מבוא להנדסה גנטית

סיכום כלים ביואנפורמטיים

ארבעת הכלים שנחשפנו אליהם :

ENTREZ

BLAST ( BLASTn + BLASTp )

ORF Finder

JSMOL

Multiple Select

מה הוא סוג השאילה בכלי entrez ?

• רצף נוקלאוטידים

• רצף חומצות אמינו

• מילות בודדות

• קוד זיהוי

Multiple Select

מה הוא סוג השאילתה בכל blastn

• רצף נוקלאוטידים

• רצף חומצות אמינו

• מילות בודדות

• קוד זיהוי

Multiple Select

מה הוא סוג השאילתה בכלי orf finder ?

• רצף נוקלאוטידים

• רצף חומצות אמינו

• מילות בודדות

• קוד זיהוי

Multiple Select

מה הוא סוג השאילתה בכלי jsmol?

• רצף נוקלאוטידים

• רצף חומצות אמינו

• מילות. מפתח

• קוד זיהוי

Multiple Choice

מטרת החיפוש של הכלי jsmol

• איתור מידע עבור רצף

• הצגת מודל בתלת מימד

• איתור מסגרת קריאה פתוחה

• השוואת רצפי חומצות אמינו

Multiple Choice

מטרת החיפוש של הכלי enterz

• איתור מידע

• השוואת רצפי נוקלאוטידים

• איתור מסגרת קריאה פתוחה

• הצגת מודל בתלת מימד

Multiple Choice

מטרת החיפוש של הכלי blastn + blastp

• השוואת רצף השאילתה לרצף הקיים במאגרים

• איתור מסגרות קריאה

• איתור מידע עבור רצף

• הצגת מודל בתלת מימד

Multiple Choice

מטרת החיפוש של הכלי orf finder

• איתור מידע עבור רצף

• השוואת רצף נוקלאוטידים

• איתור מסגרת קריאה פתוחה

• הצגת מודל בתלת מימד

חוקרים ביחד....

• עליכם להתחלק לצוותים של שלישיות

• על כל שלישיה לחקור ביחד תופעה מדעית/רפואית שונה

• במהלך החקירה תצטרכו להשתמש בלפחות בשלושה כלים ביואנפורמטיים ברצף מוגדר מראש

• על כל אחד מחברי הצוות להתנסה בכלי אחד, כאשר התוצאה של כלי מסויים מהווה את השאילתה של הכלי האחר

• בסוף החקירה תצטרכו להציג בפני הכיתה סיכום קצר של התופעה המדעית שחקרתם ותוצאות המחקר הביואנפורמטי שקיבלתם בסוף