Sequenciação CF

Na sequenciação de Sanger, o que causa a terminação da cadeia de DNA?

• A incorporação de um deoxinucleótido (dNTP)

• A incorporação de um dideoxinucleótido (ddNTP)

• A DNA polimerase quando encontra o codão stop

• A desnaturação da dupla cadeia de DNA

A enzima responsável pela incorporação de dNTP é...

• DNA ligase

• DNA primase

• DNA helicase

• DNA polimerase

Indique a ordem correta dos seguintes procedimentos na sequenciação de Sanger.

A. Amplificação da sequência alvo de DNA por PCR

B. Separação de cadeias de DNA por tamanho em eletroforese capilar

C. Deteção de fluorescência com sensor

D. Purificação do produto de PCR para sequenciação

E. Controlo da amplificação com electroforese em gel de agarose

F. PCR com dNTPs e ddNTPs fluorescentes

G. Comparar com sequência de referência utilizando a BLAST

• A, B, C, D, E, F, G

• D, E, A, C, F, B, G

• A, E, D, F, B, C, G

• D, A, E, C, B, G, F

• A, D, E, C, B, F, G

 

Indique a ordem correta dos seguintes procedimentos na Next Generation Sequencing.

• Amplificação, Sequenciação, Preparação da biblioteca, Alinhamento, Análise de dados

• Preparação da biblioteca, Amplificação, Sequenciação, Geração de clusters, Análise de dados

• Preparação da biblioteca, Geração de clusters, Sequenciação, Alinhamento, Análise de dados

• Sequenciação, Construção da biblioteca, Amplificação, Alinhamento, Análise de dados

Indique quais das seguintes afirmações são verdadeiras.

• Illumina é um dos passos das técnicas de NGS

• O output das NGS designam-se por reads

• Após realizar uma NGS deve fazer-se sempre uma sequenciação de Sanger confirmatória

• Com técnicas NGS é possível sequenciar diferentes regiões genómicas em simultâneo

Depois de realizar uma NGS deve-se sempre realizar-se uma sequenciação de Sanger

• Verdadeiro

• Falso

Se eu quiser identificar variantes do gene da leptina nos estudantes da universidade, a técnica de sequenciação mais indicada é...

• Sanger

• NGS

Um indivíduo pertencente a uma família com historial de doença autossómica recessiva. De acordo com o cromatograma apresentado, indique quais das afirmações são verdadeiras.

^{Nota: Esta doença deve-se a uma mutação única e a sua localização foi devidamente identificada anteriormente, só temos uma amostra}

• É uma substituição de nucleótido

• É uma mutação homozigótica

• A identificação desta mutação foi realizada por técnicas de NGS

• É uma mutação missense

Esta SNP é...

• homozigótica

• heterozigótica

Considerando que a sequência de cima é a de referência e a de baixo é a mutada, indica quais das afirmações são verdadeiras. A sequência mutada...

• É uma SNP

• É uma duplicação

• É uma deleção

• Possui um cromossoma mais curto

• Possui um cromossoma mais longo