Satuan observasi ekonomi kelembagaan adalah komoditas dan harga, sedangkan ekonomi neoklasik adalah transaksi

Fokus tujuan ekonomi kelembagaan adalah self-interest, sedangkan ekonomi neoklasik adalah diri sendiri dan orang lain

Hubungan dengan ilmu sosial lainnya, ekonomi kelembagaan hampir semua ilmu sosial, sedangkan ekonomi neoklasik hanya ilmu ekonomi

Konsep ilmu ekonomi kelembagaan adalah nilai dalam penggunaan, sedangkan ekonomi neoklasik pada nilai pertukaran

Konsep ekonomi untuk ekonomi kelembagaan adalah Pendekatan kebudayaan, sedangkan ekonomi neoklasik mirip ilmu alam

Falsafah ekonomi kelembagaan adalah pra-dewey, sedangkan ekonomi neoklasik pasca-dewey

Tingkah laku ekonomi kelembagaan adalah behaviorist, sedangkan ekonomi neoklasik adalah percaya fre-will

Fokus ekonomi kelembagaan adalah keseluruhan, sedangkan ekonomi neoklasik adalah sebagian(particularist)

Metode ilmiah ekonomi kelembagaan adalah normatif, sedangkan ekonomi neoklasik adalah positivism

Data ekonomi kelembagaan adalah kebanyakan kualitatif, sedangkan ekonomi neoklasik adalah kuantitatif

Tokoh ekonomi kelembagaan adalah Thorstein Veblen dan John R Commons, sedangkan ekonomi neoklasik adalah Adam Smith dan Alfred Marshal

Sistem pada ekonomi kelembagaan adalah tertutup, sedangkan ekonomi neoklasik adalah terbuka

Visi ekonomi kelembagaan adalah mengarah statis, sedangkan ekonomi neoklasik adalah mengarah dinamis

Ekonometrik pads ekonomi kelembagaan dipakai secara baik dan menyeluruh, sedangkan ekonomi neoklasik tidak/kadang dipakai