WorksheetsBiologia molekularna - SYLABUS 1
Total questions: 54
Worksheet time: 27mins
W nukleozydach wiązanie o konfiguracji beta znajduje się między:
węglem typu pirolowego nukleozasady, a fosforem anomerycznym pierścienia cukrowego.
azotem typu pirolowego nukleozasady, a azotem anomerycznym pierścienia cukrowego
azotem typu pirolowego nukleozasady, a węglem anomerycznym pierścienia cukrowego
węglem typu pirolowego nukleozasady, a azotem anomerycznym pierścienia cukrowego
W reakcji PCR-multipleks:
Wybierz jedną odpowiedź:
dochodzi do amplifikacji jednej matrycy podczas jednej reakcji PCR.
dochodzi do amplifikacji wielu matryc podczas jednej reakcji PCR
nie są wykorzystywane zestawy starterów.
dochodzi do rozdziału fragmentów DNA w żelu agarozowym
Długość skrętu w cząsteczce A- DNA wynosi:
4,6 nm
2,5 nm
3,4 nm
2 nm
Wskaż zdanie błędnie opisujące ekstrakcję DNA metodą fenolowo chloroformową:
faza wodna zawiera plazmidowe DNA
zdenaturowane białka tworzą osad na granicy fenol - woda
fenol powoduje denaturację białek
fenol nie powoduje denaturacji białek
Aby uniemożliwić transformację bakterii nie zjadliwych należy przed podaniem ekstraktu z martwych bakterii zjadliwych poddać go działaniu:
lipazy
proteazy
deoksyrybonukleazy
rybonukleazy
Enzymy, które degradują DNA, katalizują hydrolizę wiązań kowalencyjnych łączących nukleotydy. Co sie stanie z potraktowanymi cz. DNA?
wszystkie zasady zostaną oddzielone od cz. deoksyrybozy
puryny zostaną oddzielone od cz. deoksyrybozy
w. fosfodiestrowe pomiędzy cz. deoksyrybozy zostaną rozerwane
dwie nici podwójnej helisy DNA rozdzielają się
Założywszy, że mutacja wykrywana techniką RFLP wprowadza miejsce restrykcyjne, które pojawi się tylko raz w amplifikowanym fragmencie DNA, to analizowany wzorzec prążków na żelu agarozowym w przypadku homozygoty typu dzikiego będzie następujący:
3 prązki będące odpowiednio nie pociętym frag.DNA oraz dwa kolejne będące produktami cięcia
4 prążki będące produktem nie pociętym reakcji PCR oraz 3 kolejne będące produktami cięcia
2 prążki będące produktem cięcia restrykcyjnego całego produktu PCR
1 prążek będący nie pociętym produktem PCR
Ekspresja sklonowanego genu eukariotycznego w kom. bakterii obejmuje wiele wyzwań. Wykorzystanie mRNA i odwrotnej transkryptazy jest częścią strategii będącej rozwiązaniem problemu:
obróbki posttranslacyjnej
hybrydyzacji kwasów nukleinowych
obróbki posttranskrypcyjnej
elektroporacji
.NIEPRAWDZIWE dla cDNA wyprodukowanego z wykorzystaniem tk. ludzkiego mózgu jako materiału wyjściowego?
może ulegać amplifikacji przy zastosowaniu PCR
wykorzystywany może być do utworzenia kompletnej biblioteki genomowej
może powstawać na matrycy mRNA przy użyciu odwrotnej transkryptazy
używany może być jako sonda służąca do wykrywania genów ulegających ekspresji w mózgu
. Zgodnie z zasadą komplementarności zasad azotowych:
guanina łączy się z cytozyną wiązaniem podwójnym
adenina łączy się z tyminą wiązaniem potrójnym
guanina łączy się z cytozyną wiązaniem potrójnym
adenina łączy się z guaniną wiązaniem podwójnym
Forma B-DNA ma:
jeden rowek i 11 par zasad przypadających na pełen skręt heliksu
trzy rowki i 9,3 par zasad przypadających na pełen skręt heliksu
dwa rowki i 10 par zasad przypadających na pełen skręt heliksu
12 par zasad przypadających na pełen skręt heliksu oraz nie posiada rowków
Po ekstrakcji fenol/chloroform
DNA znajduje się w fazie wodnej a zdenaturowane białka na granicy faz
DNA znajduje się na granicy faz a zdenaturowane białko w fazie wodnej
DNA znajduje się w fazie organicznej a zdenaturowane białka na granicy faz
DNA znajduje się na granicy faz a zdenaturowane białka w fazie organiczne
Wskaż zdanie BŁĘDNE opisujące enzymy restrykcyjne
sekwencje rozpoznane przez enzymy restrykcyjne są krótsze (4-8 pz)
sekwencje rozpoznane przez enzymy restrykcyjne zawsze są długie
miejsca rozpoznawane przez enzymy restrykcyjne zawsze są długie
trawienie odbywa się albo w obrębie tej sekwencji, albo w jej sąsiedztwie
Wskaż zdanie POPRAWNE opisujące metodę Real-Time qPCR:
wynik niezależny od fazy plateau
detekcja produktu odbywa się po zakończeniu reakcji
wynik otrzymany jest w fazie plateau
wzrost sygnału fluorescencji jest odwrotnie proporcjonalny do liczby amplifikowanych fragmentów
Na załączonym zdjęciu widać rozdział elektroforetyczny wykonywany w technice PCR-RFLP. Założywszy, że w stosowanej metodzie RFLP mutacja likwiduje miejsca restrykcyjne, która ścieżka będzie odpowiadać heterozygocie?
5
2
1,3,4
nie można stwierdzić na podstawie zdjęcia
: Kierunek skrętu cząsteczki B-DNA jest:
lewoskrętny
prawoskrętny
brak skrętu
zarówno prawo jak i lewo skrętny
Średnica cząsteczki B-DNA wynosi:
1.8 nm
2,37 nm
2,0 nm
1,5 nm
Doświadczenie Oswalda Avery`ego i współpracowników (1943r)
Polegało na zastosowaniu znakowania bakteriofagów izotopami a następnie infekowaniu bakterii
Ukazało skład chemiczny dna
dostarczyło pierwszego bezpośredniego dowodu na to, że DNA jest odpowiedzialne za transformację bakterii
Ukazało strukturę przestrzenną kwasów nukleinowych
Wskaż zdanie nieprawidłowe dotyczące wiązania Hoogsteena:
Powstają pomiędzy zasadami azotowymi o różnych konformacjach (syn-anty) dwóch
Warunkiem koniecznym do wytworzenia tego wiązania jest występowanie komplementarnych dwuniciowych traktów polipuryno pirmidynowych
występują w cząsteczce DNA i uniemożliwiają tworzenie się form wieloniciowych DNA
umożliwia ono tworzenie się w cząsteczce DNA form wieloniciowych
Heterocykliczne zasady w DNA to:
puryny: adenina i cytozyna pirymidyny: guanina i tymina
puryny: adenina i guanina pirymidyny cytozyna i tymina
puryny: adenina i tymina; pirymidyny: cytozyna i guanina
puryny: adenina i guanina; pirymidyny: cytozyna, tymina i uracyl
Nukleotyd składa się z:
Reszty fosforanowej, pierścienia cukrowego złożonego z 8 atomów węgla i zasady azotowej
Reszty fosforanowej, pierścienia cukrowego i zasady azotowej (pirymidyny lub puryny)
Reszty fosforanowej i zasady azotowej
Pentozy i zasady azotowej (pirymidyny lub puryny)
Do metod badania DNA NIE należy
Hybrydyzacja Southern Blot
Sekwencjonowanie metodą Edmana
Sekwencjonowanie metodą Sangera
DNA fingerprinting
W metodzie FISH:
hybrydyzacja sondy fluorescencyjnej pozwala bezpośrednio wykryć fragment DNA na chromosomie
hybrydyzacja sondy fluorescencyjnej pozwala wykryć fragmenty DNA na membranie nylonowej
hybrydyzacja sondy radioaktywnej pozwala bezpośrednio wykryć fragment DNA na chromosomie
hybrydyzacja sondy radioaktywnej pozwala wykryć fragmenty DNA na membranie nylonowej
Lewoskrętna helisa to struktura DNA typu:
B-DNA
Z-DNA
A-DNA
H-DNA
W metodzie hybrydyzacji Southerna
DNA na membranie nylonowej jest inkubowany ze swoistymi przeciwciałami
RNA na membranie nylonowej jest hybrydyzowany z sondą RNA
RNA na membranie nylonowej jest inkubowany ze swoistymi przeciwciałami
DNA na membranie nylonowej jest hybrydyzowany z sondą DNA
Enzymy, które degradują DNA, katalizują hydrolizę wiązań kowalencyjnych łączących nukleotydy. Co sie stanie z potraktowanymi cz. DNA?
wszystkie zasady zostaną oddzielone od cz. deoksyrybozy
puryny zostaną oddzielone od cz. deoksyrybozy
w. fosfodiestrowe pomiędzy cz. deoksyrybozy zostaną rozerwane
dwie nici podwójnej helisy DNA rozdzielają się
. Ekspresja sklonowanego genu eukariotycznego w kom. bakterii obejmuje wiele wyzwań. Wykorzystanie mRNA i odwrotnej transkryptazy jest częścią strategii będącej rozwiązaniem problemu:
obróbki posttranslacyjnej
obróbki posttranskrypcyjnej
hybrydyzacji kwasów nukleinowych
elektroporacji
Wstrzyknięcie myszom mieszaniny martwych bakterii zjadliwych (zabitych przez podgrzanie) i żywych niezjadliwych spowoduje, że:
powstanie hybryda zawierająca część DNA myszy a część bakterii
myszy zachorują
myszy będą zdrowe
martwe bakterie ożyją
echnika znana pod nazwą łańcuchowa reakcja polimerazy (PCR) jest w stanie wyprodukować miliony kopii cząsteczki DNA w zaledwie kilka godzin. Który z poniższych komórkowych procesów jest najbardziej podobny do PCR?
Mitoza
Translacja
Replikacja
Transkrypcja
Załóż, że posiadasz roztwory dwóch różnych białek o tym samym stężeniu i mierzysz ich absorbancję przy długości fali 280 nm to, najprawdopodobniej:
wartości ich absorbancji będą dokładnie takie same, ponieważ absorbancja zależy m.in. od ilości wiązań peptydowych
wartości ich absorbancji będą dokładnie takie same, ponieważ skład aminokwasowy białka nie ma wpływu na absorbancję
wartości absorbancji będą się różnić w zależności od składu aminokwasowego
wartości absorbancji będą różne, ponieważ absorbancja zależy od ilości wiązań peptydowych
Zjawisko tworzenia dwuniciowych kompleksów pomiędzy komplementarnymi, jednoniciowymi odcinkami kwasów nukleinowych, nosi nazwę:
denaturacji
restrykcji
hybrydyzacji
klonowania
W hydrolitycznej deaminacji, adenozyna zostaje zamieniona na:
glukagon
inozytol
inozynę
cytozynę
. Nukleozyd to:
zasada azotowa połączona z resztą kwasu fosforowego wiązaniem peptydowym z pentozą
zasada azotowa połączona wiązaniem peptydowym z pentozą
zasada azotowa połączona z resztą kwasu fosforowego wiązaniem beta-N-glikozydowym z pentozą
zasada azotowa połączona wiązaniem beta-N-glikozydowym z pentozą
Do konformacji tworzonych przez RNA NIE ZALICZA SIĘ:
struktury czteroniciowej
struktury dwuniciowej
struktury szpilki do włosów
pętli wewnętrznej
Wskaż zdanie PRAWIDŁOWE. Enzym restrykcyjny to:
Enzym blokujący reakcję PCR
Enzym przepisujący informację genetyczną z DNA na RNA
Enzym rozcinający łańcuch DNA tylko w jednym specyficznym dla siebie miejscu, wyznaczonym sekwencją nukleotydów
Enzym sklejający wolne końce nici DNA
Gen kodujący nukleazę usuwającą startery RNA uczestniczące w replikacji został w komórce zmutowany. Komórka próbuje dokonać replikacji DNA. Jakie produkty DNA powstałyby w wyniku takiej próby?
Replikacja DNA ulegnie zatrzymaniu, ponieważ nie potrafi rozplatać przed sobą dwuniciowej helisy DNA. Powstałoby bardzo niewiele nowego DNA.
Replikacja się nie odbędzie. W miejscu replikacji zostaną utworzone startery RNA.
Fragmenty RNA pozostawałyby kowalencyjnie złączone z nowo replikowanym DNA. Nie dochodziłoby do ligacji, ponieważ ligaza DNA nie może łączyć DNA z RNA. Nić opóźniona składałaby się z fragmentów zarówno DNA jak i RNA.
Nie powstawałyby startery RNA ani na nici wiodącej, ani na opóźnionej. Replikacja DNA nie może się rozpocząć.
Poniżej przedstawiono schematycznie wzór prążków otrzymanych metodą RFLP próbki zebranej z miejsca zbrodni (K) i trzech próbek pobranych od potencjalnych sprawców (1,2,3). Wskaż, który z podejrzanych jest sprawcą.
3
1
2
żaden
Białko u E.coli wchodzące w skład kompleksu preinicjacyjnego procesu replikacji, którego funkcją jest działalność enzymatyczna odpowiedzialna za przerywanie wiązań wodorowych łączących nukleotydy w pary zasad to:
DNA A
DNA B
DNA C
Topoizomeraza
Enzym restrykcyjny
ułatwia łączenie fragmentów DNA
rozpoznaje i przecina tylko określone sekwencje nukleotydowe w cząsteczce DNA
potrafi zreplikować dwuniciową cząsteczkę DNA
jest używany w trakcie hybrydyzacji southern blot
stosując metodę izolacji DNA z wykorzystaniem fenolu i chloroformu w fazie wodnej znajdziemy
RNA
RNA i lipidy
białka
DNA
wskaż zdanie prawidłowe. dwuniciowa helisa DNA
składa się z dwóch łańcuchów DNA biegnących równolegle i będących do siebie komplementarnymi
składa się z dwóch antyrównoległych i komplementarnych nici DNA połączonych ze sobą wiązaniami wodorowymi
składa się z dwóch łańcuchów DNA połączonych ze sobą wiązaniami kowalencyjnymi
jest zawsze prawoskrętna
metodą analizy DNA wykorzystującą enzymy restrykcyjne jest
FISH
sekwencjonowanie Sangera
RFLP
Western Blot
Wskaż zdanie opisujące strukturę Z-DNA:
występują w niej wiązanie B -N-glikozydowe wyłącznie w konformacji SYN
jest lewoskrętna, długa i wąska a na jeden skręt przypada 12 par zasad
jest prawoskrętna, węższa i dłuższa w porównaniu dla struktury kanonicznej DNA, na jeden skręt przypada 12 par zasad
jest lewoskrętna, szersza i krótka w porównaniu do struktury kanonicznej DNA, na jeden skręt przypada 10 par zasad
jony wchodzące w skład mieszaniny reakcyjnej reakcji PCR, wymagane do prawidłowej aktywności polimerazy DNA to:
jony sodu
jony magnezu
jony baru
jony chloru
Mikomacierze RNA dostarczają nam informacji o :
zmianach w ilości DNA w jądrze
ilości białek w komórce
mutacjach punktowych w DNA
profilach jakościowej i ilościowej ekspresji genów
W metodzie mikromacierzy:
do badanego niewyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond
do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się wyznakowany DNA badany
do badanego wyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond
do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się nie wyznakowany DNA badany
Metoda RFLP wykorzystuje:
enzymy restrykcyjne
dideoksynukleotydy
hybrydyzację fluorescencyjnych sond
antyciała
W pirosekwencjonowaniu używa się:
polimerazy DNA, lucyferazy, apirazy
hydrazyny, piperydyny i siarczanu dimetylu
polimerazy DNA, lucyferazy, trifosforanów dideoksynukleotydów
lucyferazy, sulfurazy ATP i fluorochromu
. Ilość par zasad przypadająca na skręt w cząsteczce B-DNA wynosi:
11
12
13
10
Metoda RFLP wykorzystuje:
antyciała
enzymy restrykcyjne
hybrydyzacje fluorescencyjnych sond
dideoksynukleotydy
Mikromacierze RNA dostarczają nam informacji o:
ilości białek w komórce
zmianach w ilości DNA w jądrze
mutacjach punktowych w DNA
profilach jakościowych i ilościowej ekspresji genów
W pirosekwencjonowaniu używa się:
polimerazy DNA, lucyferazy i apirazy
hydrazyny, piperydyny i siarczanu dimetylu
lucyferazy, sulfurazy ATP i fluorochromu
polimerazy DNA, lucyferazy i trifosforanów dideonukleotydów
W metodzie mikromacierzy:
do badanego wyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond
do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się niewyznakowany DNA badany
do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się wyznakowany DNA badany
do badanego niewyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond
Ilość par zasad przypadająca na skręt w cząsteczce B-DNA wynosi:
10
11
12
13
