Jenis-Jenis PCR_Pert2

Apa prinsip dasar dari konvensional PCR (Polymerase Chain Reaction)?

• Amplifikasi DNA target menggunakan enzim Taq polymerase
• Sintesis protein dengan DNA template
• Analisis struktur protein dengan PCR
• Deteksi RNA tanpa konversi
• Pemetaan genetik langsung

Manakah dari berikut ini yang merupakan aplikasi umum dari konvensional PCR?

• Pemotongan DNA menggunakan enzim restriksi
• Mendeteksi RNA virus langsung
• Identifikasi koloni bakteri
• Identifikasi spesies jamur
• Kloning molekuler

Apa kelemahan utama dari konvensional PCR dibandingkan dengan qPCR dan digital PCR?

• Mengukur ekspresi gen
• Tidak bisa digunakan pada RNA
• Tidak bisa mendeteksi ekspresi gen
• Butuh elektroforesis gel untuk visualisasi
• Sulit mendeteksi kuantitas DNA

Berapa jumlah siklus termal umum yang digunakan dalam konvensional PCR?

• 1-2 siklus
• 10-15 siklus
• 25-35 siklus
• 50-60 siklus
• 70-100 siklus

Mengapa pewarna interkalasi seperti EtBr digunakan dalam konvensional PCR?

• Sebagai buffer reaksi
• Untuk mendinginkan reaksi
• Mendeteksi hasil amplifikasi dengan sinyal fluoresen
• Mempercepat reaksi amplifikasi
• Sebagai primer dalam reaksi

Apa tujuan utama dari nested PCR dibandingkan dengan konvensional PCR?

• Meningkatkan sensitivitas dan spesifisitas
• Meningkatkan kecepatan amplifikasi
• Mengurangi waktu elektroforesis
• Menghasilkan produk RNA dari DNA
• Mendeteksi kontaminan dalam reagen

Bagaimana cara kerja nested PCR?

• Menggunakan dua pasang primer secara berurutan
• Menggunakan primer dengan panjang berbeda
• Menggunakan enzim tambahan
• Dilakukan dalam dua tahap PCR berurutan
• Menggunakan primer dan probe

Manakah berikut ini yang merupakan risiko teknis pada nested PCR?

• Risiko kontaminasi silang tinggi
• Risiko hasil positif palsu menurun
• Lebih mudah dirancang
• Reagen lebih mahal
• Kesalahan pipet sering terjadi

Kelebihan utama nested PCR adalah...

• Lebih cepat dan efisien
• Tidak memerlukan elektroforesis
• Membutuhkan banyak RNA
• Menghindari kebutuhan primer
• Reagen lebih murah

Nested PCR ideal digunakan untuk mendeteksi...

• DNA dalam jumlah sangat sedikit
• Protein target
• Plasma darah manusia
• RNA yang stabil
• RNA total