Bioinfor 01

Bioinformatika Lanjutan

Sebelum mulai...

Bagi yang belum isi form, mohon diisi 😀

Poll

Bioinformatika Dasar sulit/membuat pusing? 😵

• Ya

• Tidak

Bioinformatika Lanjutan

Jika Bioinformatika Dasar belajar tentang gen, maka Bioinformatika Lanjutan belajar tentang genom

Multiple Choice

Seluruh materi genetik dalam makhluk hidup

• Gen

• Genom

• Kromosom

• DNA

Mengapa perlu?

Segi Biologis:
- Mempelajari organisme secara menyeluruh

Segi Teknologi:
- Kemajuan teknologi komputasi yang makin cepat dan murah

'Pipeline' WGS

Sepanjang kelas kita akan memproses data melalui sebuah pipeline, rangkaian program/software yang digunakan.

Learning Objective

1. Mahasiswa mampu berkolaborasi menyelesaikan proyek assembly dan analisis genom prokariot sesuai rubrik

2. Mahasiswa mampu mendokumentasikan proses dan hasil proyek assembly dan analisis genom prokariot dalam bentuk laporan sesuai rubrik

3. Mahasiswa mampu mengoperasikan perangkat lunak untuk assembly dan analisis genom prokariot dan menyajikan hasilnya dalam bentuk presentasi sesuai rubrik

4. Mahasiswa mampu menjelaskan prinsip kerja perangkat lunak untuk assembly dan analisis genom prokariot dalam bentuk class notebook sesuai rubrik

Learning Method

TM

Presentasi dan Diskusi

Tutorial

Melakukan analisis/assembly (khususnya troubleshooting)

Di luar jam kelas

Membaca paper, persiapan presentasi, analisis mandiri

Penilaian

KAT 1: Class notebook
KAT 2: Aktivitas dan Kolaborasi (Aktivitas kelas & Forum)
UTS: Assembly Genom (Laporan & Presentasi)
UAS: Analisis Genom (Laporan & Presentasi)

Next Week...

Grup A (Akan diupdate di moodle) membuat class notebook tentang:

- Metode-metode WGS
- Illumina, PacBio, Nanopore
- Input/Output-nya
- Plus-minus masing-masing