Pipet ukur

Batang L

Jarum inokulum (ose)

Spatula

Kaca preparat

Mikropipet

Sentrifus

Biosafety Cabinet (BSC) / Laminar Air Flow (LAF)

Spektrofotometer

Shaker incubator

Waterbath

Lemari pendingin

Inkubator

Autoklaf

Hot plate

Gelas ukur

Tabung reaksi

Erlenmeyer

Cawan petri

Labu ukur (volumetrik)

Vortex mixer

Mikroskop

pH meter

Colony counter

Bunsen

Pipet ukur dan propipet/bulb

Tabung durham

Batang pengaduk magnet

Kaki tiga

Kawat kasa

Sentrifus

Shaker

Vortex

Hot plate stirrer

Waterbath

Tabung reaksi berisi media agar miring (slant)

Cawan petri (petri dish) dari plastik atau kaca

Labu Erlenmeyer

Botol kultur

Gelas arloji

Kapas

Tabung durham

Kaca penutup (cover slip)

Kaca objek (object glass)

Sumbat silikon

Menciptakan lingkungan bersuhu sangat rendah

Menciptakan lingkungan tanpa oksigen (anaerob) untuk pertumbuhan bakteri tertentu

Mengaduk media cair secara terus menerus

Mensterilkan alat dengan radiasi UV

Menyimpan kultur dalam kondisi beku

Mikroskop elektron

Lupa (kaca pembesar)

Colony counter dengan pembesaran (magnifier)

Pipet tetes

Gelas ukur 10 mL

Mikropipet dan tip-nya

Spuit suntik

Labu ukur

Menginkubasi kultur

Mensterilkan udara di sekitar area kerja dan mensterilkan ujung ose secara aseptis

Mengaduk media

Memanaskan media dalam volume besar

Mengukur suhu

Memanaskan dan mengaduk media cair secara bersamaan

Membekukan dan memutar sampel

Mensterilkan dan menghitung koloni

Mengocok dan mendinginkan kultur

Mengukur dan menyeimbangkan pH

Lemari pendingin (4ºC)

Freezer ultrafreezer (-80ºC)

Waterbath (37ºC)

Rak tabung reaksi

Anaerobic jar

Menumbuhkan mikroba

Membuat preparat untuk pengamatan di bawah mikroskop

Mengukur volume media

Mensterilkan jarum inokulum

Mengencerkan sampel

Neraca analitik

Spektrofotometer (pada panjang gelombang ~600 nm)

pH meter

Termometer

Konduktometer

Jarum inokulum (ose)

Batang kaca berbentuk L (Drigalski spreader)

Pinset steril

Pipet volumetrik 10 mL

Membedakan bakteri Gram positif dan Gram negatif

Melihat struktur spora bakteri

Mengamati morfologi dan susunan sel bakteri secara sederhana

Mewarnai bakteri tahan asam (BTA)

Membedakan bakteri berkapsul dan tidak berkapsul

Asam

Basa (kationik)

Netral

Fluoresen

Negatif

Zat warna basa bermuatan positif berikatan dengan komponen sel bermuatan negatif

Zat warna asam bermuatan negatif berikatan dengan membran sel

Zat warna hanya mewarnai latar belakang

Zat warna diferensial berdasarkan ketebalan peptidoglikan

Zat warna hanya diikat oleh sel hidup

Mewarnai sel

Membunuh sel dan melekatkannya (adhesi) kuat pada kaca objek

Mencuci kelebihan zat warna

Melarutkan lemak dinding sel

Memucatkan warna sel

Dicuci dengan alkohol

Dicuci dengan air mengalir secara hati-hati

Ditambahkan larutan iodine

Dipanaskan sampai berasap

Ditambahkan safranin

Bentuk dan warna biru dengan latar belakang terang

Bentuk dan warna merah dengan latar belakang gelap

Hijau bercahaya di latar gelap

Tidak berwarna, hanya latar belakang biru

Merah muda dengan latar belakang biru

Granula penyimpanan (seperti polifosfat)

Flagela

Kapsul (dengan teknik pewarnaan negatif menggunakan metilen biru)

Jawaban A dan C benar

Jawaban A, B, dan C benar

0,1% - 1%

5% - 10%

20%

0,01%

Sediaan pekat tanpa pengenceran

Prosedurnya rumit namun sangat spesifik

Dapat membedakan jenis bakteri berdasarkan komposisi dinding sel

Cepat, mudah, dan murah untuk melihat bentuk, ukuran, dan susunan sel

Hanya mewarnai sel yang sudah mati

Dapat mengidentifikasi spesies bakteri

Dapat dioksidasi dan direduksi, sehingga pada kondisi anaerob akan menjadi tidak berwarna (leukometilen biru)

Selalu berwarna biru dalam semua kondisi

Berubah menjadi merah dalam suasana asam

Berfluoresensi di bawah sinar UV

Mengikat DNA secara spesifik

Sel akan tampak sangat jelas dan terpisah

Sel akan sulit diamati karena tumpang-tindih dan warna terlalu pekat

Sel akan tampak berwarna merah

Sel akan tampak transparan

Hanya latar belakang yang berwarna

Dibakar di atas bunsen

Dilap dengan tisu atau kertas blotting untuk mengeringkan airnya

Ditambahkan minyak imersi

Direndam dalam alkohol

Ditutup dengan kaca penutup tanpa dikeringkan

Sel hidup yang aktif secara metabolisme akan mereduksi metilen biru menjadi tidak berwarna, sedangkan sel mati tetap biru.

Sel hidup berwarna merah, sel mati biru.

Sel mati tidak menyerap warna sama sekali.

Sel hidup mengeluarkan zat warna.

Metilen biru hanya beracun bagi sel mati.

Di dalam lemari asam

Di dalam botol bertutup rapat, di tempat sejuk dan gelap (untuk mengurangi pengendapan/pengoksidasian)

Di dalam freezer

Di atas meja dekat jendela

Dalam wadah terbuka untuk mengurangi penguapan

Sel darah putih

Jamur mikroskopis (khamir dan kapang)

Protozoa

Jawaban A dan B benar

Jawaban A, B, dan C benar

Larutan zat warna terlalu encer

Waktu pewarnaan terlalu singkat

Tidak dilakukan pencucian setelah pewarnaan

Fiksasi yang kurang sempurna

Sediaan terlalu tipis

Fiksasi dengan panas

Pemberian zat warna metilen biru

Pencucian dengan air

Pemberian larutan pemucat (decolorizer) seperti alkohol-aseton

Pengeringan dan pengamatan

Melindungi lensa objektif mikroskop dari sediaan yang basah

Meratakan sediaan sehingga ketebalannya seragam

Mencegah pengeringan sediaan terlalu cepat

Sebagai langkah fiksasi kedua

Memperjelas bidang pandang di bawah mikroskop

Lebih kompleks dan bersifat diferensial

Lebih sederhana dan bersifat langsung (hanya memberikan satu warna)

Sama-sama menggunakan empat reagen

Hanya untuk bakteri Gram positif

Memberikan hasil yang lebih informatif untuk identifikasi bakteri

Tingginya jumlah bakteri pereduks yang aktif (kualitas susu buruk)

Susu masih segar dan steril

Adanya kandungan lemak yang tinggi

Susu telah dipasteurisasi dengan baik

Tidak ada aktivitas mikroba sama sekali

Darah vena

Permukaan dalam pipi (mukosa bukal)

Permukaan kulit lengan

Akar rambut

Kuku

Jarum suntik (syringe)

Kapas steril bertangkai panjang (swab)

Lancing device

Spatula logam

Cawan petri

Sel darah merah

Sel epitel mukosa pipi dan DNA di dalamnya

Bakteri rongga mulut

Enzim pencernaan

Jaringan otot

Non-invasif, tidak sakit, dan lebih mudah dilakukan

Menghasilkan DNA dengan kualitas lebih tinggi

Volume sampel DNA yang diperoleh lebih banyak

Proses ekstraksi DNA lebih rumit

Hanya memerlukan alat khusus yang mahal

Berkumur dengan antiseptik kuat

Tidak makan, minum (kecuali air putih), merokok, atau mengunyah permen karet minimal 30–60 menit sebelumnya

Menggosok gigi secara menyeluruh tepat sebelum pengambilan sampel

Mengonsumsi makanan berlemak

Tidak ada persiapan khusus

Menggosok dengan kuat hingga berdarah

Menggosok lembut namun mantap pada permukaan dalam pipi kiri dan kanan, serta putaran di sekeliling mulut selama total sekitar 30–60 detik

Hanya menyentuhkan ujung swab ke bibir

Menggosok gusi dan lidah secara intensif

Menggosok sekali saja pada satu sisi pipi

Segera dimasukkan ke dalam tabung berisi medium transport atau pengawet (buffer stabilisasi)

Dibiarkan kering di udara terbuka tanpa wadah

Dicuci dengan air bersih

Dibakar ujungnya

Langsung dikirim tanpa wadah

Kapas biasa dapat mengandung DNA tanaman yang mengganggu analisis dan dapat menghambat reaksi PCR

Dacron atau rayon cenderung merusak DNA manusia selama pengambilan

Kapas justru memiliki afinitas terbaik untuk DNA sehingga hasil PCR lebih kuat

Dacron atau rayon mengandung logam berat yang bereaksi dengan enzim polimerase

1 swab untuk satu sisi pipi

2–4 swab (masing‑masing untuk pipi kiri dan kanan, kadang digosok berulang)

10 swab sekaligus

Tidak menggunakan swab, hanya kumur‑kumur

1 swab untuk seluruh rongga mulut

Tabung dikocok kuat‑kuat

Ujung swab dipatahkan atau dipotong sesuai tanda, kemudian tutup tabung rapat

Tabung dibuka kembali untuk memeriksa sampel

Tabung langsung dibekukan di dry ice

Tabung diisi dengan alkohol 70%

Suhu ruang (jika menggunakan buffer stabilisasi) atau sesuai protokol kit, seringnya 2–8°C untuk jangka pendek

Harus selalu dalam kondisi beku −20°C

Direndam dalam air hangat

Dijemur di bawah sinar matahari

Disimpan dalam inkubator 37°C

Tes DNA untuk hubungan keluarga (paternitas)

Analisis genotipe dan variasi genetik

Pemeriksaan penyakit infeksi bakteri mulut

Penyakit genetik yang melibatkan gen dalam sel epitel

Identifikasi forensik

Penggosokan yang terlalu singkat dan lemah

Responden baru saja makan atau minum sebelum pengambilan

Swab yang dibiarkan kering tanpa medium penyangga

Pengambilan mengikuti protokol dengan buffer stabilisasi

Dapat dikumpulkan secara mandiri (self‑collected) di rumah oleh partisipan

Selalu menghasilkan DNA dengan kemurnian tinggi

Biaya analisisnya lebih mahal daripada sampel darah

Memerlukan tenaga kesehatan terlatih untuk mengambilmya

Volume DNA yang konstan dan tidak bervariasi

Dibiarkan kering di udara, lalu dimasukkan ke dalam kantong kering (dry swab) – meski tidak ideal

Direndam dalam alkohol 70%

Dimasukkan ke dalam air suling

Dibungkus dengan tisu basah

Langsung dibekukan tanpa wadah

Swab terlihat basah oleh air liur dan mungkin ada partikel putih kecil (kumpulan sel) yang menempel

Swab berwarna merah karena berdarah

Swab tetap kering dan bersih

Responden merasa sakit yang signifikan

Terdapat bekas luka pada pipi

Sama seperti orang dewasa, dengan pengawasan dan bantuan orang tua

Tidak mungkin dilakukan pada anak di bawah 5 tahun

Harus dilakukan dengan pembiusan

Hanya diambil dari bagian luar pipi

Menggunakan jarum suntik khusus

1-2 menit

15-20 menit

1 jam

5 detik

30 menit

Menuliskan identitas responden dengan jelas pada label tabung

Mencatat waktu dan tanggal pengambilan

Mencatat kondisi responden sebelum pengambilan (puasa/tidak)

Jawaban A dan B benar

Jawaban A, B, dan C benar

Sampel pembanding (reference sample) untuk membandingkan profil DNA-nya dengan sidik jari DNA dari TKP

Sampel utama dari korban

Sampel untuk tes kehamilan

Sampel untuk deteksi narkoba

Sampel untuk tes penyakit menular

Hans Christian Gram

Robert Koch

Louis Pasteur

Alexander Fleming

Pewarnaan sederhana (simple stain)

Pewarnaan negatif (negative stain)

Pewarnaan diferensial (differential stain)

Pewarnaan endospora

Pewarnaan kapsul

Membedakan bakteri berdasarkan bentuk selnya (batang, kokus, spiral)

Membedakan bakteri menjadi dua kelompok besar berdasarkan komposisi dinding selnya

Mewarnai seluruh sel dengan satu warna

Melihat struktur flagela bakteri

Mengidentifikasi spesies bakteri secara pasti

Gram negatif

Gram positif

Gram variabel

Gram netral

Tidak terwarnai

Gram negatif

Gram positif

Gram variabel

Gram netral

Tidak terwarnai

Alkohol – Kristal violet – Iodine – Safranin

Kristal violet – Iodine – Alkohol – Safranin

Safranin – Kristal violet – Alkohol – Iodine

Iodine – Safranin – Alkohol – Kristal violet

Kristal violet – Safranin – Alkohol – Iodine

Zat warna primer

Zat warna penutup (counterstain)

Bahan pemucat (decolorizer)

Mordant (memperkuat ikatan zat warna dengan sel)

Pelarut lemak

Zat warna primer

Zat warna penutup (counterstain)

Bahan pemucat (decolorizer)

Mordant (memperkuat ikatan zat warna dengan sel)

Fiksatif

Lapisan peptidoglikan yang tipis dan membran luar

Lapisan peptidoglikan yang tebal dan tanpa membran luar

Banyak lemak pada dinding sel

Kapsul yang tebal

Flagela yang banyak

Lapisan peptidoglikan tebal menahan kompleks kristal violet-iodin

Lapisan peptidoglikan tipis tidak dapat menahan kompleks kristal violet-iodin yang tercuci alkohol, lalu terwarnai safranin

Tidak dapat diwarnai oleh safranin

Mengikat iodine lebih kuat

Mengandung kristal violet alami

Pemberian kristal violet

Pemberian iodine

Pencucian dengan alkohol (decolorization)

Pemberian safranin

Fiksasi panas

Tetap ungu dengan sempurna

Menjadi merah (terdecolorisasi berlebihan)

Menjadi tidak berwarna sama sekali

Menjadi hijau

Menjadi biru tua

Tetap merah muda dengan sempurna

Tampak ungu (false Gram positif / under-decolorization)

Menjadi tidak berwarna

Menjadi hitam

Menjadi biru

Escherichia dan Pseudomonas

Staphylococcus dan Bacillus

Salmonella dan Vibrio

Neisseria dan Haemophilus

Semua jawaban di atas Gram negatif

Streptococcus dan Clostridium

Mycobacterium dan Nocardia

Escherichia dan Klebsiella

Lactobacillus dan Listeria

Semua jawaban di atas Gram positif

Kultur bakteri sudah terlalu tua (lebih dari 24 jam)

Terlalu banyak mencuci dengan alkohol (over-decolorize)

Penggunaan antibiotik oleh pasien sebelum pengambilan sampel

Preparat yang terlalu tebal

Pemberian iodine yang cukup

Memiliki dinding sel dengan kandungan lipid (asam mikolat) yang tinggi, sehingga sulit diwarnai dengan pewarnaan biasa

Tidak memiliki dinding sel

Terlalu kecil untuk dilihat

Selalu berbentuk bulat sempurna

Hanya hidup di dalam sel inang

Kemungkinan infeksi bakteri Gram negatif dengan respons peradangan

Tidak ada infeksi bakteri

Infeksi jamur

Infeksi virus murni

Kontaminasi sampel saja

4x atau 10x (pembesaran rendah)

40x atau 100x (minyak imersi) dengan kondensor terangkat dan diafragma dibuka

100x tanpa minyak imersi

Hanya lensa okuler 10x

20x saja sudah cukup