Soal_PCR_Konvensional Pert-10

Komponen apa yang wajib disiapkan dalam reaksi PCR konvensional?

• DNA template, primer, buffer, MgCl₂, Taq polymerase, dNTP
• DNA template, RNA primer, ATP, enzim ligase
• Protein, karbohidrat, lipid, dan enzim lipase
• DNA template, ribosom, mRNA, tRNA
• DNA template, histon, enzim restriksi

Tahap awal PCR pada suhu 94–95°C bertujuan untuk...

• Mengaktifkan enzim ligase
• Memisahkan heliks ganda DNA
• Mengikatkan primer ke DNA
• Memanjangkan rantai DNA
• Menurunkan viskositas larutan

Tahap annealing dalam PCR konvensional dilakukan pada suhu...

• 20–30°C
• 40–50°C
• 50–65°C
• 75–85°C
• 90–95°C

Suhu optimal untuk elongasi DNA oleh Taq polymerase adalah...

• 25°C
• 37°C
• 55°C
• 72°C
• 95°C

Produk PCR konvensional biasanya dianalisis menggunakan...

• Spektrofotometer
• Elektroforesis gel agarosa
• Mikroskop elektron
• Kromatografi kolom
• Centrifugasi

Fungsi buffer dalam reaksi PCR adalah...

• Mengatur pH agar enzim tetap aktif
• Menyediakan sumber energi
• Mengikat DNA target
• Menggandakan DNA template
• Membentuk kompleks dengan primer

Elektroforesis gel agarosa memisahkan fragmen DNA berdasarkan...

• Komposisi basa
• Panjang fragmen (ukuran)
• Jumlah ikatan hidrogen
• Jumlah nukleotida purin
• Konsentrasi MgCl₂

Warna pita DNA dapat diamati dengan bantuan...

• Pewarna eosin
• Pewarna hematoksilin
• Etidium bromida atau SYBR Safe
• Pewarna Gram
• Crystal violet

Jika tidak ada pita DNA yang terlihat pada hasil elektroforesis, kemungkinan penyebabnya adalah...

• Jumlah DNA template terlalu banyak
• Primer terlalu spesifik
• Tidak ada amplifikasi yang terjadi
• Suhu elektroforesis terlalu tinggi
• DNA template terlalu besar

Ukuran fragmen DNA hasil PCR ditentukan dengan cara...

• Menghitung jumlah siklus PCR
• Membandingkan dengan DNA ladder
• Menggunakan spektrofotometer UV
• Mengukur pH buffer
• Menambahkan pewarna protein