wayground logo

Free Printable Worksheets

Font size

S
M
L
XL
Worksheets

DM II (Praktikum)

Total questions: 25

Worksheet time: 28mins

Name
Class
Date
1.

Berikut yang termasuk hal hal yang harus diperhatikan dalam mendesain primer, KECUALI...

a)

Panjang primer

b)

Suhu Temperatur Melting

c)

GC Content

d)

Suhu Annealing

e)

Suhu primer

2.

Dalam pencarian format fasta , all database diganti menjadi ...

a)

Nucleotide

b)

Gene

c)

Gene

d)

Protein

e)

Pick primer

3.

Berdasarkan grafic tersebut berapa pasang primer yang terbentuk ...?

a)

10

b)

9

c)

8

d)

7

e)

6

4.

Pada gambar tersebut, keterangan panjang produk PCR ditunjukkan oleh ...

a)

A

b)

B

c)

C

d)

D

e)

E

5.

GCA TGT CTT ATA TGC AGG

Tulislah basa komplementer dari sequence tersebut ...

(a)  

6.

GCA TGT CTT ATA TGC AGG

Terjemahkan menjadi primer reverse sequence tersebut ...

(a)  

7.

Perbedaan prosedur pembuatan pohon fenetik menggunakan data fenotipik dan data profil sidik jari molekular adalah ?

a)

Diagram representativ

b)

Penyiapan data menggunakan PFE

c)

Jumlah data

d)

Format tabel nxt

e)

Analisis data menggunakan MVSP

8.

Data yang bisa kita gunakan dalam membuat pohon filogenetik adalah ...

a)

Hasil sequencing PCR

b)

Hasil RAPD

c)

Hasil RFLP

d)

Data pengamatan Morfologi bakteri

e)

Data pengamatan profil pita DNA

9.

Pada tabel nxt , n dan t adalah ...

a)

n adalah OTU,

t adalah karakter

b)

n adalah karakter,

t adalah OTU

c)

n adalah jumlah data positif,

t jumlah data negatif

d)

n adalah jumlah data negatif,

t jumlah data positif

e)

n adalah simbol angka, t n adalah simbol abjat

10.

Preparasi sampel data dalam matriks nxt menggunakan program PFE, sampel disimpan dalam format ?

a)

.txt

b)

.mvs

c)

.pfe

d)

.meg

e)

.psp

11.

Program yang digunakan untuk mengolah hasil sequencing DNA menjadi format fasta adalah ?

a)

Bioedit

b)

NCBI

c)

MVSP

d)

PFE

e)

MEGA

12.

Setelah mengolah data sequence menjadi format fasta, langkah apa yang harus dilakukan selanjutnya ?

a)

Blast menggunakan NCBI

b)

Analisis contiq menggunakan bioedit

c)

Mencari sequence dengan genus yang sama

d)

Penyiapan data dengan menggunakan PFE

e)

Pembuatan pohon filogenetik

13.

Pengambilan data sequence dapat dilakukan pada basa ?

a)

110

b)

120

c)

130

d)

140

e)

150

14.

Pensejajaran format fasta hasil sequencing dilakukan dengan program ...

a)

Nucleotida BLAST

b)

BLASTX

c)

TBLASTN

d)

Protein BlAST

15.

Pada gambar diagram representativ ini berapa jumlah karakter yang bisa dimasukkan dalam tabel nxt ?

a)

7

b)

5

c)

6

d)

8

e)

9

16.

Terjemahkan kedalam tabel nxt

4 lines
17.

Pembuatan pohon filogenetik menggunakan program MEGA, data disejajarkan menggunakan ?

a)

Alignment

b)

Alignment by ClustalW

c)

Alligment by ClustalW(with codons)

d)

Alignment by Muscle

e)

Allignment with NCBI

18.

Pembuatan pohon filogenetik menggunakan program MEGA, setelah data disejajarkan maka langkah selanjutnya adalah ?

a)

Analisis contiq

b)

Menyamakan ukuran DNA pada semua sequence

c)

Memotong basa pertama pada semua sequence

d)

Mengahapus semua data yang tidak digunakan

e)

Membuat pohon fologenetik

19.

Fungsi enzim restriksi adalah ...

a)

Memotong DNA pada lokasi yang spesifik

b)

Mendegradasi sequence DNA

c)

Mempercepat reaksi PCR

d)

Membantu proses isolasi DNA

20.

Bagaimana kita dapat mengetahui apabila hasil PCR kita posistif/berhasil ?

a)

Dengan cara membandingkan pita DNA yang kita dapatkan dengan DNA marker

b)

Dengan cara membandingkan pita DNA yang kita dapatkan dengan DNA marker

c)

Dengan cara membandingkan pita DNA yang kita dapatkan dengan DNA marker

d)

Dengan cara membandingkan pita DNA yang kita dapatkan dengan pita target dari primer yang kita gunakan

21.

Pada alat yang digunakan untuk proses amplifikasi DNA, ada beberapa kondisi yang harus kita setting. Dibawah ini yang bukan kondisi tersebut adalah...

a)

Innitial denaturation

b)

Denaturation

c)

Annealing

d)

Extention

e)

Pra extention

22.

Format fasta didapatakan melalui serangkaian prosedur, berikut yang bukan termasuk serangkaian prosedur tersebut adalah ...

a)

Isolasi DNA

b)

Polymerase Chain Reaction

c)

Sequencing DNA

d)

Elektroforesis

e)

Tidak ada jawaban yang benar

23.

Sequence pada cromatogram diwakili oleh peak peak dengan warna yang berbeda beda. Basa Timin diwakili oleh peak dengan warna...

a)

Merah

b)

Hijau

c)

Hitam

d)

Biru

24.

Query pada hasil Blast pada NCBI merupakan...

a)

Sequence yang kita upload

b)

Sequence database NCBI

c)

Identitas sequence pada NCBI

d)

Identitas sequence yang kita miliki

25.

Nilai E value pada sequence setelah BLAST, diakatakan baik jika...

a)

Nilainya semakin kecil semakin baik

b)

Nilainya semakin besar semakin baik

c)

Nilainya sama dengan aksesi

d)

Nilainya sama dengan Presentasi kesamaann

Similar Resources on Wayground

SELEKSI OSIS SMP KARTIKA IV-11

20 questions

SELEKSI OSIS SMP KARTIKA IV-11

quiz

Worksheet

•

7th Grade - Professio...

PRETEST PPG SOSPRI

20 questions

PRETEST PPG SOSPRI

quiz

Worksheet

•

12th Grade - University

UAS Bioentrepreneur

20 questions

UAS Bioentrepreneur

quiz

Worksheet

•

University

Digital Electronics

20 questions

Digital Electronics

quiz

Worksheet

•

University

Evaluasi Akhir

20 questions

Evaluasi Akhir

quiz

Worksheet

•

University

NHT day 5

20 questions

NHT day 5

quiz

Worksheet

•

University

Project Management : Overview, Teams, Life Cycles, Initiating

20 questions

Project Management : Overview, Teams, Life Cycles, Initiating

quiz

Worksheet

•

University

UTS PENATAAN SANGGUL MODERN DAN MODIFIKASI 116

20 questions

UTS PENATAAN SANGGUL MODERN DAN MODIFIKASI 116

quiz

Worksheet

•

University