Predicción de las estructuras proteicas

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Cuales son los tipos de evoluciones que puede tener una proteína de acuerdo a su estructura tridimensional

• Convergente

• Análogo

• Homólogo

• Divergente

• Insurgente

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I-TASSER es un servidor para el modelado de estructura proteica

• Verdadero

• Falso

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Una aplicación de Phyre2 puede hacer...

• Todas las anteriores

• Análisis filogenético

• Análisis de dominios múltiples

• Aviso de resultados homólogos a la secuencia query

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Los indicadores globales analizan los residuos de la estructura proteica

• Verdadero

• Falso

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El punto de vista evolutivo de la correlación se basa en la compensación de una mutación desestabilizadora por un equivalente

• Verdadero

• Falso

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Es un predictor de estructuras proteicas en el campo de la agregación de proteínas

• BLAST

• AlphaFold

• CASP

• Bioedit

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En que se basa el modelado de threading?

• Secuencias de novo

• En un grupo de secuencias problemas

• En estructuras ya caracterizadas

• Todas las anteriores

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¿Para qué nos sirve la clasificación de una molécula?

• Para saber los colores de una proteína

• Nos ayuda a entender las características de una proteína

• Para descartar que exista otra proteína igual

• Todas las anteriores

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Los métodos de ab initio basados en física analizan

• Enlaces, angulos, angulos de torsion y fuerzas de van der waals

• Enlaces carbono-carbono, Ángulo psi, distancia del núcleo al ultimo residuo exterior

• Enlaces de hidrogeno, fuerza de unión al sustrato, interacción hidrofóbica

• Enlaces de sulfuro, fuerzas de repulsión, enlaces de hidrogeno y unión del sitio activo

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Los algoritmos que se utilizan para la comparación por semejanza son

• Matriz de Markov, PAM

• BLAST, Bioedit

• Huffman, Turing

• Needleman-Wunch, Smith-Waterman

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CASP es un experimento comunitario bilateral con el propósito de determinar la versión mas reciente en cuanto al modelado de estructuras proteicas

• Verdadero

• Falso

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Cuanto porcentaje de identidad ocupa el modelado en modo automático

• <90%

• >50%

• <30%

• >75%