NEW
Font size
WorksheetsSinh tin. Chương 4 part 2
Total questions: 60
Worksheet time: 30mins
BioEdit là phần mềm dùng để làm gì trong tin sinh học?
Phân tích cấu trúc protein
Xử lý và chỉnh sửa tệp FASTA
Dự đoán mô hình 3D của protein
Phân tích biểu hiện gen từ RNA-Seq
BioEdit là phần mềm miễn phí dùng để làm gì?
Soạn thảo văn bản
Chỉnh sửa và phân tích dữ liệu sinh học
Phát triển phần mềm
Tạo đồ họa
Bước chuyển RNA thành cDNA trong RNA-Seq sử dụng enzyme nào?
Reverse transcriptase
DNA polymerase
RNA polymerase
Ligase
Bước đầu tiên để tải trình tự FASTA từ NCBI là gì?
Tìm kiếm từ khóa
Truy cập trang web NCBI
Tải phần mềm phân tích
Lọc kết quả tìm kiếm
Bước đầu tiên trong quá trình giải trình tự DNA là gì?
Lưu trữ dữ liệu
Xác định trình tự nucleotide
Phân mảnh DNA
So sánh trình tự DNA
Bước nào giúp loại bỏ các đoạn DNA có kích thước không phù hợp trong quá trình chuẩn bị thư viện?
Sử dụng enzyme cắt hạn chế
Lọc kích thước bằng gel hoặc cột lọc
Dùng nhiệt để phân hủy DNA không mong muốn
Biến tính DNA thành sợi đơn
Bước nào sau đây KHÔNG thuộc quy trình giải trình tự NGS?
Chuẩn bị thư viện DNA/RNA
Nhân bản plasmid trong vi khuẩn
Giải trình tự song song
Phân tích dữ liệu
Bước nào sau đây xảy ra sau khi DNA được gắn lên flowcell trong công nghệ Illumina?
DNA được nhân lên bằng Bridge PCR
DNA được giải trình tự ngay lập tức
DNA được biến tính để tạo ra RNA
DNA bị cắt thành các đoạn nhỏ hơn
Bước xử lý dữ liệu thô trong NGS KHÔNG bao gồm công việc nào sau đây?
Loại bỏ các đoạn đọc chất lượng thấp
Cắt bỏ adapter
Kiểm tra độ chính xác (QC)
Tổng hợp RNA từ DNA
Các ddNTPs trong phương pháp Sanger được đánh dấu bằng gì để xác định trình tự nucleotide?
Đồng vị phóng xạ
Màu huỳnh quang
Enzyme đặc hiệu
Kháng thể đặc hiệu
Các ddNTPs trong phương pháp Sanger được đánh dấu bằng gì để xác định trình tự nucleotide?
Đồng vị phóng xạ
Màu huỳnh quang
Enzyme đặc hiệu
Kháng thể đặc hiệu
Các transcript từ gen giả (pseudogenes) hoặc RNA có cấu trúc phức tạp gây ra vấn đề gì trong RNA-Seq?
Lỗi trong việc mapping và lắp ráp trình tự
Mất tín hiệu trong quá trình giải trình tự
Tăng độ chính xác của kết quả phân tích
Khó khăn trong việc phân tích kết quả mRNA
Các yếu tố di truyền SINEs và LINEs trong hệ gen thuộc loại nào?
Đoạn trình tự DNA lặp lại
Đột biến mất đoạn
Đột biến điểm
Đoạn exon trong gen
Cách sử dụng BioEdit để mở tệp FASTA là gì?
Chọn File > Open để mở tệp
Kéo và thả tệp vào giao diện phần mềm
Nhập tên trình tự vào thanh tìm kiếm
Sử dụng công cụ phân tích tự động
Cấu trúc trình tự trên NCBI bắt đầu với ký tự nào?
@
>
*
#
Chất lượng của mỗi nucleotide trong tệp FASTQ được mã hóa bằng gì?
Giá trị số nguyên
Chuỗi ký tự ASCII
Các số thực
Ký tự Latinh
Chất lượng RNA đầu vào được đánh giá thông qua chỉ số nào?
RIN (RNA Integrity Number)
PCR Efficiency
DNA Integrity Number
RNA Concentration Index
Chức năng nào của BioEdit giúp dịch mã từ trình tự DNA sang protein?
Alignment
Translation
Sequence Editing
Sequence Comparison
Cơ sở dữ liệu nào thường được sử dụng để lưu trữ và chia sẻ trình tự DNA?
PubMed
GenBank
Excel
Photoshop
Công cụ nào dưới đây KHÔNG được sử dụng để sắp xếp đa trình tự gen?
ClustalW
MUSCLE
MAFFT
BLAST
Công cụ nào dưới đây không phải là trình soạn thảo văn bản?
Notepad++
Sublime Text
BioEdit
Microsoft Word
Công cụ nào dưới đây không phải là trình soạn thảo văn bản?
Notepad++
Sublime Text
BioEdit
Microsoft Word
Công cụ nào dưới đây thường được sử dụng để xây dựng cây phát sinh chủng loại?
MEGA
RepeatMasker
Tandem Repeats Finder
Primer3
Công cụ nào không phải là phần mềm sinh học chuyên dụng cho phân tích FASTA?
BioEdit
MEGA
Microsoft Word
ClustalW
Công cụ nào sau đây thường được sử dụng để sắp xếp trình tự?
BLAST
ClustalW
AlphaFold
SPAdes
Công cụ nào thường được sử dụng để dự đoán vùng mã hóa trong hệ gen từ dữ liệu FASTA?
RepeatMasker
GeneMark
ClustalW
BLAST
Công cụ nào thường được sử dụng để phát hiện các vùng lặp lại trong hệ gen từ trình tự FASTA?
BLAST
RepeatMasker
ClustalW
MEGA
Công cụ nào trong BioEdit giúp kiểm tra lỗi trong trình tự DNA?
Dịch mã
Tìm kiếm và thay thế ký tự
So sánh trình tự
Cả B và C đều đúng
Công cụ NCBI giúp gì trong quá trình nghiên cứu gen?
Cung cấp công cụ tìm kiếm và tải trình tự gen
Tạo dữ liệu hình ảnh
Tạo báo cáo khoa học
Chạy các mô phỏng mô hình sinh học
Công nghệ giải trình tự của PacBio được gọi là gì?
Zero-Mode Waveguide Sequencing
Single-Molecule Real-Time Sequencing
Nanopore Sequencing
Sequencing by Synthesis
Công nghệ giải trình tự DNA có vai trò quan trọng trong công nghiệp sinh học vì
Hỗ trợ phát triển thuốc sinh học và sản phẩm sinh học mới
Giúp tăng kích thước bộ gen của các loài
Xác định hàm lượng protein trong tế bào
Tăng tốc độ sao chép DNA trong tự nhiên
Công nghệ giải trình tự đoạn dài có thể đọc các đoạn DNA hoặc RNA dài lên tới bao nhiêu base pair?
100 bp
300 bp
1000 bp
100 kb
Công nghệ giải trình tự đoạn dài có thể đọc các đoạn DNA hoặc RNA dài lên tới bao nhiêu base pair?
100 bp
300 bp
1000 bp
100 kb
Công nghệ giải trình tự đoạn dài thích hợp cho việc giải quyết vấn đề nào dưới đây?
Phân tích biểu hiện gen
Phát hiện biến thể cấu trúc lớn như chèn, xóa hoặc đảo đoạn
Phân tích các gen có cấu trúc đơn giản
Phân tích số lượng lớn mẫu
Công nghệ giải trình tự đoạn ngắn như Illumina có độ chính xác khoảng bao nhiêu?
85%
90%
99%
100%
Công nghệ nào cho phép giải trình tự trực tiếp RNA mà không cần chuyển hóa thành cDNA?
PacBio
Oxford Nanopore
Illumina
Giải trình tự lỗ nano
Công nghệ NGS có thể được ứng dụng trong nghiên cứu nào sau đây?
Giải trình tự toàn bộ bộ gen (WGS)
Phân tích biểu hiện gen (RNA-seq)
Nghiên cứu hệ vi sinh vật (metagenomics)
Tất cả các lựa chọn trên
Công nghệ Oxford Nanopore hoạt động dựa trên nguyên lý nào?
Tổng hợp chuỗi DNA và ghi nhận tín hiệu huỳnh quang
Dẫn truyền DNA qua lỗ nano và đo sự thay đổi dòng ion
Sử dụng enzyme polymerase để ghi nhận trình tự nucleotide
Khuếch đại DNA bằng PCR trước khi phân tích
Dòng đầu tiên trong một file FASTA thường bắt đầu bằng ký tự nào?
#
>
@
%
Dòng đầu tiên trong tệp FASTQ chứa thông tin gì?
Trình tự nucleotide
Chất lượng của trình tự
ID của đoạn đọc
Chú thích chất lượng
Dòng thứ hai trong tệp FASTQ chứa gì?
Chất lượng của nucleotide
Trình tự nucleotide
ID của đoạn đọc
Tên của tác giả
Dòng thứ tư trong tệp FASTQ chứa thông tin gì?
ID của đoạn đọc
Trình tự nucleotide
Chất lượng của trình tự
Ký tự xác định lỗi
Dòng tiêu đề trong tệp FASTA bắt đầu với ký tự nào?
@
#
*
>
Dòng tiêu đề trong tệp FASTA bắt đầu với ký tự nào?
@
#
*
>
Dòng tiêu đề trong tệp FASTA cung cấp thông tin gì?
Trình tự nucleotide
Tên gene và thông tin bổ sung
Thông tin về chất lượng đọc
Thông tin về protein
Dữ liệu đầu ra của máy Illumina thường được lưu trữ dưới định dạng nào?
FASTQ
PNG
XLSX
DOCX
Dữ liệu FASTA thu được từ NGS có thể được sử dụng để
Đánh giá mức độ biểu hiện gen
Kiểm tra tính chất vật lý của DNA
Xác định trọng lượng phân tử protein
Tạo ra hình ảnh 3D của phân tử RNA
Dữ liệu RNA-Seq chủ yếu được sử dụng để làm gì?
Đánh giá mức độ biểu hiện gen trong các mẫu sinh học
Giải mã trình tự DNA của sinh vật nhân sơ
Phân tích hình thái của các tế bào trong mô
Định lượng protein trong huyết tương
Dữ liệu thô từ NGS thường được lưu trữ dưới định dạng nào?
FASTQ
PNG
XLSX
DOCX
Dữ liệu thô từ quá trình giải trình tự RNA-Seq thường có định dạng nào?
FASTQ
JPEG
CSV
Dữ liệu thu được từ quá trình giải trình tự NGS thường được lưu trữ dưới định dạng nào?
FASTQ
DOCX
JPEG
Dữ liệu trong tệp FASTA có thể là gì?
Trình tự amino acid
Trình tự nucleotide
Cả A và B đều đúng
Không có dữ liệu
Để khắc phục hạn chế không phản ánh các thay đổi biểu hiện gen theo thời gian, giải pháp gì có thể được áp dụng?
Thực hiện RNA-Seq trên nhiều thời điểm (time-course RNA-Seq)
Sử dụng phương pháp phân tích các protein trong tế bào
Đo lường biểu hiện gen qua các phương pháp khác
Xử lý mẫu RNA trong các điều kiện nhất định chỉ một lần
Để phát hiện các vùng lặp tandem trong hệ gen, phần mềm nào thường được sử dụng?
GeneMark
Tandem Repeats Finder
ClustalW
MEGA
Để xuất kết quả sắp xếp trình tự từ BioEdit sang các phần mềm phân tích cây phát sinh chủng loại, bạn nên chọn định dạng nào?
FASTA hoặc PHYLIP
Excel hoặc CSV
DOC hoặc PDF
Image hoặc TIFF
Điểm khác biệt chính giữa định dạng FASTA và FASTQ là gì?
FASTQ chứa thông tin về chất lượng trình tự
FASTA có cấu trúc phức tạp hơn FASTQ
FASTQ chỉ dùng để lưu trữ protein, còn FASTA chỉ lưu trữ DNA
FASTA không được sử dụng trong giải trình tự DNA
Điểm phân nhánh (node) trên cây phát sinh chủng loại đại diện cho điều gì?
Sự kiện đột biến trong trình tự gen
Tổ tiên chung gần nhất của các loài tại nhánh đó
Loài có mức độ tiến hóa cao nhất trong cây
Số lượng gen có trong một bộ genome
Điều gì làm cho tệp FASTA trở thành một định dạng phổ biến?
Được sử dụng chủ yếu cho dữ liệu môi trường
Cấu trúc đơn giản và dễ đọc
Có thể chứa hình ảnh và văn bản
Phân tích RNA không cần tệp này
Điều gì xảy ra khi một ddNTP được gắn vào chuỗi DNA trong quá trình tổng hợp?
Quá trình tổng hợp tiếp tục
Quá trình tổng hợp DNA bị dừng lại
Enzyme polymerase bị bất hoạt
DNA bị phân hủy hoàn toàn
Định dạng BAM trong RNA-Seq đại diện cho loại dữ liệu nào?
Dữ liệu đã được ánh xạ lên hệ gen tham chiếu
Dữ liệu thô từ máy giải trình tự
Dữ liệu biểu hiện gen dưới dạng TPM
Danh sách protein được mã hóa bởi RNA
