Font size
S
M
L
XL
WorksheetsResponsi Bioteknologi
Total questions: 52
Worksheet time: 27mins
Name
Class
Date
1.
Program ini bekerja dengan mencari homologi terbesar antara sekuens yang dimiliki dengan sekuens di database. Program apa yang dimaksud?
a)
BioEdit
b)
BLAST
c)
FASTA
d)
Mega11
2.
Pengertian DNA yang tepat adalah
a)
Deoxyribbonucleic Acid yang berperan dalam mengkode protein pada makhluk hidup
b)
Ribbonucleic Acid yang berperan dalam sintesis protein pada makhluk hidup
c)
Deoxyribbonucleic yang tersusun atas asam nukleat
d)
Deoxyribbonucleic Acid yang tersusun atas asam amino yang dapat mengkode protein pada makhluk hidup
3.
Sekuensing DNA merupakan metode yang digunakan untuk menentukan urutan...
a)
Adenin, Sitosin, Guanin, Timin
b)
Sitosin, Timin, Arginin, Guanin
c)
Sitosin, Urasil, Guanin, Adenin
d)
Arginin, Sitosin, Timin, Adenin
4.
Mengapa sekuensing dua arah perlu dilakukan
a)
Agar spesies dapat ditentukan secara langsung
b)
Untuk meminimalisir kesalahan dalam proses sekuensing
c)
Agar proses sekuensing lebih singkat
d)
Untuk menentukan keluarga dari spesies DNA yang diperoleh
5.
Sekuensing menggunakan primer dua arah (Forward and Reverse primers) dapat meminimalisasi kemungkinan kesalahan dalam proses sekuensing. Kedua hasil sekuensing tersebut selanjutnya dapat digabungkan untuk
mendapatkan sebuah gen utuh, proses menyamakan posisi sekuens untuk analisis disebut....
a)
Forward primer
b)
Contig
c)
Alignment
d)
Reverse primer
6.
Fungsi dari penggunaan software BLAST adalah, kecuali
a)
Identifikasi organisme
b)
Menemukan homolog dari sekuen tertentu
c)
Analisis dan manipulasi sekuens DNA, RNA dan protein
d)
Anotasi gen
7.
Apa spesies yang diperoleh pada saat praktikum?
a)
Orchobacterium
b)
Diplococcus
c)
Bacillus
d)
E. Coli
8.
Langkah yang dilakukan untuk membalik arah sekuen reverse menjadi komplementer, sehingga
dapat disejajarkan secara biologis dengan sekuen forward yaitu....
a)
Pairwise alignment
b)
Reverse complement
c)
Compute pairwise distance
d)
Multiple sequence alignment
9.
Nilai dugaan yang memberikan ukuran statistikyang signifikan terhadap kedua sequence
a)
Score
b)
Query coverage
c)
E value
d)
Max identity
10.
Ukuran numerik dari kekuatan kecocokan (alignment) antara sekuens query dan sekuen target
a)
Accession number
b)
Score
c)
Query coverage
d)
Max identity
11.
Dalam bioinformatika banyak teknik yang harus dipelajari salah satunya teknik untuk menemukan kesamaan dalam banyak sekuen. Teknik apakah itu?
a)
Sekeunsing DNA
b)
Basic Local Alignment Search Tools
c)
Sequence alignment
d)
Multiple sequence alignment
12.
Pengertian Pohon Filogenik yang tepat adalah
a)
Pohon filogenik adalah diagram yang menggambarkan hubungan evolusi antara organisme berdasarkan kesamaan dan perbedaan karakteristik genetik atau morfologi mereka.
b)
Pohon filogenik adalah diagram yang tidak menggambarkan hubungan keluarga antara organisme berdasarkan kesamaan dan perbedaan karakteristik genetik atau morfologi mereka.
c)
Pohon filogenik adalah kurva yang menggambarkan hubungan evolusi antara organisme berdasarkan kesamaan dan perbedaan karakteristik genetik atau morfologi mereka.
d)
Pohon filogenik adalah kurva yang menggambarkan hubungan revolusi antara organisme berdasarkan kesamaan dan perbedaan karakteristik genetik atau morfologi mereka.
13.
Saat penyusunan pohon filogenik, aplikasi yang digunakan adalah MEGA versi 11, apakah kepanjangan dari aplikasi tersebut..
a)
Molecular Evaluation Genetics Analysis
b)
Molecular Evoluntary Genetics Analysis
c)
Molecular Evolutionary Genetics Allignment
d)
Molecular Evolutionary Genetics Analysis
14.
Multiple Sequence Alignment adalah suatu teknik untuk menemukan kesamaan dalam banyak sekuen, teknik ini sangat penting untuk digunakan sebagai berikut ini, kecuali
a)
Membuat pohon filogenik
b)
Mengidentifikasi single nucleotide polymorphism
c)
Meremajakan dan menguji aktivitas bakteri
d)
Metagenome fragments binning
15.
Pada saat memuat data sekuen 16S rRNA ke dalam MEGA, muncul jendela konfirmasi dengan pertanyaan:
"Protein-coding nucleotide sequence data?"
Apa jawaban yang tepat untuk jenis data ini, dan mengapa?
a)
Yes, karena 16S rRNA disusun oleh nukleotida DNA yang nantinya akan dikodekan menjadi protein ribosom.
b)
No, karena 16S rRNA adalah sekuens DNA non-coding yang berfungsi sebagai penanda taksonomi, bukan untuk sintesis protein.
c)
Yes, karena semua gen berbasis DNA pasti bersifat protein-coding.
d)
No, karena meskipun berasal dari DNA, 16S rRNA tidak mengandung intron dan tidak dapat ditranskripsi.
16.
Basa-basa nukleotida yang diperoleh pada hasil Sekuensing DNA kecuali
a)
Adenin
b)
Timin
c)
Urasil
d)
Purin
17.
Pasangan basa nukleotida yang benar kecuali
a)
Adenin Timin
b)
Gunain Sitosin
c)
Adenin Urasil
d)
Guanin Timin
18.
DNA pertama kali diperkenalkan oleh
a)
Watson dan Crick
b)
Oppenheimer
c)
Nessler
d)
Lowry
19.
Fungsi algorit MUSCLE dalam MEGA adalah untuk
a)
mencari pasangan basa komplementer
b)
mengurutkan sekuen berdasarkan homologi
c)
membangun matrix jarak antar sekuen
d)
mendeteksi gen pengkode DNA
20.
Bagaimana hubungan jarak antar spesies dengan kekerabatan spesies
a)
Semakin kecil semakin dekat
b)
Semakin besar semakin dekat
c)
Tidak berhubungan
d)
Semakin dekat tapi terasa semakin jauh
21.
Apa fungsi hasil perhitungan jarak antar spesies pada pohon filogenetik?
a)
Untuk mempermudah dalam interpretasi hubungan antar spesies
b)
Untuk menentukan jenis spesies dalam pohon filogenetik
c)
Untuk menentukan tahun ditemukannya spesies pada pohon filogenetik
d)
Untuk menentukan perbedaan karakteristik tiap spesies
22.
Pengertian PCR yang paling tepat dibawah ini adalah
a)
Polimerase Chain Reaction yang digunakan untuk melakukan perbanyakan sekuens DNA yang diisolasi
b)
Polimerase Chain Reaction yang digunakan untuk melakukan penerjemahan DNA
c)
Polimerase Chain Reaction yang digunakan untuk menganalisis sekuens DNA
d)
Polimerase Chain Reaction yang digunakan untuk memutuskan ikatan pada DNA
23.
PCR memiliki peran penting untuk hal-hal di bawah ini, kecuali
a)
Pengembangan terapi gen
b)
Isolasi DNA sampel
c)
Identifikasi penyakit genetik
d)
Pemantauan resistensi antibiotik
24.
Reaksi berantai polimerase, atau PCR, adalah salah satu teknik yang paling terkenal dalam biologi molekuler. Berikut merupakan tiga tahap dalam reaksi PCR, kecuali
a)
Denaturasi
b)
Sentrifugasi
c)
Annealing
d)
Extention/elongasi
25.
Berikut hal yang dibutuhkan dalam proses PCR yang berguna sebagai cetakan DNA yang akan diperbanyak, yaitu...
a)
DNA polimerase
b)
DNA target
c)
DNA untai ganda
d)
DNA komplemen
26.
Manakah dari pernyataan berikut yang paling tepat mengenai alat ini?
a)
hanya digunakan untuk mengkloning gen target
b)
memungkinkan analisis ekspresi gen secara kualitatif saja
c)
mengukur amplifikasi DNA secara real-time menggunakan sinyal fluoresensi
d)
tidak memerlukan primer karena prosesnya otomatis
27.
Teknologi sekuensing pada alat ini bekerja berdasarkan prinsip
a)
sanger sequencing dengan deteksi gel elektroforesis
b)
deteksi warna dari dideoksinukleotida fluoresen dengan pemanjangan rantai
c)
bridge amplification dan sequencing by synthesis dengan terminator reversibel
d)
pyrosequencing dan pembentukan cahaya oleh enzim luciferase
28.
Tahapan PCR dibawah ini yang sesuai dengan urutan
a)
1. Denaturasi (pemisahan untai DNA) 2. Annealing (penempelan primer pada DNA) 3. Ekstensi (perpanjangan untai DNA baru)
b)
1. Annealing (pemisahan untai DNA) 2. Denaturasi (penempelan primer pada DNA) 3. Ekstensi (perpanjangan untai DNA baru)
c)
1. Denaturasi (penempelan untai DNA) 2. Annealing (Pemisahan primer pada DNA) 3. Ekstensi (perpanjangan untai DNA baru)
d)
1. Renaturasi (pemisahan untai DNA) 2. Annealing (penempelan primer pada DNA) 3. Ekstensi (perpanjangan untai DNA baru)
29.
Tapan yang perlu dilakukan sebelum analisis PCR
a)
Elektroforesis Gel dan Mengukur konsentrasi DNA
b)
Inkubasi DNA dan Elektroforesis
c)
Penyimpanan DNA pada suhu dingin
d)
Menyalin kode DNA dari hasil Sekuensing
30.
Apa yang dilakukan bila DNA yang diperoleh kurang dari konsentrasi yang diperlukan untuk analisis PCR
a)
Tetap melanjutkan analisis PCR karena PCR bertujuan memperbanyak DNA
b)
Melakukan isolasi kembali hingga memperoleh DNA yang cukup
c)
Menyimpan DNA yang diperlukan agar mengendap
d)
Melakukan isolasi dari awal karena sampel DNA yang diperoleh tidak boleh dicampur dengan sampel baru walaupun tetap sama
31.
Untuk mengambil cairan (seperti larutan DNA, primer, dNTPs) dengan volume kecil dalam praktikum PCR biasanya digunakan alat
a)
Mikroskop
b)
Pipet mikro (micropipette)
c)
Centrifuge
d)
Gel electrophoresis chamber
e)
Hot plate
32.
Langkah kerja enzim alfa amilase pada amilosa yang benar adalah
a)
Degradasi sempurna dan cenderung lambat menjadi matosa dan maltotriosa
b)
Hidrolisis cepat oligosakarida dengan pembentukan glukosa dan maltosa
c)
Degradasi cepat dan sempurna menjadi glukosa dan maltosa
d)
Hidrolisis lambat oligosakarida dengan pembentukan glukosa dan maltosa
33.
Mengapa media NA perlu ditambahkan amilum pada uji potensi mikroba?
a)
Untuk mengetahui kemampuan degradasi amilum menjadi protein
b)
Untuk mengetahui kemampuan degradasi protein menjadi peptidanya
c)
Untuk mengetahui kemampuan degradasi protein menjadi amilum
d)
Untuk mengetahui kemampuan degradasi amilum menjadi monomernya
34.
Hal apa yang perlu dilakukan pertama kali pada praktikum uji potensi mikroba?
a)
Peremajaan mikroba
b)
Sterilisasi
c)
Kultivasi mikroba
d)
Uji enzim amilase
35.
Proses kultivasi mikroba dilakukan menggunakan media (a)... yang dibuat dengan menggunakan (b)...
a)
(a) Nutrient Agar; (b) 0,08 g dalam 10 mL
b)
(a) Nutrient Broth; (b) 0,08 g dalam 10 mL
c)
(a) Nutrient Agar + Amilum; (b) 0,06 dalam 10 mL
d)
(a) Nutrient Broth + Amilum; (b) 0,06 dalam 10 mL
36.
Berikut merupakan komponen dan komposisi yang terkandung pada Nutrient Broth 500 mL, yaitu:
1. Beef extract 1.0 gram
2. Peptone 2.5 gram
3. Sodium Chloride 0.8 gram
4. Distilled water 500 mL
Manakah komponen dan komposisi yang sesuai?
a)
1, 2, 3
b)
1 dan 3
c)
2 dan 4
d)
1, 2, 3, 4 benar
e)
1, 2, 3, 4 salah
37.
Uji potensi enzim amilase ditandai dengan:
1. Diuji menggunakan lugol's iodine
2. Interpretasi negatif jika tidak ada zona jernih di sekitar koloni
3. Bakteri yang diuji adalah Bacillus sp.
4. Warna biru-hitam pada media akan berubah menjadi hijau-oranye atau hilang jika ada amilase
Pernyataan yang benar...
a)
1, 2, 3
b)
1 dan 3
c)
2 dan 4
d)
Benar semua
e)
Salah semua
38.
Salah satu komposisi yang digunakan untuk preparasi Nutrient Agar adalah...
a)
Agar
b)
Peptida
c)
Sodium Dioxide
d)
Air demineralisasi
39.
Berikut adalah reaksi hidrolisis pati menjadi gula sederhana oleh enzim amilase:
Manakah struktur kimia dari pati (polisakarida) yang benar?
a)
1
b)
2
c)
3
40.
Pada tahap kultivasi mikroba terdapat 4 fase mikroba saat dikultivasi yaitu....
a)
Fase Lag, fase log, fase stasioner, fase kematian
b)
Fase log, fase lag, fase stasioner, fase kematian
c)
Fase log, fase lag, fase kematian, fase stasioner
d)
Fase lag, fase log, fase kematian, fase stasioner
41.
Kenapa bakteri setelah di stric pada media agar miring (NA) diinkubasi selama 24 jam?
a)
Agar bakteri yang digunakan mencapai fase log/eksponensial secara maksimum
b)
Agar bakteri mengalami decline phase
c)
Bakteri menyesuaikan diri dengan lingkungan baru
d)
Agar bakteri hidup lebih lama
42.
Setelah inkubasi, bagaimana cara mendeteksi degradasi amilum oleh Bacillus B298 pada media agar amilum?
a)
Mengamati perubahan warna media secara langsung
b)
Menambahkan indikator pH
c)
Menambahkan larutan iodin (lugol) ke permukaan media
d)
Melihat pertumbuhan koloni bakteri
43.
Isolasi DNA dari sumbernya dapat dilakukan dalam beberapa tahapan berikut, yaitu..
a)
persiapan ekstrak sel, pemurnian, dan pengendapan DNA
b)
pengendapan ekstrak sel, persiapan, dan pemurnian DNA
c)
preparasi ekstrak DNA, pemurnian, dan presipitasi sel
d)
Pengendapan ekstrak DNA, pemurnian, dan preparasi DNA
44.
Elektroforesis yang dilakukan untuk pemisahan molekul DNA/RNA adalah... metode ini melakukan pemisahan berdasarkan...
a)
Elektroforesis gel poliakrilamid; muatan, ukuran, dan bentuk
b)
Elektroforesis gel poliakrilamid; muatan, ukuran, dan berat molekul
c)
Elektroforesis gel agarosa; muatan, ukuran, dan bentuk
d)
Elektroforesis gel agarosa; muatan, ukuran, dan berat molekul
45.
Rumus untuk menentukan konsentrasi DNA (mg/mL) adalah
a)
(A pada λ 280 × 50 g/mL) × faktor pengenceran
b)
(A pada λ 260 × 50 g/mL) × faktor pengenceran
c)
(A pada λ 280 × 50 μg/L) × faktor pengenceran
d)
(A pada λ 260 × 50 μg/mL) × faktor pengenceran
46.
Jika diketahui absorbansi pada panjang gelombang 280 nm sebesar 0,389 dan pada 260 nm sebesar 0,255; maka indeks kemurnian DNA yang terukur yaitu...
a)
1,525 murni
b)
1,525 tidak murni
c)
0,655 murni
d)
0,655 tidak murni
47.
Instrumen berikut digunakan pada proses isolasi DNA:
1. Incubator
2. Centrifuge
3. Waterbath
4. Elektroforesis
a)
1, 2, 3
b)
1 dan 3
c)
2 dan 4
d)
1, 2, 3, 4 benar
e)
1, 2, 3, 4 salah
48.
Apabila diketahui komposisi berikut:
1. Buffer TAE 50X 6 mL
2. Aquades 294 mL
Bahan tersebut digunakan untuk membuat...
a)
Buffer TAE 10X 300 mL
b)
Buffer TAE 1X 300 mL
49.
DNA menyerap sinar UV maksimal pada panjang gelombang (a).... nm,
sementara protein menyerap maksimal pada (b).... nm
a)
(a) 280 (b) 260
b)
(a) 280 (b) 280
c)
(a) 260 (b) 280
d)
(a) 260 (b) 240
50.
Senyawa yang memungkinkan menjadi penyebab ketidakmurnian DNA selain fenol dan protein adalah...
a)
RNA
b)
Phospate
c)
Pelarut anorganik
51.
Menghancurkan dinding dan membran sel untuk mengeluarkan isi sel, merupakan prinsip kerja dari
a)
Pelisisan protein dan RNA
b)
Presipitasi DNA
c)
Lisis sel
d)
Elusi DNA murni
52.
Berapa rasio yang digunakan untuk menghitung konsentrasi DNA dan menilai kemurnian DNA
a)
A265, A245/A265
b)
A260, A260/A280
c)
A250, A275/A280
d)
A275, A280/A275
Reset
