TP2 Bioinformatique

Le NCBI blast est une approche

• de modélisation

• de comparaison

Le NCBI blast permet de faire

• l'annotation structurelle et taxonomique

• l'annotation fonctionelle et structurelle

• l'annotation fonctionelle et taxonomique

La séquence qu'on veut étudier s'appelle

• séquence query

• séquence subject

• séquence d'étude

La séquence de la base de données qui correspond à la séquence query s'appelle

• séquence query

• séquence subject

• séquence d'étude

La similarité

• mesure de degré de l'alignement entre séquences​

• mesure la pertinence du score de l'alignement

• mesure de degré de ressemblance entre séquences​

Quel type de blast utilisé pour chercher une séquence de nucléotides dans une base de données de nucléotides?

• blastp

• blastn

• blastx

• tblastn

Quel type de blast utilisé pour chercher une séquence de protéines dans une base de données de protéines?

• blastp

• blastn

• blastx

• tblastn

La similarité entre séquences est démontrée par

• la e-value

• le max score

• le query cover

• l'identité

Le swissprot est une base de données

• de nucléotides

• de protéines

Un numéro d'accession est attribué à

• une séquence query

• une séquence présente dans une base de données