Nested PCR

Apa tujuan utama dari nested PCR?

• Memperpendek fragmen DNA

• Menggandakan RNA

• Meningkatkan spesifisitas amplifikasi DNA

• Menurunkan konsentrasi enzim

• Mengurangi siklus PCR

Pada nested PCR, berapa kali reaksi amplifikasi dilakukan?

• Satu kali

• Dua kali

• Tiga kali

• Empat kali

• Lima kali

Apa perbedaan utama antara PCR biasa dan nested PCR?

• Nested PCR menggunakan lebih sedikit enzim

• Nested PCR menggunakan dua set primer

• PCR biasa lebih spesifik

• Nested PCR memerlukan suhu lebih rendah

• Nested PCR tidak memerlukan denaturasi

Mengapa digunakan dua set primer dalam nested PCR?

• Untuk menurunkan konsentrasi DNA

• Untuk meningkatkan spesifisitas amplifikasi

• Untuk mempercepat proses amplifikasi

• Untuk meningkatkan suhu annealing

• Untuk menghemat enzim Taq polymerase

Pada tahap pertama nested PCR, primer yang digunakan disebut...

• Primer internal

• Primer eksternal

• Primer universal

• Primer tunggal

• Primer sekuensial

Pada tahap kedua nested PCR, primer yang digunakan adalah...

• Primer eksternal

• Primer nonspefisik

• Primer internal

• Primer campuran

• Primer universal

Apa keuntungan utama nested PCR dalam deteksi target DNA dengan jumlah rendah?

• Menambah jumlah dNTP yang diperlukan

• Meminimalkan amplifikasi fragmen non-target

• Mengurangi waktu reaksi

• Menurunkan kebutuhan untuk elektroforesis

• Mengubah DNA menjadi RNA

Apa risiko utama jika primer eksternal dan primer internal terlalu mirip dalam nested PCR?

• Terjadi reaksi yang terlalu spesifik

• Munculnya amplifikasi non-spesifik

• Terjadinya denaturasi prematur

• Tidak terbentuknya DNA baru

• Terjadinya mutasi primer

Dalam nested PCR, bagaimana cara menentukan lokasi primer internal dibandingkan primer eksternal?

• Primer internal berada di luar daerah target primer eksternal

• Primer internal berada di dalam daerah target primer eksternal

• Primer internal berada di sebelah primer eksternal

• Primer internal dan eksternal terletak di tempat yang sama

• Primer internal ditempatkan secara acak

Dalam nested PCR, pada siklus kedua biasanya menggunakan produk amplifikasi dari...

• Reaksi awal sebagai template

• dNTP sebagai template

• Primer eksternal sebagai template

• Buffer sebagai template

• Hasil elektroforesis sebagai template