wayground logo

Free Printable Worksheets

Font size

S
M
L
XL
Worksheets

UTS BIOINFORMATIKA

Total questions: 40

Worksheet time: 2hrs 57mins

Name
Class
Date
1.

Kelahiran bioinformatika sebagai ilmu ditandai dengan adanya penyusunan Atlas of Protein Sequence and Structure pada tahun 1965 oleh ….

a)

Frederick Sanger

b)

Emile Zuckerkandl

c)

Ben Hesper

d)

Margaret Oakley Dayhooff

e)

Pauline Hogeweg

2.

Bioinformatika adalah ilmu yang mengkaji biologi pada tatanan … dan kemudian menerapkan teknologi informasi untuk memahami dan menata informasi yang terkait dengannya dalam skala besar.

a)

Mikromolekul

b)

Makromolekul

c)

Gen

d)

Protein

e)

DNA

3.

Sekumpulan ilmu yang mempelajari konteks secara totalitas atau keseluruhan disebut ….

a)

Genomika

b)

Traskriptomika

c)

Omika

d)

Proteomika

e)

Metabolomika

4.

Berikut yang bukan termasuk dalam analisis struktur dalam bioinformatika adalah ….

a)

Prediksi struktur asam nukleat

b)

Prediksi struktur protein

c)

Klasifikasi protein

d)

Perbandingan struktur protein

e)

Prediksi gen

5.

Berikut yang bukan termasuk dalam analisis urutan dalam bioinformatika adalah ….

a)

Perbandingan genom

b)

Analisis filogeni

c)

Klasifikasi protein

d)

Pencarian motif

e)

Prediksi promoter

6.

Berikut yang bukan termasuk dalam analisis fungsi dalam bioinformatika adalah ….

a)

Penjajaran urutan

b)

Pemodelan jalur metabolisme

c)

Pembuatan profil ekspresi gen

d)

Prediksi interaksi antar protein

e)

Prediksi penempatan protein

7.

Perkembangan dari bioinformatika sangat bergantung pada perkembangan … yang penerapannya menjawab berbagai permasalahan biologi.

a)

Biologi molekuler kuantitatif

b)

Biologi komputer

c)

Teknologi informasi

d)

Teknologi komputer

e)

Biologi komputasi

8.

Ruang lingkup bioinformatika meliputi kajian analisis urutan, struktur, dan fungsi dari makromolekul biologi pembawa informasi, yang mana dalam penerapannya ketiganya harus saling berinteraksi untuk memberikan hasil yang menyeluruh, contohnya adalah ….

a)

Analisis struktur protein memerlukan data penjajaran urutan asam amino, sebaliknya analisis urutan asam amino antar protein dapat dioptimalisasi dengan adanya struktur tiga dimensi yang bersangkutan.

b)

Struktur tiga dimensi dari sebuah protein dapat ditentukan dengan melihat urutan asam aminonya.

c)

Analisis struktur protein dapat dioptimalisasi dengan adanya struktur tiga dimensi dari fungsi asam amino penyusunnya.

d)

Analisis fungsi protein memerlukan data analisis struktur tiga dimensi protein yang bersangkutan.

e)

Analisis struktur asam amino memerlukan data penjajaran urutan protein, sebaliknya analisis urutan protein dapat dioptimalisasi dengan adanya analisis fungsi asam amino penyusunnya.

9.

“Peranan intelijen dalam perang” merupakan analogi yang menggambarkan keterbatasan bioinformatika. Berdasarkan pernyataan tersebut, hubungan antara bioinformatika dan biologi eksperimen yang benar dijelaskan oleh pernyataan bahwa ….

a)

Bioinformatika berperan sebagai serdadu perang

b)

Biologi eksperimen sebagai intelijen

c)

Akurasi dan prediksi dari bioinformatika bersifat relatif berdasarkan kualitas data dan pemodelan yang diberikan

d)

Bioinformatika berperan sebagai intelijen yang bertugas menganalisis informasi

e)

Biologi eksperimen sebagai serdadu perang

10.

Bioinformatika berpotensi merevolusi berbagai penelitian biologi di masa depan. Tantangan yang harus diatasi untuk mencapai hasil sesuai pernyataan tersebut adalah ….

a)

Peran dari bioinformatika sebagai intelijen dalam menganalisis informasi makromolekul biologis.

b)

Pengembangan teknik komputasi untuk analisis struktur, urutan, dan fungsi makromolekul biologis secara tepat dan akurat.

c)

Akurasi dan prediksi dari bioinformatika menjadi baku seiring perkembangan teknologi komputasi dalam melakukan analisis struktur, urutan, dan fungsi makromolekul biologis.

d)

Perkembangan biologi molekuler dalam ruang lingkup analisis struktur, urutan, dan fungsi makromolekul biologis secara detail.

e)

Perkembangan teknologi komputer untuk analisis struktur, urutan, dan fungsi makromolekul biologis secara cepat.

11.

Arsip digital yang menampung data terkait dengan informasi biologi dibutuhkan proses identifikasi informasi antar potongan data yang sebelumnya belum diketahui ketika data tersebut pertama kali dimasukkan yang disebut dengan istilah ….

a)

Knowledge processing

b)

Knowledge data access

c)

Knowledge data retrieval

d)

Knowledge data identification

e)

Knowledge discovery

12.

*Database primer di antaranya dapat diakses pada …, …, dan …

a)

REFSEQ

b)

PROSITE

c)

Uniprot

d)

DDBJ

e)

ENA

13.

*Database sekunder di antaranya dapat diakses pada …, …, dan …

a)

NCBI GenBank

b)

Swiss-Prot

c)

PROSITE

d)

REFSEQ

e)

ENSEMBL

14.

*Contoh database khusus dapat diakses pada … dan …

a)

ENSEMBL

b)

ENA

c)

WORMBASE

d)

FLYBASE

e)

Swiss-Prot

15.

*Database biologi berupa protein non-redundan yang telan dikurasi dan dianotasi dapat diakses dari … dan …

a)

NCBI GenBank

b)

Swiss-Prot

c)

PROSITE

d)

REFSEQ

e)

DDBJ

16.

Seorang peneliti dapat melakukan hal-hal berikut terhadap database biologis, kecuali ….

a)

Mendepositkan data

b)

Menredundansi data

c)

Mempublikasikan data

d)

Membandingkan database

e)

Menggunakan informasi dari koleksi urutan database

17.

*Ketergantungan besar terhadap database biologi tanpa mempertanyakan kehandalan atau kualitas data yang bersangkutan sangat tidak disarankan (Apriliyanto & Sembiring, 2017), hal tersebut disebabkan oleh ….

a)

Kesalahan pengurutan

b)

Duplikasi data

c)

Kegagalan anotasi

d)

Identifikasi data

e)

Pemrosesan data

18.

Pencarian informasi dalam database biologi dengan hasil yang spesifik dapat dilakukan dengan memanfaatkan ….

a)

Kata kunci

b)

Kode identitas

c)

Teknik BLAST

d)

Hasil Publikasi

e)

Potongan Informasi

19.

*Konstruksi database di dalam bioinformatika dapat dilakukan dengan ….

a)

Archiving

b)

Interpreting

c)

Whole analysis

d)

Sequencing

e)

Annotating

20.

*Arsip asam nukleat di seluruh dunia dibagikan setiap hari yang berakibat data mentah (database primer) sifatnya identik namun format penyajian dan sifat anotasinya bervariasi. Hal tersebut merupakan hasil kemitraan yang dilakukan oleh ….

a)

NCBI

b)

ENA

c)

EBI

d)

DNA Data Bank of Japan

e)

ENSEMBL

21.

*Penjajaran pasangan basa di dalam bioinformatika digunakan untuk keperluan di antaranya ….

a)

Mengukur kemiripan DNA/Protein

b)

Identifikasi hubungan evolusi DNA/Protein

c)

Identifikasi fungsional antara sekuens DNA/Protein

d)

Mengukur kemiripan DNA/RNA

e)

Identifikasi hubungan evolusi DNA/RNA

22.

Penjajaran urutan adalah cara untuk mempresentasikan hubungan antara dua atau lebih urutan biologis dengan tujuan untuk mencoba mengidentifikasi daerah urutan yang bersifat ….

a)

Redundan

b)

Bertolak belakang

c)

Konvergen

d)

Divergen

e)

Homolog

23.

Program yang digunakan untuk menyelaraskan urutan nukleotida DNA dan urutan asam amino dari protein yang dikodekan oleh DNA disebut sebagai ….

a)

Dynamic programing

b)

Sequencing

c)

Archiving

d)

Interpreting

e)

Annotating

24.

*Penyelarasan urutan nukleotida DNA dan urutan asam amino dari protein yang dikodekan oleh DNA berbasis web dapat dilakukan melalui ….

a)

FASTA

b)

BLAST

c)

ALIGN

d)

ESEMBL

e)

EMBOSS

25.

Pendekatan komputasi dapat dilakukan dalam penjajaran urutan nukleotida dan protein. Untuk membandingkan gen homolog seperti membandingkan dua gen/protein dengan fungsi yang sama, maka metode yang dapat digunakan adalah ….

a)

Global Sequence Alignment

b)

Local Alignment

c)

Semi Global Alignment

d)

Penyelarasan Lokal

e)

Penyelarasan Hybrid

26.

Pendekatan komputasi dapat dilakukan dalam penjajaran urutan nukleotida dan protein. Untuk membandingkan pola dalam urutan DNA atau domain dalam urutan protein, maka metode yang dapat digunakan adalah ….

a)

Global Sequence Alignment

b)

Local Alignment

c)

Semi Global Alignment

d)

Penyelarasan Global

e)

Penyelarasan Hybrid

27.

Pendekatan komputasi dapat dilakukan dalam penjajaran urutan nukleotida dan protein. Untuk mencari kemungkinan kesejajaran parsial terbaik dari dua urutan, maka metode yang dapat digunakan adalah ….

a)

Global Sequence Alignment

b)

Local Alignment

c)

Semi Global Alignment

d)

Penyelarasan Global

e)

Penyelarasan Lokal

28.

Panduan untuk eksperimen sequencing yang menunjukkan posisi gen dan ciri khasnya disebut ….

a)

Pemetaan Genom

b)

Pemetaan Asam Amino

c)

Pemetaan Gen

d)

Pemetaan DNA

e)

Pemetaan RNA

29.

Berikut adalah konsep-konsep dalam similaritas database berkaitan dengan query, pernyataan yang tidak tepat adalah ….

a)

Query digunakan untuk mengakses dan menampilkan data pada sistem database

b)

Query memiliki kemampuan menampilkan data yang tidak diinginkan

c)

Dalam pencarian similaritas database diperlukan pengiriman urutan query

d)

Diperlukan perbandingan berpasangan urutan query dengan semua urutan individu dalam database

e)

Query mengatur data yang diperlukan untuk ditampilkan dalam pencarian similaritas database

30.

Keterkaitan dua protein pada tingkat urutan yang sama menunjukkan bahwa mereka … dan memiliki kemungkinan … yang sama. Pilihlah jawaban yang paling tepat untuk melengkapi bagian yang kosong sehingga menjadi satu pernyataan yang benar terkait similaritas database!

a)

Homolog; Fungsi

b)

Homolog; Struktur

c)

Redundan; Fungsi

d)

Sejajar; Struktur

e)

Sepadan; Fungsi

31.

*Syarat yang harus dipenuhi dalam pencarian similaritas database di antaranya ….

a)

Sensivitas

b)

Homologi

c)

Kesejajaran

d)

Selektivitas

e)

Kecepatan

32.

Kebutuhan ideal dalam pencarian similaritas database dalam kenyataannya sulit dipenuhi, oleh karena itu peningkatan sensivitas akan mengakibatkan penurunan ….

a)

Sensivitas

b)

Homologi

c)

Kesejajaran

d)

Selektivitas

e)

Kecepatan

33.

*Kondisi ideal dalam pencarian similaritas database yang sering dikorbankan jika mengutamakan kecepatan adalah ….

a)

Sensivitas

b)

Homologi

c)

Kesejajaran

d)

Selektivitas

e)

Kecepatan

34.

Alogoritma heuristic merupakan pencarian similaritas database dengan hanya memeriksa sebagian kecil dari kemungkinan keselarasan yang diperiksa dalam dynamic programing serta mengutamakan faktor ….

a)

Sensivitas

b)

Homologi

c)

Kesejajaran

d)

Selektivitas

e)

Kecepatan

35.

*Program pencarian similaritas database berbasis web yang menggunakan prinsip teori algoritma heuristic di antaranya ….

a)

FASTA

b)

BLAST

c)

ALIGN

d)

ESEMBL

e)

EMBOSS

36.

Prinsip signifikansi Basic Local Alignment Search Tool dalam pencarian similaritas database menggunakan parameter ….

a)

Semakin rendah e-value maka semakin kecil kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin signifikan.

b)

Semakin tinggi e-value maka semakin kecil kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin signifikan.

c)

Semakin tinggi z-score maka semakin kecil kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin signifikan.

d)

Semakin rendah z-score maka semakin kecil kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin signifikan.

e)

Semakin rendah e-value maka semakin besar kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin kurang signifikan.

37.

Prinsip signifikansi FASTA dalam pencarian similaritas database menggunakan parameter ….

a)

Semakin rendah e-value maka semakin kecil kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin signifikan.

b)

Semakin tinggi e-value maka semakin kecil kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin signifikan.

c)

Semakin tinggi z-score maka semakin kecil kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin signifikan.

d)

Semakin rendah z-score maka semakin kecil kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin signifikan.

e)

Semakin rendah z-score maka semakin besar kemungkinan bahwa pasangan urutan diperoleh secara kebetulan artinya kecocokan antar keduanya semakin kurang signifikan.

38.

Pencarian similaritas database dengan membandingkan suatu sekuen asam amino yang dimiliki dengan database sekuen protein maka dapat dilakukan dengan cara ….

a)

BLASTN

b)

BLASTP

c)

BLASTX

d)

TBLASTN

e)

TBLASTX

39.

Pencarian similaritas database dengan menerjemahkan dari query dan database menjadi 6 protein potensial, kemudian melakukan 36 pencarian database protein maka dapat dilakukan dengan cara ….

a)

BLASTN

b)

BLASTP

c)

BLASTX

d)

TBLASTN

e)

TBLASTX

40.

Cabang ilmu biologi yang menganalisis informasi yang terkandung di dalam makromolekul biologis secara kuantitatif dengan menggunakan bantuan komputer disebut ….

a)

Biologi molekuler kuantitatif

b)

Biologi komputer

c)

Teknologi informasi

d)

Biologi molekuler

e)

Biologi komputasi