Parte de Frank
Authored by Mia Somocurcio
Biology
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62 questions
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1.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
30 sec • 1 pt
Si se quería identificar un microorganismo por su morfología, ¿qué método tradicional se usaba?
Gold standard
Microscopio óptico
Electroforesis capilar
Secuenciación Sanger
2.
MULTIPLE SELECT QUESTION
45 sec • 1 pt
¿Cuáles son estudios metagenómicos?
Earth Microbiome Project
American gut project
Metahit
Human Microbiome Project
3.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
30 sec • 1 pt
Si se quiere realizar un estudio de taxonomía, ¿qué programa usarías y qué tipo de secuenciamiento aplicarías?
Kraken teniendo como input los datos generados por secuenciamiento por el enfoque shotgun metagenómico que contiene reads sin ensamblar.
QIIME2 con secuenciación por amplicones y datos trimados
MEGAN con secuenciación Illumina y ensamblaje metagenómico
BLAST con secuenciación Sanger y ensamblaje de novo
4.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
30 sec • 1 pt
¿Qué primers se usan para amplificar toda la región 16S?
1492R y 27F
515Y y 806R
8F y 1391R
338F y 806R
5.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
30 sec • 1 pt
Si se quiere analizar el género específico, ¿cuál sería el protocolo a seguir?
Amplificación de toda la región 16S (metataxonómica). Digestión por enzimas de restricción doble para hallar el genogrupo.
Amplificación de la región V4 del 16S (metagenómica). Ensamblaje de novo para identificar el género.
Amplificación de la región V4 del 18S (metataxonómica). Secuenciación por Sanger para el análisis de género.
Amplificación de toda la región 16S (metagenómica). Ensamblaje de novo para identificar el género.
6.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
30 sec • 1 pt
El ARNr ribosomal posee stems y loops, ¿cuáles regiones son variables y cuáles son permanentes?
Stems -> Conservadas; Loops -> Variables
Stems -> Variables; Loops -> Conservadas
Ambas son variables; Ambas son conservadas
Ambas son permanentes; Ambas son variables
7.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
30 sec • 1 pt
Diferencia entre metagenómica y metataxonómica
Metagenómica -> Analiza todo el genoma; Metataxonómica -> Amplifica solo 1 gen
Metagenómica -> Amplifica regiones específicas; Metataxonómica -> Analiza todo el genoma
Metagenómica -> Usa secuenciación Sanger; Metataxonómica -> Usa secuenciación Illumina
Metagenómica -> Identifica especies; Metataxonómica -> Identifica géneros
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