Worksheetslatihan soal OSCE biomol
Total questions: 56
Worksheet time: 33mins
Mengapa proteinase K ditambahkan sebelum tahap pemanasan 60°C, bukan sesudahnya?
Karena butuh suhu tinggi agar aktif
Karena tidak stabil setelah DNA terlepas
Karena aktivitas optimalnya sebelum denaturasi protein
Karena hanya berfungsi di suhu dingin
Apa yang akan terjadi jika tahap pembekuan -20°C dilewati?
DNA lebih murni
Dinding sel tidak terpecah sempurna
Protein terdenaturasi
Supernatan sulit terbentuk
Pada metode boiling, apa faktor utama yang menyebabkan DNA rusak bila pemanasan berlebihan?
Denaturasi enzim
Pemutusan ikatan hidrogen DNA
Penguapan buffer
Degradasi protein
Mengapa DNA hasil metode boiling kurang cocok untuk PCR kuantitatif?
Karena tanpa buffer TE
Karena tidak murni dan masih banyak inhibitor
Karena DNA terlalu encer
Karena suhu penyimpanan terlalu rendah
Jika hasil elektroforesis menunjukkan pita DNA smear (kabur), penyebab paling mungkin adalah ...
Konsentrasi gel terlalu tinggi
DNA terfragmentasi akibat lisis kasar
DNA terlalu murni
Loading dye berlebih
Buffer GB mengandung garam chaotropik yang berfungsi untuk ...
Meningkatkan viskositas DNA
Denaturasi protein dan membantu DNA menempel di silika
Mengurangi pH buffer
Mengaktifkan enzim lisozim
Mengapa penambahan etanol dilakukan setelah buffer GB, bukan sebelumnya?
Karena DNA belum siap diendapkan sebelum lisis sempurna
Agar protein terpresipitasi terlebih dahulu
Karena etanol menurunkan aktivitas Proteinase K
Untuk menstabilkan suhu
Bila inkubasi 70°C terlalu singkat, efeknya terhadap hasil DNA adalah ...
DNA lebih pekat
Lisis tidak sempurna dan yield menurun
DNA rusak karena etanol
RNA tidak terpisah
Apa peran rasio pH buffer elusi terhadap kemurnian DNA?
pH rendah meningkatkan pengikatan DNA
pH netral (7–8.5) menjaga DNA tetap stabil
pH tinggi meningkatkan denaturasi protein
Tidak berpengaruh
Bagaimana pengaruh pencucian ganda dengan Buffer PW terhadap hasil?
Menurunkan yield tapi meningkatkan kemurnian
Meningkatkan RNA
Meningkatkan volume elusi
Tidak ada efek
Mengapa etanol 96–100% digunakan, bukan 70%?
Karena etanol 70% mengandung air yang mencegah DNA terikat silika
Karena 96% lebih murah
Karena RNA lebih mudah larut di 96%
Karena 70% mengendapkan protein
Apa yang terjadi jika wash buffer tidak mengandung etanol?
DNA tidak akan terikat
Kontaminan tidak terlepas dari kolom
RNA ikut terlarut
Proteinase K terdenaturasi
Mengapa DNA dari DBS sering memiliki yield rendah dibanding darah segar?
Karena degradasi leukosit saat pengeringan
Karena volume buffer terlalu banyak
Karena etanol terlalu sedikit
Karena pH buffer tinggi
Bagaimana cara memastikan tidak ada kontaminan RNA di hasil DBS?
Tambahkan RNase A
Tambahkan lisozim
Gunakan buffer GA
Cuci dua kali dengan buffer TE
Bila hasil PCR dari DNA DBS negatif untuk kontrol GAPDH, interpretasinya?
DNA rusak atau tidak terekstraksi
Tidak ada RNA
Primer rusak
DNA terlalu banyak
Jika pengambilan sampel terlalu lembut, konsekuensinya ...
Kontaminasi saliva
Jumlah sel terlalu sedikit
DNA terlalu pekat
RNase aktif
Mengapa suhu inkubasi harus 56°C, bukan lebih tinggi?
Mengapa suhu inkubasi harus 56°C, bukan lebih tinggi?
Karena suhu lebih tinggi menonaktifkan Proteinase K
Karena DNA hanya larut di suhu itu
Karena etanol mendidih di atas 56°C
Karena RNase aktif di atas suhu itu
Fungsi utama etanol dalam tahap ketiga adalah ...
Menonaktifkan RNase
Mengendapkan DNA agar bisa diikat di silika
Menurunkan pH
Melarutkan protein
Bila volume buffer elusi terlalu besar, efeknya pada DNA adalah ...
DNA encer dengan yield tetap
DNA murni
DNA rusak
RNA hilang
Mengapa hasil DNA buccal swab rentan degradasi dibanding darah?
Karena banyak enzim proteolitik & bakteri rongga mulut
Karena sel pipi tidak berinti
Karena pH terlalu tinggi
Karena buffer kurang stabil
Prinsip ikatan DNA pada magnetic beads terjadi karena ...
Afinitas tinggi antara fosfat DNA dan silika permukaan bead
Reaksi enzimatik
Pengikatan kovalen
Gaya Van der Waals
Jika sampel darah belum homogen sebelum ditambah magbeads, efeknya?
DNA tidak merata & yield tidak konsisten
DNA terlalu pekat
Enzim inaktif
RNA meningkat
Apa efek etanol 75% yang tidak dikeringkan sebelum elusi?
Inhibisi PCR
DNA rusak
RNA terdegradasi
Buffer menguap
Fungsi RNase A dalam ekstraksi MagBead adalah ...
Menghilangkan RNA pengganggu
Menstabilkan DNA
Melisiskan membran
Menonaktifkan protein
Jika tabung tidak diposisikan benar pada rak magnet, akibatnya ...
Magnetic beads ikut terbuang
DNA terlarut kembali
Elusi tidak terjadi
RNA mengendap
Mengapa parafin harus dilelehkan di 98°C bukan suhu lebih rendah?
Agar parafin cair sempurna tanpa merusak DNA
Agar RNA ikut larut
Agar protein tidak berubah
Agar air menguap
Fungsi Buffer GP adalah ...
Membantu DNA menempel di kolom
Menghilangkan RNA
Meningkatkan pH
Menurunkan viskositas
Jika lapisan clean water tercampur dengan parafin setelah sentrifugasi, hasilnya ...
DNA terkontaminasi & PCR gagal
DNA lebih banyak
RNA lebih pekat
Protein hilang
Mengapa inkubasi RNase dilakukan hanya 2 menit?
RNase cepat aktif dan bekerja singkat
Karena tidak stabil pada suhu tinggi
Agar DNA ikut hilang
Karena buffer menguap
Jika pH elusi <7, apa efeknya pada DNA?
DNA rusak & efisiensi elusi menurun
DNA lebih banyak
RNA ikut larut
Protein meningkat
Fungsi utama reagen GENEzol adalah ...
Melisiskan sel dan menonaktifkan RNase
Mengendapkan RNA
Mengikat DNA
Meningkatkan pH
Jika fase organik dan fase air tidak terpisah sempurna, maka ...
RNA terkontaminasi protein
RNA lebih murni
DNA ikut terlarut
RNA hilang
Kenapa kloroform digunakan dalam metode TRIzol?
Untuk memisahkan fase air & organik
Untuk menonaktifkan DNA
Untuk mencuci RNA
Untuk mengeringkan pellet
Apa yang terjadi jika isopropanol tidak ditambahkan setelah fase air diambil?
RNA tidak mengendap
DNA larut
Protein menempel
RNA terlalu pekat
Jika pellet RNA mengering terlalu lama, hasilnya ...
RNA keras & sulit larut
RNA rusak oleh panas
RNA lebih pekat
RNA terkontaminasi DNA
Mengapa buffer RB1 harus ditambah etanol sebelum digunakan?
Mengapa buffer RB1 harus ditambah etanol sebelum digunakan?
Untuk membantu RNA berikatan di kolom
Untuk mendenaturasi protein
Untuk mengendapkan DNA
Untuk menghilangkan RNA
Mengapa sentrifugasi dilakukan pada suhu 4°C?
Menjaga RNA tidak terdegradasi
Agar DNA ikut larut
Mengendapkan protein
Menurunkan pH
Apa yang terjadi jika kloroform diganti dengan BCP?
Pemisahan fase tetap berjalan
RNA rusak
DNA hilang
Protein meningkat
Fungsi filter EzPure™ dalam metode ini adalah ...
Menghilangkan sisa partikel seluler
Mengikat DNA
Menstabilkan pH
Menonaktifkan RNase
Jika etanol tidak ditambahkan pada buffer RBW, maka ...
Kontaminan darah tidak hilang
RNA lebih banyak
RNA hilang
DNA rusak
Fungsi utama gen GAPDH pada PCR adalah ...
Sebagai kontrol internal ekspresi gen
Sebagai target spesifik penyakit
Sebagai enzim PCR
Sebagai template RNA
Apa yang menunjukkan PCR gagal total pada kontrol positif?
Tidak ada pita DNA GAPDH
Ada pita non-spesifik
Pita terlalu tebal
Hasil smear
Mengapa gen GAPDH disebut housekeeping gene?
Karena selalu terekspresi stabil di semua sel
Karena terletak di mitokondria
Karena hanya muncul saat infeksi
Karena mengatur protein struktural
Jika tidak ada band GAPDH di hasil PCR, artinya ...
Ekstraksi DNA gagal
Enzim terlalu aktif
RNA terlarut
Buffer salah
Elektroforesis digunakan dalam PCR untuk ...
Memisahkan fragmen DNA berdasarkan ukuran
Mengukur konsentrasi DNA
Menyalin DNA
Meningkatkan amplifikasi
Mengapa DNA bermigrasi ke kutub positif?
Karena bermuatan negatif
Karena berikatan dengan GelRed
Karena berat molekul besar
Karena arus rendah
Jika pita DNA terlalu dekat dengan sumur (tidak bergerak jauh), artinya ...
Ukuran DNA besar
DNA terlalu banyak
Voltase terlalu tinggi
Buffer terlalu encer
Mengapa GelRed atau EtBr digunakan dalam elektroforesis?
Untuk interkalasi DNA agar fluoresen
Untuk memotong DNA
Untuk mempercepat migrasi
Untuk menstabilkan pH
Jika loading dye terlalu sedikit, apa yang terjadi?
DNA mengambang di gel
Pita makin tebal
DNA tidak termigrasi
DNA rusak
Faktor yang mempengaruhi kecepatan migrasi DNA adalah ...
Ukuran & bentuk DNA
pH buffer
Suhu ruangan
Volume etanol
Prinsip dasar semua metode ekstraksi DNA/RNA adalah ...
Lisis – Pisah – Cuci – Elusi
Panas – Dinginkan – Keringkan
PCR – Lisis – Elusi
Staining – Elusi – PCR
Mengapa DNA harus bebas RNA untuk PCR?
RNA dapat menghambat amplifikasi
RNA lebih cepat termigrasi
RNA menempel pada silika
RNA meningkatkan viskositas
Jika hasil A260/A280 = 1.2, artinya ...
Sampel terkontaminasi protein
DNA murni
RNA berlebih
Etanol sisa
Apa fungsi Mg²⁺ dalam campuran PCR?
Kofaktor enzim Taq Polymerase
Menetralisir pH
Mengikat DNA
Menghilangkan RNA
