WorksheetsI. PHÂN LOẠI VÀ CẤU TRÚC TTCV
Total questions: 70
Worksheet time: 35mins
Trình tự chuyển vị (TTCV) còn được gọi là gì?
Telomere
OriC
"Gen nhảy"
Plasmid F
Trình tự chuyển vị (TTCV) là một phần của cơ chế nào trong việc tạo tính biến động DNA?
Tái tổ hợp tương đồng
Sửa sai trực tiếp
Tái tổ hợp chuyên biệt vị trí
Sao chép theta
Cấu trúc cơ bản của một Insertion Sequence (IS) là gì?
IS(L) + gen kháng kháng sinh + IS(R)
non-IR + gen/DNA + non-IR
IR + Transposase gen + IR
Gen mã hóa cho telomerase
Thành phần nào sau đây là bắt buộc có trong cấu trúc của một Insertion Sequence (IS)?
Gen kháng kháng sinh
Gen mã hóa cho Ribosome
Gen Transposase
Telomere
Transposon (Tn) được định nghĩa có cấu trúc cơ bản gồm những thành phần nào?
IR + Transposase gen + IR
IS(L) + gen kháng kháng sinh + IS(R)
TTCV chủ động + TTCV bị động
Trình tự nhận biết SSRs
Transposon (Tn) là loại TTCV thuộc nhóm nào?
TTCV bị động
TTCV có khả năng chuyển vị
Retrotransposon
Yếu tố Ac
Non-composite transposon có cấu trúc cơ bản như thế nào?
IS(L) + gen kháng kháng sinh + IS(R)
non-IR + gen/DNA + non-IR
Gồm hai yếu tố Ac và Ds
Chỉ chứa gen transposase
TTCV nào được phân loại là chủ động (Activator) có khả năng tự biểu hiện enzyme chuyển vị hoạt động?
Ds
Ac
Non-composite transposon
Retrotransposon
Yếu tố Ds (Dissociation) được phân loại là TTCV bị động vì nó không có khả năng gì?
Không có khả năng biểu hiện enzyme chuyển vị hoạt động
Không có trình tự IR
Không có tính 5'-3' polymerase
Cần có sự tham gia của RecA
Yếu tố Ac ở bắp (ngô) có cấu trúc gen mã hóa cho enzyme nào giúp nó tự di chuyển?
DNA polymerase
Ligase
Transposase
RuvC
Yếu tố nào có thể gây mất chức năng của gen mục tiêu (ví dụ: gen tạo sắc tố tím trong ngô) khi nó chèn vào?
Helicase DnaB
Yếu tố Ds
Enzyme Photolyase
Topoisomerase I
Sau khi Ds rời khỏi gen, điều gì có thể xảy ra với chức năng của gen đó?
Gen bị phân hủy
Chức năng của gen có thể được phục hồi
Gen bị dimer hóa thymine
Gen chuyển thành DNA vòng
Cấu trúc nào trong Transposon (Tn) thường mang thông tin di truyền bổ sung, ví dụ như gen kháng kháng sinh?
IR
IS(L) và IS(R)
Gen transposase
Vùng gen kháng kháng sinh
Sự khác biệt về mặt cấu trúc giữa TTCV chủ động (Ac) và TTCV bị động (Ds) là gì?
Ac có gen transposase hoàn chỉnh, Ds bị mất đoạn gen này
Ac chỉ chuyển vị tạo bản sao, Ds chỉ chuyển vị không tạo bản sao
Ac không có IR, Ds có IR
Ac là DNA vòng, Ds là DNA thẳng
Đặc điểm cơ bản của chuyển vị không tạo bản sao là gì?
Không tăng số lượng TTCV trong tế bào sau chuyển vị
Cần trung gian RNA
Luôn tạo ra cấu trúc cointegrate
Chỉ xảy ra ở sinh vật nhân thực
Quá trình chuyển vị không tạo bản sao được mô tả là kiểu chuyển vị nào?
Vòng xoay
Cắt và chèn (Cut and paste)
Tái tổ hợp tương đồng
Sao chép theta
Enzyme nào thực hiện nhiệm vụ nhận biết và cắt TTCV khỏi vị trí cũ trong chuyển vị không tạo bản sao?
DNA Ligase
Reverse Transcriptase
Transposase
Topoisomerase II
Trong giai đoạn "Transposase Binding", enzyme transposase liên kết với vùng nào của transposon?
Vị trí oriC
Vùng biên của transposon (ví dụ: IR)
Vùng gen mã hóa kháng sinh
Vị trí AP site
Synaptic Complex Formation là giai đoạn nào trong chuyển vị không tạo bản sao?
Giai đoạn chèn TTCV vào
Giai đoạn tổng hợp DNA
Hai đầu của transposon được uốn lại để tạo thành phức hợp
Giai đoạn phân giải cấu trúc
Quá trình Cleavage (Cắt đứt) trong chuyển vị không tạo bản sao được thực hiện như thế nào?
Cắt một mạch đơn tại vị trí RS
Transposase cắt đoạn DNA tại vị trí đầu và cuối của transposon
RecBCD cắt tại vị trí chi sequence
Cắt bởi RuvC
Sau khi TTCV được chèn vào DNA mới trong giai đoạn "Strand Transfer", cơ chế của loại yếu tố chuyển vị nào được dùng làm ví dụ minh hoạ?
Ds
Ac
Retrotransposon
Plasmid F
Khi transposon trở lại vị trí cũ, điều gì có thể để lại tại vị trí chèn cũ?
Trở lại hoàn toàn như trình tự ban đầu
Có thể để lại dấu lặp không hoàn hảo (imperfect duplication)
Gen Wx bị biến thành TTCV bị động
Gen Wx bị alkyl hóa
Dấu lặp không hoàn hảo sau khi TTCV di chuyển ra có thể gây ra hiệu ứng nào?
Sửa chữa lỗi mismatch
Đột biến nhỏ hoặc làm thay đổi biểu hiện gen
Kéo dài telomere
Ngăn cản sự phân bào
Hiện tượng hạt ngô có màu sắc loang lổ (variegation) có liên quan đến hoạt động của yếu tố nào?
Topoisomerase II
Helicase CMG
Các yếu tố chuyển vị (ví dụ Ac/Ds)
Enzyme SOD
Trình tự nào của gen Wx ở ngô được dùng làm ví dụ về vị trí chèn của yếu tố Ac?
Trình tự lặp lại TTAGGG
Vùng giàu A-T
Trình tự CATGGAGA
Vị trí KAI
Sau khi Ac được chèn vào gen Wx, điều gì xảy ra với trình tự CATGGAGA?
Nó bị xóa bỏ hoàn toàn
Nó bị dimer hóa thymine
Ac được chèn vào giữa, tạo các vùng lặp lại (IR) ở hai đầu
Nó trở thành một vùng heteroduplex
Nếu Ac (chủ động) và Ds (bị động) cùng có mặt trong hệ, yếu tố nào cung cấp transposase?
Ds
RecA
Ac (cung cấp transposase)
Telomerase
Trong chuyển vị không tạo bản sao, Synaptic complex được hình thành từ sự uốn cong của cấu trúc nào?
Mạch khuôn RNA-L1
DNA đích
Hai đầu của transposon
Telomere
Trong chuyển vị không tạo bản sao, TTCV được chèn vào DNA đích thông qua giai đoạn nào?
Target Capture
Strand Transfer
RNA Polymerase activity
Cleavage
Chức năng của enzyme transposase trong chuyển vị không tạo bản sao bao gồm nhiệm vụ nào sau đây?
Gắn dNTPs và mồi RNA
Nhận biết, cắt, và chèn TTCV
Tháo xoắn DNA và gỡ rối
Sửa chữa lỗi dimer thymine
Transposon Tn5 (transposon DNA) được dùng để minh họa cho kiểu chuyển vị nào?
Chuyển vị không tạo bản sao
Chuyển vị qua trung gian RNA
Chuyển vị qua sao chép DNA vòng xoay
Sao chép DNA vòng xoay
Chuyển vị tạo bản sao khác với chuyển vị không tạo bản sao ở điểm nào?
Làm tăng số lượng TTCV trong tế bào
Xảy ra ở pha G1
Cần sự hiện diện của phức hợp Tus/Ter
Không cần enzyme transposase
Trình tự chuyển vị tạo bản sao qua trung gian RNA thuộc nhóm TTCV nào?
IS
Non-composite transposon
RetroTransposon
Yếu tố Ds
Trong chuyển vị tạo bản sao qua trung gian RNA, thành phần nào đóng vai trò là khuôn?
Mồi RNA
RNA-L1
DNA vòng
Cấu trúc T-loop
Enzyme nào chịu trách nhiệm phiên mã ngược để tạo ra ssDNA (cDNA) từ mạch khuôn RNA-L1?
DNA Pol I
RTase
Primase
Helicase DnaB
Trong chuyển vị Retrotransposon, enzyme nào tổng hợp mạch bổ sung DNA cho ssDNA vừa được chèn?
RTase
Endonuclease
DNA polymerase
RNA polymerase
Enzyme nào hoàn chỉnh mạch sau khi tổng hợp mạch DNA bổ sung hoàn tất trong chuyển vị qua trung gian RNA?
DNA Pol
Transposase
Ligase
Helicase
Hoạt tính endonuclease của enzyme chuyển vị trong cơ chế sao chép DNA khởi đầu bằng hoạt tính nào sau đây?
Cắt mồi RNA
Cắt liên kết N-glycosidic
Cắt 1 mạch DNA tại 2 đầu của TTCV và tại vị trí chuyển vị đến
Cắt Holliday Junction
Trong chuyển vị tạo bản sao qua sao chép DNA, enzyme chuyển vị thực hiện thao tác nào để nối đầu mạch tự do?
Nối mạch (Ligase)
Polymerase
Sửa sai proofreading
Branch migration
Trong chuyển vị qua trung gian RNA, enzyme nào cắt mở mạch tại vị trí mới và cung cấp đầu 3'OH để khởi đầu cho phiên mã ngược?
DNA Ligase
DNA Polymerase
Endonuclease/RTase
Photolyase
Cấu trúc nào được hình thành do DNA polymerase sinh tổng hợp mạch bổ sung với phần mạch đơn của TTCV mới được hình thành trong chuyển vị qua sao chép DNA?
Holliday Junction
Synaptic Complex
Cấu trúc “dung hợp” DNA (cointegrate)
T-loop
Sau khi cấu trúc cointegrate hình thành trong chuyển vị tạo bản sao qua sao chép DNA, enzyme chuyển vị tiếp tục làm gì?
Loại bỏ nhóm methyl
Cắt-nối ở 2 đầu của TTCV để phân cắt cấu trúc cointegrate
Kích hoạt telomerase
Tổng hợp DNA theo nguyên tắc bán bảo tồn
Sự hình thành cấu trúc cointegrate là đặc điểm nổi bật của cơ chế chuyển vị nào?
Chuyển vị không tạo bản sao
Chuyển vị qua trung gian RNA
Chuyển vị tạo bản sao qua sao chép DNA
Tái tổ hợp tương đồng
Chuyển vị RetroTransposon được xếp vào loại TTCV kháng tạo bản sao sinh vì:
Nó tái tổ hợp với gen kháng
Nó sử dụng phiên mã ngược để tạo ra bản sao DNA mới
Nó chỉ chèn vào gen không mã hóa
Nó tạo ra hai mối Holliday
Enzyme Reverse Transcriptase của RetroTransposon thuộc họ enzyme nào?
Endonuclease
DNA polymerase
RNA polymerase
DNA Helicase
Chức năng của enzyme Ligase trong cả hai kiểu chuyển vị tạo bản sao là gì?
Cắt DNA
Tạo mới RNA
Hoàn chỉnh mạch bằng cách nối các đầu 5'P và 3'OH
Xúc tác sự xâm lấn mạch
Quá trình chuyển vị tạo bản sao (qua sao chép DNA) cần enzyme chuyển vị để làm gì ở vị trí chuyển vị đến?
Cắt 1 mạch DNA tại 2 đầu TTCV và tại vị trí chuyển vị đến
Loại bỏ mồi Okazaki
Cung cấp ion kim loại Mg2+
Tháo xoắn DNA
Mục đích của việc cắt-nối để phân cắt cấu trúc “dung hợp” (cointegrate) là gì?
Tách hai phân tử DNA đã dung hợp thành hai phân tử DNA riêng biệt
Khởi động quá trình quang phục hồi
Tạo ra TTCV không tạo bản sao
Ngăn cản sự biểu hiện của gen transposase
Trong chuyển vị RetroTransposon, đầu nào được sử dụng để khởi mào phản ứng tổng hợp DNA mạch mới?
Đầu 3'OH của primer RNA
Đầu 3'OH được tạo ra do Endonuclease/RTase cắt mạch tại vị trí mới
Đầu 3'OH của mạch khuôn
Đầu 3'OH của TTCV
TTCV tạo bản sao dẫn đến điều gì về mặt di truyền?
DNA trở nên ổn định hơn
Tăng số lượng các đoạn lặp trong hệ gen
Giảm thiểu đột biến điểm
Kích hoạt apoptosis
Ý nghĩa cốt lõi của TTCV đối với tế bào là gì?
Tạo tính biến động (đa dạng cấu trúc/thông tin) cho vật liệu di truyền
Đảm bảo bộ thông tin sống được sao chép trung thực
Sửa chữa lỗi bắt cặp mismatch
Tháo xoắn DNA dạng siêu xoắn
Ngoài việc tạo tính biến động, TTCV còn tham gia vào hoạt động điều chỉnh nào?
Điều chỉnh tốc độ sao chép
Điều hòa biểu hiện gen
Điều chỉnh hoạt tính của Helicase DnaB
Điều chỉnh sự hình thành T-loop
Yếu tố Ac (Activator) được sử dụng làm ví dụ minh họa cho loại TTCV nào?
Chủ động/Không tạo bản sao (Cắt và chèn)
Bị động/Tạo bản sao
Retrotransposon
Transposon tạo cointegrate
Khi Ds chèn vào gen Wx ở ngô, tế bào sẽ thể hiện kiểu hình nào?
Hạt có màu tím đậm
Hạt có màu sắc loang lổ (variegation)
Hạt có màu xanh hoàn toàn
Hạt không có màu sắc
Trong quá trình chuyển vị tạo bản sao qua trung gian RNA, RetroTransposon có sự tương đồng về cơ chế enzyme với enzyme nào?
DNA Polymerase III
Telomerase (cũng là Reverse Transcriptase)
RuvC
Enzyme Catalase
Các loại TTCV, như IS và Transposon, được xếp vào nhóm nào của tái tổ hợp chuyển biệt vị trí?
Phương thức bảo tồn
Phương thức chuyển vị (Transposition)
Phương thức xâm lấn mạch
Phương thức quang phục hồi
Sự khác biệt nào trong quá trình chuyển vị tạo bản sao qua sao chép DNA và chuyển vị qua trung gian RNA?
Chuyển vị qua sao chép DNA tạo cấu trúc cointegrate
Chuyển vị qua RNA không cần Ligase
Cả hai đều không cần Transposase
Chuyển vị qua DNA không làm tăng số lượng TTCV
Nếu một tế bào có TTCV chủ động, khả năng bị đột biến trong hệ gen sẽ như thế nào?
Tăng lên do TTCV có thể cắt và chèn vào các gen quan trọng
Giảm đi do TTCV có khả năng sửa sai
Không thay đổi
Chỉ xảy ra ở vùng oriC
Chuyển vị tạo bản sao cần enzyme nào để tổng hợp bản sao DNA từ khuôn RNA?
RTase
DNA polymerase
RNA polymerase
Ligase
Vai trò của RNA template trong Telomerase tương tự với chức năng nào trong chuyển vị Retrotransposon?
Là vị trí gắn cho DNA Pol
Là tín hiệu kết thúc
Là mạch khuôn để tổng hợp DNA mới
Là enzyme cắt dimer thymine
Trong chuyển vị không tạo bản sao, giai đoạn Target Capture có chức năng gì?
Phân cắt cấu trúc cointegrate
Nối các đoạn Okazaki
Kích hoạt phức hợp DnaA
TTCV sau khi được giải phóng sẽ tìm vị trí mới trên DNA mục tiêu
Chuyển vị là cơ chế hoạt động bằng cách nào, dẫn đến sự sắp xếp lại các trình tự DNA?
Di chuyển TTCV từ vị trí này sang vị trí khác
Tái tổ hợp giữa các vùng tương đồng
Sửa chữa các lỗi base mismatch
Loại bỏ các gốc tự do
Yếu tố Ds bị đột biến mất đoạn mã hóa transposase có nghĩa là gì?
Nó là biến thể của Ac
Nó là một Retrotransposon
Nó là một Non-composite transposon
Nó là một plasmid F
Transposase cần làm gì để chuyển TTCV từ Donor DNA sang Target DNA trong chuyển vị không tạo bản sao?
Tổng hợp DNA mạch đơn
Kích hoạt Ligase
Cắt đoạn DNA tại vị trí đầu và cuối của transposon
Hình thành mối nối Holliday
Cấu trúc nào trong Transposon (Tn) giúp nó được enzyme transposase nhận biết và xử lý?
Gen kháng kháng sinh
Insertion Sequence (IS) ở hai đầu
Vùng non-IR
Vùng oriC
Yếu tố Ds không thể tự di chuyển mà cần sự giúp đỡ của Ac vì lý do gì?
Gen mã hóa transposase của Ds bị đột biến mất đoạn (deletion)
Ds chỉ có hoạt tính 3'-5' exonuclease
Ds chuyển vị qua trung gian RNA
Ds chỉ gắn lên oriC
Trong quá trình chuyển vị không tạo bản sao, TTCV di chuyển trực tiếp từ đâu đến đâu?
Từ RNA-L1 đến DNA đích
Từ DNA ban đầu (Donor DNA) đến DNA mục tiêu (Target DNA)
Từ ty thể ra ngoài nhân
Từ TTCV bị động đến TTCV chủ động
Trình tự chuyển vị không tạo bản sao là cơ chế của loại TTCV nào trong danh mục phân loại?
TTCV chủ động
Retrotransposon
Plasmid F
TTCV bị động
Sự gián đoạn gen Wx do Ac chèn vào có thể dẫn đến hậu quả gì?
Gen bị nhân đôi
Gen bị mất chức năng
Tăng cường biểu hiện gen
Gen chuyển thành telomere
Enzyme nào cắt mở mạch tại vị trí mới và cung cấp đầu 3'OH để khơi mào cho phiên mã ngược trong chuyển vị qua trung gian RNA?
DNA Ligase
DNA Polymerase
Endonuclease/RTase
Photolyase
