GENE ANNOTATION

Anotasi genom merupakan salah satu proses penting dalam studi genomik. Anotasi genom adalah proses identifikasi dan penentuan lokasi gen dari sekuen mentah DNA, kemudian dilakukan penamaan dan karakterisasi fungsi gen tersebut. Apakah pernyataan benar atau salah?

• BENAR

• SALAH

Anotasi untuk hypothetical protein dilakukan terhadap sekuen genom sampel, yang fungsi -fungsi gennya tidak diketahui. Cara melakukan anotasi untuk hypothetical protein yaitu dengan pencarian homolog sekuen mRNA-nya dari database, serta prediksi dari struktur sekunder proteinnya. Apakah pernyataan tersebut benar atau salah?

• BENAR

• SALAH

Anotasi genom dilakukan setelah sekuensing seluruh genom dan sebelum penyatuan (assembly) sekuen-sekuen DNA tersebut. Apakah pernyataan tersebut benar atau salah?

• BENAR

• SALAH

Automated genome annotation (anotasi genom secara otomatis) dilakukan terhadap genom yang fungsi gennya tidak dapat diketahui dan proses anotasinya berjalan dengan sangat lambat. Apakah pernyataan tersebut benar atau salah?

• BENAR

• SALAH

Tiga set informasi yang disediakan oleh gen ontologi (GO) ialah proses biologis, komponen seluler, dan fungsi molekuler. Tiap set informasi tersebut memiliki kosa kata yang unik, namun tidak saling tumpang tindih agar terdapat standarisasi untuk penamaan gen. Apakah pernyataan tersebut benar atau salah?

• BENAR

• SALAH

Dalam satu kondisi tertentu, satu transkrip mRNA dapat ditranslasikan untuk lebih dari satu protein?

• BENAR

• SALAH

Terdapat dua tahap dalam anotasi genom, yaitu:

• prediksi gen dan penentuan fungsi gen

• prediksi struktur gen dan penentuan similaritas sekuen proteinnya

• eksperimen laboratorium dan input data hasil eksperimen tersebut

• prediksi ekson-intron dan penentuan alternative splicing

• penentuan produk gen dan lokasi gen tersebut dalam sel

Dibawah ini pernyataan mana yang tidak benar terkait gene ekonomi ...

• Gene ekonomi adalah fenomena sintesis banyak protein dari sedikit gen

• Gene ekonomi adalah strategi utama yang digunakan oleh organisme eukariot untuk mencapai berbagai jenis fenotipik

• Mekanisme genetik yang digunakan untuk membantu menghitung nilai ekonomi genom

• Strategi utama yang digunakan organisme eukariot untuk mencapai berbagai keragaman genotipe

Pernyataan di bawah ini yang tidak benar terkait gene ontology adalah?

• Untuk mengelompokan protein berdasarkan fungsi terkait

• Memberikan konsistensi dalam menggambarkan fungsi protein secara keseluruhan

• Tidak ada standarisasi jalur terkait

• Ada standarisasi nama dan kegiatan

Pernyataan di bawah ini yang tidak benar terkait gene ontology adalah?

• Anotasi genom dari genom manusia menggunakan kombinasi prediksi teoretis dan verifikasi eksperimental

• Struktur gen pertama kali diprediksi oleh program prediksi ab initio exon

• Gen yang diprediksi dibandingkan dengan sekuens cDNA dan EST yang ditentukan secara eksperimental

• Komponen seluler dijelaskan menggunakan kosakata terbatas