UJIAN BIOINFORMATIKA KELAUTAN

Apa yang dimaksud dengan protein folding?

• Proses pemecahan protein menjadi asam amino

• Proses penggabungan asam amino menjadi protein

• Proses protein mengambil struktur tiga dimensi fungsionalnya

• Proses denaturasi protein oleh panas

• Proses sintesis protein di ribosom

Manakah dari berikut ini yang bukan merupakan jenis ikatan non kovalen?

• Ikatan hidrogen

• Interaksi van der Waals

• Interaksi ionik

• Interaksi hidrofobik

• Ikatan kovalen

Manakah urutan yang benar dalam proses sintesis protein?

• Transkripsi - Translasi - Replikasi

• Replikasi - Transkripsi - Translasi

• Translasi - Transkripsi - Replikasi

• Transkripsi - Translasi

• Replikasi - Translasi - Transkripsi

Apakah tujuan utama dari molekular docking?

• Menentukan urutan asam amino dalam protein

• Memprediksi interaksi antara ligan dan protein target

• Mengukur berat molekul protein

• Menghitung energi kinetik molekul

• Menganalisis struktur sekunder protein

Manakah dari berikut ini yang bukan merupakan metode umum untuk mendapatkan struktur protein?

• Kristalografi sinar-X

• Spektroskopi NMR

• Mikroskop elektron cryo (cryo-EM)

• Sekuensing DNA

• Prediksi struktur berbasis komputasi

Apa yang dimaksud dengan struktur ligan dalam konteks molekular docking?

• Struktur tiga dimensi dari protein target

• Molekul kecil yang berinteraksi dengan protein target

• Ikatan kovalen antara dua asam amino

• Struktur sekunder dari protein

• Membran sel yang mengelilingi protein

Untuk memenuhi struktur ligand harus membentuk berapa ikatan?

• 1

• 2

• 3

• 4

• 5

Pada pembentukan reposter ada 3 bagian ligand, warna  apakah yang cocok dimasukan ke dalam  pembentukan reposter?

• Kuning

• Merah

• Biru

• Hitam

• Hijau

Apa langkah yang harus diambil jika ligand tersedia dalam Struktur Kompleks?

• Mencari informasi tambahan dari Uniprot

• Tempat pengikatannya jelas

• Melakukan Binding Site Prediction

• Melakukan Blind Docking

• Mengabaikan data ligand

Sebutkan apa saja ikatan non kovalen pada struktur tersier?

• C=OHN

• -CH3 H3C

• C=O...HO

• OH...O=C

• CN4 H20