Font size
WorksheetsMasalah: Identifikasi dan Deteksi Urutan Spesifik dalam Genom
Total questions: 99
Worksheet time: 50mins
Bagaimana kita mengidentifikasi dan mendeteksi urutan spesifik dalam genom?
Dengan menggunakan metode yang dapat membedakan urutan spesifik dari banyak urutan lain dan dapat mendeteksi jumlah DNA yang sangat kecil.
Dengan hanya mengamati bentuk fisik sel di bawah mikroskop.
Dengan mencampurkan semua DNA dan melihat hasil warnanya.
Dengan menghitung jumlah kromosom secara manual.
Sebutkan dua masalah besar dalam mendeteksi urutan spesifik dalam genom!
1. Banyak urutan lain dalam genom yang tidak ingin dideteksi (spesifisitas). 2. Jumlah DNA dalam sampel yang diinginkan sangat kecil (amplifikasi).
1. Semua urutan dalam genom mudah dideteksi. 2. Jumlah DNA dalam sampel selalu berlimpah.
1. Tidak ada urutan lain dalam genom yang mengganggu deteksi. 2. Proses deteksi selalu akurat tanpa amplifikasi.
1. Hanya satu jenis urutan yang ada dalam genom. 2. Semua sampel DNA memiliki jumlah yang sama.
Apa yang dimaksud dengan masalah spesifisitas dalam mendeteksi urutan DNA?
Spesifisitas adalah banyaknya urutan lain dalam genom yang tidak ingin dideteksi.
Spesifisitas adalah kemampuan mendeteksi semua urutan DNA secara acak.
Spesifisitas adalah proses memperbanyak urutan DNA tanpa seleksi.
Spesifisitas adalah kemampuan mendeteksi protein dalam sel.
Apa yang dimaksud dengan masalah amplifikasi dalam mendeteksi urutan DNA?
Amplifikasi adalah jumlah DNA dalam sampel yang sangat kecil sehingga sulit dideteksi.
Amplifikasi adalah proses pengurangan jumlah DNA dalam sampel.
Amplifikasi adalah teknik untuk mengubah urutan DNA menjadi RNA.
Amplifikasi adalah metode untuk menghancurkan DNA dalam sampel.
Isilah jumlah pasangan basa (bp) dalam genom Pinus: ________
68 miliar bp
3 miliar bp
12 miliar bp
23 miliar bp
Isilah jumlah pasangan basa (bp) dalam genom Kedelai: ________
1,1 miliar bp
500 juta bp
2,5 miliar bp
800 juta bp
Isilah jumlah pasangan basa (bp) dalam genom Manusia: ________
3,4 miliar bp
1,2 miliar bp
6,8 miliar bp
500 juta bp
Isilah jumlah pasangan basa (bp) dalam genom Lalat rumah:
900 juta bp
120 juta bp
3 miliar bp
1,5 miliar bp
Isilah jumlah pasangan basa (bp) dalam genom Padi:
400 juta bp
1,5 miliar bp
100 juta bp
3 miliar bp
Isilah jumlah pasangan basa (bp) dalam genom E. coli: ________
4,6 juta bp
1,2 juta bp
10 juta bp
500 ribu bp
Isilah jumlah pasangan basa (bp) dalam genom HIV: ________
9,7 ribu bp
3,2 juta bp
1,5 juta bp
100 ribu bp
Berapakah ukuran genom manusia dalam satuan bp?
3,4 miliar bp
340 juta bp
34 miliar bp
1,2 miliar bp
Jika basa-basa genom manusia ditulis dengan ukuran huruf standar 10-point pada pita pengukur, berapa panjang pita tersebut?
5.366 mil
500 mil
3,4 mil
4 kaki
Menemukan urutan 500bp dalam genom seperti menemukan bagian pita pengukur sepanjang berapa kaki?
4 kaki
40 kaki
0.4 kaki
14 kaki
Genom manusia terdiri dari 3,4 miliar pasangan basa.
True
False
Berapa banyak DNA yang dibutuhkan agar dapat terlihat pada gel agarosa dengan pewarna fluoresen?
10 ng
0,1 ng
100 ng
1 µg
Berapa berat satu pita produk DNA 500-bp?
660 g/mol.bp
340 g/mol.bp
1000 g/mol.bp
500 g/mol.bp
Berapakah nilai bilangan Avogadro?
6.02e23
3.01e22
1.23e24
9.11e20
Untuk dapat melihat pita DNA 500-bp pada gel agarosa, berapa banyak salinan (copies) DNA yang dibutuhkan?
1.8e10 copies
1.8e7 copies
1.8e13 copies
1.8e5 copies
Agar dapat melihat satu 'gen', DNA dalam sampel 100 sel harus dikalikan berapa kali?
180 juta kali
1 juta kali
10 ribu kali
500 ribu kali
Sebutkan dua masalah utama dalam mengidentifikasi atau mendeteksi urutan spesifik dalam genom!
1) Ada banyak urutan lain dalam genom yang tidak ingin dideteksi. 2) Jumlah DNA dalam sampel yang diinginkan sangat kecil.
1) Semua urutan dalam genom mudah dideteksi. 2) Jumlah DNA dalam sampel selalu berlimpah.
1) Tidak ada urutan lain dalam genom yang mengganggu deteksi. 2) Semua sampel DNA memiliki jumlah yang sama.
1) Urutan spesifik selalu mudah diidentifikasi. 2) Tidak ada masalah dengan jumlah DNA dalam sampel.
Apa solusi yang dapat mengatasi kedua masalah spesifisitas dan amplifikasi dalam deteksi urutan genom?
PCR (Polymerase Chain Reaction)
Elektroforesis Gel
Spektrofotometri
Kultur Sel
PCR dapat menyelesaikan masalah spesifisitas dan amplifikasi dalam deteksi urutan genom.
True
False
Sebutkan salah satu kegunaan PCR!
Deteksi DNA forensik
Mendeteksi suhu tubuh
Mengukur tekanan darah
Menentukan golongan darah
Sebutkan salah satu kegunaan PCR!
Identifikasi tanaman transgenik
Meningkatkan kadar protein dalam sel
Mengurangi kadar air dalam jaringan
Mengubah warna daun tanaman
Sebutkan salah satu kegunaan PCR!
Deteksi dan kuantifikasi infeksi virus
Mengukur tekanan darah
Menentukan golongan darah secara langsung
Mengobati infeksi bakteri
Sebutkan salah satu kegunaan PCR!
Kloning
Fotosintesis
Respirasi seluler
Fermentasi
Sebutkan salah satu kegunaan PCR!
Deteksi DNA kuno
Mendeteksi suhu tubuh
Mengukur tekanan darah
Menentukan golongan darah
Sebutkan salah satu kegunaan PCR!
Analisis ekspresi gen
Pengukuran tekanan darah
Menentukan golongan darah secara langsung
Mengukur kadar gula darah
Siapakah yang mengembangkan reaksi rantai polimerase (PCR) pada tahun 1983?
James Watson
Kary B. Mullis
Francis Crick
Rosalind Franklin
Apa fungsi utama dari teknik PCR?
Mengidentifikasi protein
Sintesis cepat fragmen DNA tertentu
Menghitung jumlah sel
Mengukur suhu tubuh
Dengan menggunakan teknik PCR, lebih dari satu miliar salinan DNA dapat disintesis dalam waktu beberapa jam.
Benar
Salah
Perusahaan manakah yang pertama kali mengkomersialkan proses PCR?
Cetus Corporation
Roche Diagnostics
Thermo Fisher Scientific
Bio-Rad Laboratories
Pada tahun berapakah Cetus menjual paten PCR ke Hoffman-La Roche?
1991
1985
1995
2000
Siapakah penemu proses sintesis DNA yang dikenal sebagai Polymerase Chain Reaction (PCR)?
James Watson
Francis Crick
Kary B. Mullis
Rosalind Franklin
Pada tahun berapakah Kary B. Mullis mengembangkan Polymerase Chain Reaction (PCR)?
1973
1983
1993
2003
Polymerase Chain Reaction (PCR) adalah teknik untuk ________ sintesis urutan DNA secara cepat.
proses
menghentikan
menghambat
mengurangi
mengacaukan
Kary B. Mullis menerima Nobel Kimia pada tahun ________ karena pengembangan PCR.
1993
1987
2001
1990
Mullis bekerja di perusahaan mana saat mengembangkan PCR?
A. Cetus Corporation
B. Genentech
C. Pfizer
D. Amgen
Setiap siklus PCR akan ________ jumlah DNA.
melipatgandakan
mengurangi
menstabilkan
menghilangkan
Siapakah yang mengkonseptualisasikan proses PCR pada tahun 1983?
Dr. Mullis
Dr. Watson
Dr. Crick
Dr. Sanger
Apa fungsi utama dari metode PCR menurut bacaan di atas?
Menghancurkan DNA
Memperbanyak untaian DNA secara cepat
Mengubah struktur gen
Mengidentifikasi protein
Menurut kutipan Dr. Mullis, PCR akan membantu dalam mendeteksi penyakit dengan cara apa?
Dengan mendeteksi gen patogen yang sulit atau tidak mungkin untuk dikultur.
Dengan mempercepat proses penyembuhan penyakit.
Dengan meningkatkan daya tahan tubuh secara langsung.
Dengan menggantikan fungsi antibiotik dalam pengobatan.
Menurut bacaan, PCR dapat memperbanyak untaian DNA hingga berapa kali lipat dalam beberapa jam?
Miliaran kali
Ratusan kali
Puluhan kali
Ribuan kali
Siapakah yang dikenal sebagai 'Mr. PCR'?
Ted Koppel
Kary B. Mullis
Seorang pemain baseball
Seorang bintang film
Menurut kutipan Ted Koppel di ABC's 'Nightline', siapakah yang lebih berpengaruh terhadap kesejahteraan umat manusia dibandingkan MVP olahraga, bintang film, dan pembawa acara TV?
Kary Mullis
Michael Jordan
Tom Hanks
Oprah Winfrey
Apa kekuatan utama metode PCR dalam forensik kriminal?
Mengidentifikasi golongan darah
Memperkuat DNA dari sampel kecil
Menyembuhkan penyakit
Mengubah pola DNA
DNA dari cairan tubuh, rambut, atau sampel jaringan lain diperkuat untuk menciptakan pola yang hampir unik untuk setiap individu. Pola ini kemudian dapat dibandingkan dengan ______ dalam kasus tersebut.
tersangka
saksi
hakim
pengacara
Kasus OJ Simpson adalah kasus pertama di mana teknik PCR menjadi sangat dipublikasikan. Benar atau Salah?
True
False
Apa tujuan utama penggunaan PCR dalam deteksi makanan GMO menurut teks?
Mengidentifikasi rasa makanan
Mengukur jumlah makanan yang dimodifikasi secara genetik dalam suatu pengiriman
Menentukan warna makanan
Mengawetkan makanan
Makanan yang dimodifikasi secara genetik (GMO foods) banyak dibudidayakan di _______ dan negara lain.
USA
Jepang
Brasil
India
Beberapa negara mengharuskan eksportir untuk menunjukkan persentase kandungan GMO dalam pengiriman makanan.
Benar
Salah
Apa kegunaan utama PCR dalam pengujian paternitas menurut teks?
Mengidentifikasi penyakit
Mengidentifikasi makeup genetik individu
Mengkloning organisme
Mengukur suhu tubuh
Dengan memperbanyak fragmen DNA spesifik dari orang tua atau kerabat dekat, apa yang dapat direkonstruksi menurut teks?
Kekerabatan antara individu
Jenis kelamin individu
Golongan darah individu
Usia individu
PCR hanya dapat digunakan untuk mengidentifikasi hubungan keluarga pada orang yang masih hidup.
True
False
Sebutkan salah satu penggunaan PCR dalam bidang arkeologi yang berkaitan dengan naskah kuno Laut Mati.
Rekonstruksi Naskah Laut Mati (Dead Sea Scrolls).
Analisis struktur logam pada artefak perunggu.
Penentuan umur batuan menggunakan metode radiokarbon.
Identifikasi pola ukiran pada tembikar kuno.
PCR dapat digunakan untuk identifikasi pigmen cat pada lukisan gua.
Benar
Salah
PCR digunakan untuk menentukan kekerabatan antara individu dalam ossuarium kuno.
Benar
Salah
Salah satu penggunaan PCR yang disebutkan adalah membangun dinosaurus dari darah yang diawetkan dalam spesimen amber. Benar atau salah?
Benar
Salah
Berdasarkan penjelasan pada gambar, mengapa PCR sangat penting dalam diagnosis penyakit modern?
Karena PCR sangat berharga dalam diagnosis penyakit modern.
Karena PCR hanya digunakan untuk penelitian tumbuhan.
Karena PCR tidak memerlukan enzim.
Karena PCR dapat menggantikan semua metode diagnosis lain.
Apa keunggulan PCR dibandingkan metode lain dalam mengidentifikasi organisme penyebab penyakit?
Mendeteksi protein organisme
Mendeteksi efek pada sistem imun
Mendeteksi DNA organisme
Mendeteksi RNA organisme
PCR dapat digunakan untuk mendiagnosis penyakit masa lalu dengan cara memperbanyak DNA terkait penyakit dari spesimen yang diawetkan.
Benar
Salah
Apa fungsi utama PCR dalam pengobatan penyakit?
Sebagai alat bantu dalam pengobatan penyakit dengan memantau jumlah virus sehingga terapi obat dapat disesuaikan.
Sebagai metode untuk menyembuhkan penyakit secara langsung.
Sebagai alat untuk meningkatkan sistem imun tubuh.
Sebagai pengganti antibiotik dalam pengobatan infeksi.
PCR real-time digunakan untuk memantau jumlah virus pada pasien HIV.
True
False
Apa kegunaan utama PCR dalam konservasi satwa liar?
Mengidentifikasi individu dan membedakan antara spesies dalam penelitian konservasi satwa liar.
Meningkatkan populasi satwa liar secara langsung di habitat aslinya.
Mengawetkan DNA satwa liar dalam jangka waktu lama tanpa kerusakan.
Mengurangi tingkat polusi di habitat satwa liar.
PCR dapat digunakan untuk memantau perdagangan produk yang terbuat dari spesies yang terancam punah. Benar atau Salah:
True
False
PCR dapat digunakan untuk memantau ekosistem untuk keberadaan spesies tertentu. Apa yang dapat dipantau dengan PCR dalam ekosistem?
Keberadaan spesies tertentu.
Perubahan suhu harian.
Jumlah air hujan bulanan.
Kecepatan angin rata-rata.
PCR bahkan dapat digunakan untuk memantau dan mengidentifikasi hewan secara individu! Apa salah satu kemampuan PCR dalam konservasi satwa liar?
Memantau dan mengidentifikasi hewan secara individu.
Mengubah genetik hewan secara langsung.
Mengawetkan spesimen hewan tanpa alat.
Meningkatkan populasi hewan secara otomatis.
Apa peran utama PCR kuantitatif dalam penelitian biologi?
Menentukan tingkat ekspresi gen.
Mengidentifikasi struktur protein.
Mengamplifikasi seluruh genom tanpa seleksi.
Mengukur aktivitas enzim secara langsung.
Berdasarkan diagram, urutkan alur analisis gen dari DNA hingga Biologi.
DNA → RNA → Enzim → Biologi
DNA → Enzim → RNA → Biologi
RNA → DNA → Enzim → Biologi
Enzim → DNA → RNA → Biologi
Apa kepanjangan dari GENEX Analysis yang disebutkan dalam gambar?
Analisis Ekspresi Gen (Gene Expression Analysis)
Analisis Genetik Eksternal (Genetic External Analysis)
Analisis Energi Gen (Gene Energy Analysis)
Analisis Genom Eksklusif (Exclusive Genome Analysis)
Manakah dari berikut ini yang merupakan komponen penting dalam analisis ekspresi gen menggunakan PCR?
Protein
DNA
Lemak
Karbohidrat
Cocokkan istilah berikut dengan penjelasannya:
Produk transkripsi dari DNA
B
Materi genetik utama
A
Studi tentang kehidupan
D
Katalis dalam reaksi biokimia
C
Apa fungsi buffer dalam reaksi PCR?
Menstabilkan DNA polimerase, DNA, dan nukleotida.
Menghambat aktivitas enzim restriksi.
Menguraikan DNA menjadi fragmen-fragmen kecil.
Menggantikan primer dalam reaksi.
Berapa konsentrasi KCl yang digunakan dalam buffer reaksi PCR?
500 mM
50 mM
5 mM
1000 mM
Berapa konsentrasi Tris-HCl dan pH yang digunakan dalam buffer reaksi PCR?
100 mM Tris-HCl, pH 8.3
50 mM Tris-HCl, pH 7.0
10 mM Tris-HCl, pH 6.5
200 mM Tris-HCl, pH 9.0
Sebutkan salah satu deterjen yang dapat digunakan dalam buffer reaksi PCR!
Triton X-100 atau Tween
SDS
NaCl
EDTA
Komponen apa saja yang terdapat dalam buffer reaksi PCR?
Air, buffer, KCl, Tris-HCl, Triton X-100 atau Tween
Air, NaCl, EDTA, glukosa, dan enzim amilase
Buffer, MgSO4, DNA ligase, dan RNA primer
Tris-HCl, NaOH, proteinase K, dan gliserol
Sebutkan salah satu komponen yang diperlukan dalam reaksi PCR!
Air (Water), Buffer, atau DNA template
Garam dapur (NaCl)
Minyak goreng
Asam cuka
Apa fungsi dari DNA template dalam reaksi PCR?
Mengandung wilayah yang akan diamplifikasi.
Sebagai sumber energi untuk reaksi PCR.
Mengatur suhu reaksi PCR.
Berfungsi sebagai enzim polimerase.
DNA template yang digunakan dalam PCR harus murni.
Benar
Salah
Apa yang harus bebas dari DNA template dalam reaksi PCR?
Inhibitor polimerase
dNTP
Primer
Buffer reaksi
Pernyataan berikut benar atau salah: Setiap DNA dapat digunakan sebagai DNA template dalam PCR.
True
False
Sebutkan empat komponen utama yang diperlukan dalam reaksi PCR!
Air, Buffer, DNA template, Primer
Air, Enzim, Glukosa, Protein
Buffer, RNA, Lipid, Primer
DNA template, Karbohidrat, Buffer, Lemak
Apa fungsi primer dalam reaksi PCR?
Primer berfungsi untuk menentukan ujung-ujung dari daerah DNA yang akan diamplifikasi.
Primer berfungsi sebagai enzim yang mempercepat reaksi PCR.
Primer berfungsi untuk memecah DNA menjadi fragmen-fragmen kecil.
Primer berfungsi sebagai sumber energi dalam reaksi PCR.
Pernyataan berikut benar atau salah: Primer pada PCR harus spesifik untuk ujung-ujung daerah yang diamplifikasi.
Benar
Salah
Apa yang harus diketahui tentang suhu annealing pada penggunaan primer dalam PCR?
Suhu annealing harus diketahui dan tergantung pada panjang primer, kandungan GC, dll.
Suhu annealing selalu sama untuk semua primer.
Suhu annealing tidak berpengaruh pada hasil PCR.
Suhu annealing hanya bergantung pada suhu ruangan.
Berapa panjang primer yang umum digunakan dalam PCR?
15-30 nt
5-10 nt
50-100 nt
100-200 nt
Konsentrasi primer yang digunakan dalam PCR biasanya berkisar antara ________ (pMol/ul).
0.1 – 1.0 uM
10 – 20 uM
5 – 10 mM
0.01 – 0.05 uM
Urutan berikut adalah contoh primer PCR: TACCCTGGATACGGTATGCTGACCCTTGACTACCGTA. Apakah pernyataan ini benar atau salah?
Benar
Salah
Salah satu komponen penting dalam reaksi PCR adalah _____
Air
Garam dapur
Minyak goreng
Gula pasir
Cuka
Isi bagian yang kosong: Untuk menjaga pH dan kondisi optimal dalam reaksi PCR digunakan _____
Buffer
Enzim
Primer
dNTP
Cetakan yang digunakan untuk memperbanyak DNA dalam reaksi PCR disebut _____?
Template DNA
Enzim polimerase
dNTPs
Primer
Molekul pendek yang menandai awal dan akhir segmen DNA yang akan diperbanyak dalam PCR disebut _____
Primer
Enzim ligase
Polimerase
Nukleotida
Isi bagian yang kosong: Bahan penyusun DNA baru yang diperlukan dalam reaksi PCR adalah _____?
Nukleotida
Enzim ligase
Asam amino
Lipid
Isi bagian yang kosong: Ion yang diperlukan sebagai kofaktor enzim dalam reaksi PCR adalah _____
Ion Mg++
Ion Na+
Ion Ca++
Ion K+
Isi bagian yang kosong: Enzim yang digunakan untuk memperbanyak DNA dalam reaksi PCR adalah _____
DNA Polimerase
Ligase
RNA Polimerase
Helikase
Sebutkan salah satu komponen yang diperlukan dalam reaksi PCR!
Air (Water)
Garam dapur (NaCl)
Minyak goreng
Cuka
Sebutkan salah satu komponen yang diperlukan dalam reaksi PCR!
Buffer
Glukosa
Asam amino
Lipid
