WorksheetsDNA-sekventering
Total questions: 10
Worksheet time: 5mins
Bestemmelse af nukleotidrækkefølgen i DNA kaldes
amplificering
elongering
sekventering
denaturering
Ved tilføjelse af et nukleotid til en DNA-streng frigives
to sukkermolekyler
pyrofosfat og en proton
en nitrogenholdig base og et sukkermolekyle
en aminosyre og et iltmolekyle
Ved Sangersekventering anvendes
en flowcelle med 8 kanaler
mærkede dNTP’er
pH-målingmærkede ddNTP’er
mærkede ddNTP’er
Next generation Sequencing (NGS) er
synonymt med polymerase chain reaction
foreløbig kun relevant i forskningssammenhæng
en samlebetegnelse for flere forskellige teknikker til DNA-sekventering
baseret på kapillærelektroforese
Den komplementære streng til ATGGCTAGCC er
TGCCGTTACC
TACCGATCGG
TACGCATGCC
TACCGTACCC
Ved biblioteksfremstilling (library preparation) bliver DNA
fragmenteret og adapterligeret
udportioneret og fluorescensmærket
nedkølet til det absolutte nulpunkt
forsynet med ddNTP i både 5’-mærke- og 3’-enden
Et nukleotid består af
to baser forbundet af hydrogenbindinger
et sukkermolekyle, en eller flere fosfatgrupper og en base
en aminosyre, en eller flere fosfatgrupper og en base
en aminosyre, et sukkermolekyle og en base
Ved amplificering af DNA i en NGS-flowcelle
skal prøver fra forskellige patienter placeres i separate kanaler
anvendes enzymer, der umuliggør komplementær baseparring
dannes klonale klynger af DNA-strenge
udvikles så høj varme, at al væske fordamper
Med NGS kan man
fremstille proteinprodukter sideløbende med gensekventeringen
undvære kvalitetssikring, da teknologien er ufejlbarlig
kun sekventere DNA fra primater
sekventere et humant genom på under en uge
Ved Illumina dye sequencing bestemmes nukleotidsekvensen ved hjælp af
radioaktive prober
pH-måling
fluorescerende reversibelt terminerende nukleotider
impedansmåling
