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WorksheetsBioinformatica
Total questions: 20
Worksheet time: 2hrs 40mins
Antes de la llegada de las tecnologías de secuenciación de ADN, los árboles filogenéticos se usaron casi exclusivamente para
describir la identidad de las especies
describir los taxones existentes por biología molecular
describir relaciones entre especies en sistemática y taxonomía
describir relaciones entre proteínas
Al analizar este Alineamiento múltiple de secuencias (MSA) se puede observar que la secuencia que más cambio evolutivo ha tenido es
Beta globin
Neuroglobin
Myoglobin
Soybean
Rice
Se le conoce así al agrupamiento de genes que regulan una función relacionada.
Operones
Genes
ORF
Mensajero monocistrónico
Ejemplo de elementos géneticos moviles
plásmidos
integrales
Bacteriófagos
Transposones
Islas genómicas
EJemplo de base de datos primaria
NCBI
EMBL
DDBJ
DDJB
Ejemplos de Base de datos secundaria
PDB
KEGG
NCBI
EMBL
Menciona los tipos de alineamientos
Global
semilocal
Semiglobal
local
¿Cuál fue la primera molécula biológica en ser secuenciada?
insulina
alanina
saccharomyces cerevisae
urea
¿Qué metodología fue utilizada para secuenciar el primer genoma de DNA?
Metódo químico de Maxam y Gilbet
Sanger
Roche 454
ilumina
Son ejemplos de los alcances de la secuenciación y bioinformática
Mapeo y diagnóstico de enfermedades genéticas
Investigación del cáncer y las pruebas prenatales
Genómica de poblaciones
Medicina personalizada
Ciencia que se enfoca al estudio de los genomas así como los genes que contienen, sus funciones, las interacciones entre ellos y con los factores ambientales:
Genómica
Bioinformática
Genes
Proteómica
Se enfoca a la identificación y estudio de las variantes estructurales de secuencia en los genomas:
Genómica estructural
Genómica funcional
Genómica Comparativa
Genómica disociativa
Es un conjunto de matrices de mutación de péptidos, o matrices de sustitución, calculado por Margaret Dayhoff, considerando secuencias con una mutación puntual por cada cien aminoácidos
PAM
BLOSUM
Animatrix
NEO_GATTACA
Su labor consiste en investigar, desarrollar y aplicar herramientas informáticas y computacionales para permitir y mejorar el manejo de datos biológicos:
Bioinformatica
Genómica
proteómica
Biología
Es el estudio a gran escala de las proteínas, su expresión en las células, así como las modificaciones post-transcripcionales que las regulan.
Genómica
Transcriptómica
Proteómica
Metabolómica
Epigenómica
Es la ciencia ómica que nos deja conocer, de manera global, los cambios en la expresión del RNA de un organismo o tejido en respuesta a un estímulo dado en un momento determinado
Nutrigenética
Transcriptómica
Metabolómica
Poteómica
Herramientas de la biología molecular y las ciencias genómicas para medir o cuantificar la expresión de RNA o identificar mutaciones en genes específicos
Microarreglos de cDNA
DNA seq
RNAseq
análisis iTRAQ
¿Cuáles de estos programas se usan para hacer alineamientos múltiples y análisis filogenéticos?
MegaX
ClustalX
Phylip
Jalview
Es un formato de archivo de texto que describe las estructuras tridimensionales de moléculas que están almacenadas en el Protein Data Bank.
Formato FASTA
Formato PDB
Formato GeneBank
Formato Phylip
Las siglas NGS significan Next Generation Sequence. ¿Qué plataformas se usan para realizar este tipo de secuenciación de DNA?
UniProt
HiSeq
Biopython
MiSeq
MinION
