WorksheetsBảng câu hỏi test đầu ra
Total questions: 10
Worksheet time: 10mins
Câu 1:
Cặp mồi nào hay được sử dụng để định danh loài nấm mốc khi sử dụng kỹ thuật PCR kết hợp giải trình tự gen
A. 16S rRNA
B. 18S rRNA
C. ITS1
D. ITS2
Câu 2:
Nêu thứ tự đúng (từ trái sang phải) và tiết kiệm thời gian nhất cho các bước tiến hành trong định danh vi sinh vật bằng kỹ thuật PCR kết hợp giải trình tự gen: (1) PCR trực tiếp từ khuẩn lạc; (2) Ủ qua đêm để nuôi cấy tạo khuẩn lạc; (3) Pha loãng và cấy trải mẫu vi sinh vật; (4) Điện di sản phẩm PCR; (5) Tinh sạch sản phẩm PCR; (6) Đặt mồi đoạn gen đặc hiệu; (7) Gửi mẫu giải trình tự DNA và nhận kết quả; (8) Blast trình tự trên ngân hàng gen NCBI; (9) Cắt ghép trình tự gen chiều xuôi-ngược để tạo đoạn gen hoàn chỉnh bằng phần mềm ApE;
A. 6, 3, 2, 1, 4, 5, 7, 9, 8
B. 3, 2, 6, 1, 4, 5, 7, 8, 9
C. 3, 2, 6, 1, 4, 5, 7, 9, 8
D. 6, 3, 2, 1, 4, 5, 9, 8, 7
Câu 3: Khi thực hiện kỹ thuật PCR-giải trình tự gen 16S rRNA của vi khuẩn, nếu xuất hiện hiện tượng multi-sequence (1 vị trí có 2-3 peaks xuất hiện) của trình tự 16S rRNA thì lý do có thể là:
A. Mẫu DNA bị RNA tạp nhiễm
B. Mẫu DNA bị nhiễm PCR-amplicon ngoại lai của 1 gen khác
C. Mẫu DNA bị nhiễm DNA của một chủng vi khuẩn khác.
D. Cả 3 phương án trên
Câu 4:
Khi căt ghép trình tự gen chiều xuôi-ngược để tạo đoạn gen hoàn chỉnh bằng phần mềm ApE, ta phải loại bỏ khoảng bao nhiêu Nucleotide ở đầu 5’ và 3’:
A. 10 nu
B. 30 nu
C. 50 nu
D. Tuỳ thuộc vào kết quả hình ảnh peak giải trình tự
Câu 5:
Khi 1 mẫu cấy trải xuất hiện 03 loại khuẩn lạc có hình thái khác nhau với mật độ tương đương nhau, bạn sẽ chọn bao nhiêu khuẩn lạc để tiến hành PCR và giải trình tự xác định loài khi thời gian phải trả mẫu khá gấp.
A. Chọn mỗi loại hình thái 01 khuẩn lạc
B. Chọn mỗi loại hình thái 03 khuẩn lạc
C. Chọn 03 khuẩn lạc có hình thái khuẩn lạc và khi nhuộm Gram, soi dưới kính hiển vi có tính chất gần với loài cần định danh nhất
D. Kết hợp phương án A và C
Câu 6:
Kỹ thuật real time PCR SYBR Green là gì?
A. Nhân gen tức thời sử dụng dye huỳnh quang SYBR Green phát quang khi gắn lên sợi DNA đích được tổng hợp
B. Nhân gen tức thời sử dụng trình tự probe huỳnh quang SYBR Green gắn đặc hiệu lên đoạn giữa của đoạn gen đích cần nhân lên
C. Nhân gen tức thời sử dụng dye huỳnh quang SYBR Green phát quang khi gắn lên sợi đôi DNA
D. Nhân gen tức thời sử dụng dye huỳnh quang SYBR Green phát quang khi Taq polymerase đang hoạt động.
Câu 7:
Tại sao khi định danh loài hay chi bằng kỹ thuật real time PCR, người ta hay dùng kỹ thuật real time PCR SYBR hơn là real time PCR Taqman probe? (có thể chọn nhiều đáp án)
A. Vì giá thành master mix rẻ hơn
B. Vì thời gian thí nghiệm ngắn hơn
C. Vì không dễ để thiết kế probe chung cho cả loài vì tính đa hình cao tại đoạn gen thiết kế
D. Vì PCR SYBR Green đặc hiệu hơn
Câu 8:
Khi thiết kế primer đặc hiệu cho loài vi khuẩn bằng phần mềm Snap Gene, cần lưu ý:
A. Tm của mồi xuôi và mồi ngược không khác biệt nhau 2oC, nên trong khoảng 55-60oC
B. Tm của mồi xuôi và mồi ngược không khác biệt nhau 2oC, nên trong khoảng 58-62oC
C. Tm của mồi xuôi và mồi ngược phải bằng nhau, nên trong khoảng 58-62oC
D. Tm của mồi xuôi và mồi ngược phải bằng nhau, nên trong khoảng 55-60oC
Câu 9:
Khi kết quả real time PCR SYBR Green của 03 khuẩn lạc B. subtilis cho giá trị Ct là 20, 30, và 32, bạn sẽ kết luận mẫu đó ntn?
A. Xác định Tm của cả 03 khuẩn lạc nếu nằm trong khoảng cho phép thì kết luận 2 khuẩn lạc dương tính và 1 khuẩn lạc là âm tính.
B. Xác định Tm của cả 03 khuẩn lạc nếu nằm trong khoảng cho phép thì cả 3 khuẩn lạc đều dương tính.
C. Kết luận luôn 2 khuẩn lạc dương tính và 1 khuẩn lạc âm tính.
D. Kết luận luôn 2 khuẩn lạc dương tính và 1 khuẩn lạc cần làm lại để kết luận.
Câu 10:
Khi xây dựng giá trị sử dụng của phương pháp của Lactobacillus sp., nếu cặp mồi bạn tham khảo không cho đường curve phát hiện chủng chuẩn của Lactobacillus lactis và, nhưng lại phát hiện được hầu hết các loài còn lại, cách tiếp cận nào dưới đây theo bạn là khả thi:
A. Bổ sung thêm cặp mồi đặc hiệu cho Lactobacillus lactis.
B. Thiết kế lại mồi suy biến làm sao gắn lên được cả loài Lactobacillus lactis
C. PCR và giải trình tự gen nếu có chỉ định làm chỉ tiêu Lactobacillus lactis
D. Phương án A và B đều đúng.
