Quiz tentang Sequencing DNA 2

Apa arti dari istilah sequencing dalam biologi molekuler?

• Sintesis DNA baru

• Menentukan urutan basa genetik

• Memperbanyak DNA dengan PCR

• Mendeteksi mutasi genetik

• Mengisolasi DNA dari sampel

Siapa penemu metode chain termination untuk DNA sequencing?

• James Watson

• Allan Maxam

• Walter Gilbert

• Frederick Sanger

• Rosalind Franklin

Metode Maxam-Gilbert dalam DNA sequencing menggunakan prinsip…

• Enzim polimerase

• ddNTP berfluoresen

• Reaksi kimia pemotongan DNA

• Pori protein nanopore

• Enzim ligase

Fungsi ddNTP dalam metode Sanger adalah…

• Menghasilkan sinyal fluoresen

• Menghentikan perpanjangan rantai DNA

• Menstabilkan primer

• Menjaga kestabilan enzim

• Mengikat adaptor

Proyek genom manusia (Human Genome Project) selesai pada tahun…

• 1987

• 1996

• 2000

• 2003

• 2010

Generasi pertama DNA sequencing adalah…

• NGS

• Maxam-Gilbert

• Sanger sequencing

• Pyrosequencing

• Nanopore sequencing

Keunggulan utama metode Sanger adalah…

• Biaya rendah untuk genom besar

• Membaca fragmen sangat panjang (>1 Mb)

• Akurasi sangat tinggi (~99,99%)

• Bisa digunakan untuk metagenomik

• Membaca jutaan fragmen paralel

Kelemahan utama metode Sanger sequencing adalah…

• Hasil sulit dianalisis

• Tidak akurat

• Tidak bisa digunakan untuk DNA

• Mahal dan lambat untuk genom besar

• Tidak dapat digunakan untuk RNA

Teknologi Illumina termasuk dalam generasi sequencing ke…

• 1

• 2

• 3

• 4

• 5

Prinsip dasar Illumina sequencing adalah…

• Chain termination

• Sequencing by synthesis

• Sequencing by ligation

• Nanopore detection

• Pyrosequencing