de datos de proteínas?

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UniProt.

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¿Qué secciones principales componen UniProt?

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Swiss-Prot (información revisada manualmente) y TrEMBL (traducciones de secuencias codificantes con anotaciones computacionales).

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¿Qué almacena el Protein Data Bank (PDB)?

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Información detallada sobre las coordenadas atómicas de estructuras de proteínas, ácidos nucleicos y complejos macromoleculares.

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¿Qué técnicas se utilizan para determinar las estructuras en PDB?

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Cristalografía de rayos X, resonancia magnética nuclear (RMN) y microscopía electrónica.

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¿Qué tipo de datos almacenan las bases de datos de expresión génica?

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Datos de expresión génica, ejemplos incluyen GEO y ArrayExpress.