Cuestionario de Opción Múltiple: Alineamientos de Secuencias

¿Cuál es la diferencia fundamental entre identidad y homología?

• La identidad se basa en similitud exacta, la homología en origen evolutivo

• La identidad es cualitativa y la homología cuantitativa

• La homología se basa en funciones bioquímicas idénticas

• Ambas son equivalentes en bioinformática

¿Qué algoritmo se utiliza comúnmente para alineamientos globales?

• Needleman-Wunsch

• Smith-Waterman

• BLAST

• MUSCLE

¿Qué caracteriza a un alineamiento local?

• Encuentra regiones de alta similitud dentro de secuencias

• Alinea las secuencias completas

• Ignora las penalizaciones por gaps

• Usa matrices de puntos sin programación dinámica

¿Cuál es la función de una matriz de puntos (dot plot)?

• Visualizar similitudes entre secuencias

• Calcular el porcentaje de identidad

• Determinar la tasa de mutaciones

• Seleccionar las mejores secuencias para alinear

¿Qué representa un PAM250 comparado con un PAM1?

• Una mayor divergencia evolutiva

• Una mayor similitud entre secuencias

¿Qué significa BLOSUM62?

• Matriz basada en bloques con al menos 62% de identidad

• Matriz utilizada solo para secuencias idénticas

• Modelo evolutivo a 62 generaciones

• Secuencias con máximo 62 residuos

¿Cuál es la penalización más alta en alineamientos con gaps?

• Gap opening

• Gap extension

• Mismatch

• Match

¿Qué tipo de algoritmo utiliza BLAST?

• Heurístico

• Determinístico

• Bayesiano

• Estocástico

¿Cómo funciona BLAST en esencia?

• Busca pequeñas coincidencias y las extiende

• Compara todas las posiciones posibles

• Alinea solo los extremos de las secuencias

• Elimina todas las secuencias con mismatch

¿Qué herramienta realiza alineamientos múltiples de forma iterativa?

• MUSCLE

• BLAST

• Clustal Omega