PCR ile İlgili Sorular

Genç bir doktor, yüksek ateş ve boğaz ağrısı ile gelen hastanın COVID-19 mu, grip mi yoksa sadece annesinin ev köftesine karşı alerjisi mi olduğunu ayırt etmek istiyor. Aşağıdakilerden hangisi ile kesin tanıya ulaşabilir?

• Antibiyotik kültürü

• PCR testi

• Lenf bezine masaj

• Hastaya ‘geçer’ demek ve eve göndermek

PCR cihazı çalışırken hava durumuna göre sıcaklık değiştirir. Sence PCR’da "annealing" yani "bağlanma" aşamasında ortam kaç derece olmalıdır?

• 20°C – serin bir bahar havası

• 72°C – tatil köyü jakuzisi

• 50–65°C – ılık bir çay demliği

• 95°C – çaydanlık fokur fokur!

PCR reaksiyonunda görev alan ve 72°C’de DNA’nın yeni kopyasını oluşturan enzim kimdir?

• RNA polimeraz

• Ligaz

• Taq polimeraz

• DNA helikaz

PCR’ın bir türü düşün: DNA çoğalırken sonuçları anlık olarak ekranında görebiliyorsun. Bu hangi PCR türüdür?

• Retro PCR

• Real-Time PCR

• Flash PCR

• Slow Motion PCR

Bir PCR tepkimesinde primerler yanlış sıcaklıkta bağlanamazsa ne olur?

• DNA kendi kendine çoğalır

• Taq polimeraz istifa eder

• Hedef bölge amplifiye edilemez

• DNA çözeltisi kristalleşir

Bir öğrenci RNA virüsünü PCR ile analiz etmek istiyor ama DNA şablonu yok. Bu durumda aşağıdaki çözümlerden hangisi doğru olur?

• Ters transkripsiyon yapılır, cDNA elde edilir

• PCR’ya dua edilir

• DNA yerine protein kullanılır

• RNA zaten yeterlidir, sorun yok

PCR sırasında kullanılan negatif kontrol neyi kanıtlamak için gereklidir?

• PCR’ın hızını

• Pipetin markasını

• Sonucun kontaminasyonsuz olduğunu

• DNA’nın ne kadar güçlü olduğunu

Real-Time PCR’da elde edilen Ct (Cycle threshold) değeri ile ilgili hangisi doğrudur?

• Ct değeri ne kadar yüksekse örnekte o kadar çok DNA vardır

• Ct değeri sadece RNA için ölçülür

• Ct değeri, DNA’nın kaçıncı döngüde algılandığını gösterir

• Ct değeri rastgele değişen şanslı sayıdır

PCR sırasında hangi aşamada DNA'nın iki ipliği ayrılır?

• Denatürasyon

• İnceleme

• Uzatma

• Annealing

Soru:
Bir laboratuvarda SARS-CoV-2 tanısı için yapılan Real-Time PCR testinde Ct değeri 38 olarak raporlanıyor. Aşağıdakilerden hangisi bu sonuçla ilgili EN DOĞRU yorum olur?

• Örnek yüksek miktarda virüs içerdiği için Ct değeri düşüktür

• Ct değeri 38 olduğu için hasta kesin negatiftir

• Ct değeri çok yüksek olduğu için örnekte hedef RNA çok az olabilir veya sınırda pozitiflik olabilir

• Ct değeri düşükse, PCR kararsız çalışmış demektir