Peptit zincirinin serbest amino ucu (N-terminali) sağa, serbest karboksil ucu (C-terminali) sola yazılır.

.................................... α-heliksi bozar çünkü ikincil amino grubu, α heliksin sağ spiraliyle geometrik olarak uyumlu değildir

Polar olmayan yan zincirlere sahip amino asitler, polipeptit molekülünün dış kısmında yer alma eğilimindedir.

Tüm amino asit dizileri, peptidin N-ucundan C-terminal ucuna kadar okunur.