Tin sinh học. Chương 4 part 1

Tên gọi khác của phương pháp giải trình tự Sanger là gì?

• Giải trình tự thế hệ mới (Next-Generation Sequencing)

• Giải trình tự dideoxy (Dideoxy Sequencing)

• Giải trình tự Pyro (Pyrosequencing)

• Giải trình tự Nanopore (Nanopore Sequencing)

Thành phần nào trong phương pháp Sanger gây ra sự dừng tổng hợp DNA?

• Deoxynucleotide (dNTPs)

• Dideoxynucleotide (ddNTPs)

• DNA polymerase

• Mồi (Primer)

Tính chất nào của ddNTP khiến chuỗi DNA không thể kéo dài thêm?

• Thiếu nhóm phosphate ở vị trí 5’

• Thiếu base nitơ

• Thiếu nhóm hydroxyl (-OH) ở vị trí 3’

• Thừa nhóm phosphate

Các ddNTP khác nhau được phân biệt như thế nào trong phương pháp Sanger tự động?

• Bằng khối lượng phân tử khác nhau

• Bằng tính phóng xạ

• Bằng màu huỳnh quang đặc trưng

• Bằng khả năng tạo liên kết hydro

Phương pháp nào thường được sử dụng để tách các đoạn DNA trong giải trình tự Sanger?

• Ly tâm

• Điện di trên gel

• Phổ khối lượng

• Khuếch đại PCR

Enzyme nào cần thiết cho quá trình tổng hợp DNA trong phương pháp Sanger?

• Enzyme cắt giới hạn

• RNA polymerase

• DNA polymerase

• Ligase

Hạn chế chính của phương pháp giải trình tự Sanger là gì?

• Độ chính xác thấp đối với chuỗi ngắn

• Không thể giải trình tự protein

• Độ dài trình tự bị giới hạn (~700-1000 nucleotide mỗi lần)

• Hiệu suất cao trong giải trình tự toàn bộ hệ gen

Định dạng nào thường được sử dụng để lưu kết quả giải trình tự Sanger trong phân tích tin sinh học?

• CSV

• FASTA

• JSON

• Excel

Ứng dụng nào sau đây KHÔNG phải của phương pháp giải trình tự Sanger?

• Giải trình tự toàn bộ hệ gen lớn

• Xác nhận đột biến

• Giải trình tự gen nhỏ

• Nghiên cứu tiến hóa

Tại sao phương pháp Sanger vẫn được sử dụng mặc dù đã có công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS)?

• Nhanh hơn trong giải trình tự toàn bộ hệ gen

• Chi phí hiệu quả hơn cho các chuỗi DNA ngắn

• Không cần mồi

• Có thể giải trình tự các đoạn DNA dài hơn so với NGS