Wayground logo

Free Printable Worksheets

Font size

S
M
L
XL
Worksheets

Základy bioinformatiky: velké opakování

Total questions: 61

Worksheet time: 31mins

Name
Class
Date
1.

Testovací otázka

a)

Správná odpověď

b)

Špatná odpověď

c)

Špatná odpověď

d)

Špatná odpověď

2.

Co je charakteristickým znakem eukaryotických chromozomů?

a)

Cirkulární molekula

b)

Jednovláknová DNA

c)

Lineární molekula

d)

Nemají homology

3.

Jaký proces vede ke vzniku haploidních buněk z diploidních buněk?

a)

Mitóza

b)

Karyotypizace

c)

Meióza

d)

Rekombinace

4.

Který typ struktury DNA převládá v biologických systémech?

a)

A-DNA

b)

Z-DNA

c)

B-DNA

d)

G-DNA

5.

Jaká je hlavní úloha mitochondrií v buněčném metabolismu?

a)

Produkce energie

b)

Syntéza bílkovin

c)

Ukládání genetického materiálu

d)

Regulace buněčného dělení

6.

Který termín popisuje kondenzovanou formu chromatinu?

a)

Euchromatin

b)

Heterochromatin

c)

Nukleozom

d)

Chromozom

7.

Jaký základní proces popisuje hlavní dogma molekulární biologie?

a)

Tok genetické informace:
DNA → RNA → protein

b)

Přenos genetické informace:
DNA → protein → RNA

c)

Syntéza genetického materiálu:
RNA → DNA → protein

d)

Replikace genetické informace:
DNA → DNA → DNA

8.

Co je na obrázku?

a)

Nukleotid

b)

Nukleosid

c)

Nukleosom

9.

Který z následujících enzymů je zodpovědný za degradaci molekul DNA přerušením fosfodiesterových vazeb?

a)

DNA polymeráza

b)

Ligáza

c)

Nukleáza

d)

Restrikční endonukleáza

10.

Jaká je hlavní funkce vektorů při klonování DNA?

a)

Syntéza nových polynukleotidů

b)

Degradace molekul DNA

c)

Přenos specifických genů do cílových buněk

d)

Spojování molekul DNA dohromady

11.

Který z následujících vektorů je schopen nést největší vloženou DNA?

a)

Plazmid

b)

Kosmid

c)

Bakteriální umělý chromozom (BAC)

d)

Umělý chromozom kvasinek (YAC)

12.

PCR je technika používaná především k:

a)

Syntéza nových polynukleotidů

b)

Degradaci molekul DNA

c)

Amplifikaci krátkých fragmentů DNA

d)

Spojování molekul DNA dohromady

13.

Specifický produkt PCR se hromadí exponenciálně 2n, kde n je počet cyklů. Jaká je rychlost produkce nespecifického produktu?

a)

Lineární (n)

b)

Exponenciální se základem 2 (2n)

c)

Exponenciální se základem 10 (10n)

d)

Nulová (0)

14.

Který typ mapy zobrazuje uspořádání markerů na základě jejich společné frekvence dědičnosti?

a)

Cytogenetická mapa

b)

Genetická mapa

c)

Fyzická mapa

d)

Telomerická mapa

15.

Jaká jednotka se používá k měření vzdáleností mezi markery na genetických mapách?

a)

Páry bazí (bp)

b)

Centimorgany (cM)

c)

Kilopáry bazí (kbp)

d)

Megapáry bazí (Mbp)

16.

Která z následujících možností NENÍ typem markeru DNA?

a)

polymorfismus délky restrikčních fragmentů (RFLP)

b)

jednoduché sekvenční délkové polymorfismy (SSLP)

c)

Messenger RNA (mRNA)

d)

jednonukleotidové polymorfismy (SNP)

17.

Jaká je hlavní výhoda jednonukleotidových polymorfismů (SNP) oproti polymorfismům délky restrikčních fragmentů (RFLP)?

a)

Početnost

b)

Komplexnost

c)

Vzor dědičnosti

d)

Rychlost mutací

18.

Která technika NENÍ považována za metodu fyzického mapování?

a)

Restrikční mapování

b)

Analýza genetických vazeb (genetic linkage)

c)

Fluorescenční in situ hybridizace (FISH)

d)

Mapování sekvenčně značených míst (STS)

19.

Jaká je hlavní funkce ligáz v technologii rekombinantní DNA?

a)

Rozkládají molekuly DNA

b)

Syntetizují nové polynukleotidy

c)

Spojovat molekuly DNA

d)

Upravují konce molekul DNA

20.

Která technika fyzikálního mapování zahrnuje značení sekvencí DNA fluorescenčními sondami a jejich vizualizaci pod mikroskopem?

a)

Restrikční mapování

b)

Fluorescenční in situ hybridizace (FISH)

c)

Mapování sekvenčně označených míst (STS)

d)

Sekvenování celého genomu

21.

Který typ molekuly DNA slouží jako vektor pro vnesení specifických genů do cílových buněk?

a)

Plazmid

b)

mRNA

c)

tRNA

d)

Ribozom

22.

Která z následujících vlastností je charakteristická pro plazmidy používané jako vektory při klonování DNA?

a)

Jsou to lineární molekuly DNA

b)

Replikují se nezávisle na chromozomální DNA

c)

Vyskytují se výhradně v eukaryotických buňkách

d)

Obsahují geny pro syntézu proteinů

23.

Jaké je přibližné procento lidského genomu, které kóduje proteiny?

a)

50-60%

b)

25-30%

c)

10-15%

d)

1.1-1.4%

24.

Co bylo hlavním cílem projektu lidského genomu?

a)

Vyvinout nové techniky editace genů

b)

Určit sekvenci haploidního lidského genomu

c)

Patentovat identifikované geny pro komerční využití

d)

Vytvořit databáze pro genetický výzkum

25.

Jaký je hlavní problém spojený s celogenomovým sekvenováním?

a)

Vysoká cena

b)

Nízké pokrytí genomu

c)

Krátká životnost sekvenátorů

d)

Repetitivní sekvence

26.

Která metoda se primárně používá k řešení kontaminace bakteriálními vektory při sestavování genomu?

a)

PHRED base calling

b)

sestavení sekvence PHRAP

c)

Filtrační programy

d)

sekvenování s využitím sekvenátorů (Shotgun sequencing)

27.

Jaký je přibližný počet SNP (jednonukleotidových polymorfismů) v lidském genomu?

a)

1,000

b)

100,000

c)

1 milion

d)

100 milionů

28.

Která strategie sekvenování genomu byla přijata v rámci projektu Human Genome Project (HGP)?

a)

Sekvenování "shotgun"

b)

Hierarchické sekvenování genomu (HGS)

c)

Shotgun celého genomu (WGS)

d)

Sestavení de novo

29.

Která generace sekvenátorů zavedla koncept vysoce výkonného sekvenování (high-throughput sequencing) nové generace (NGS)?

a)

1. generace

b)

2. generace

c)

3. generace

d)

4. generace

30.

Jaké je hlavní omezení sekvencerů 2. generace ve srovnání se sekvencery 3. generace?

a)

Vyšší chybovost

b)

Nižší propustnost

c)

Kratší délka čtení

d)

Není potřeba amplifikace použitím PCR

31.

Která technologie využívá sekvenování jednotlivých molekul bez amplifikace PCR?

a)

SMRT od PacBio

b)

Sangerovo sekvenování

c)

Pyrosekvenování

d)

Sekvenování Illumina

32.

Jaká je hlavní výhoda technologie sekvenování Oxford Nanopore?

a)

Větší délka čtení

b)

Nižší chybovost

c)

Kratší délka čtení

d)

Vyšší propustnost

33.

Který zákon popisuje trend snižování nákladů spojených se sekvenováním DNA v čase?

a)

Mendelův zákon dědičnosti

b)

Hardyho-Weinbergova rovnováha

c)

Moorův zákon

d)

Centrální dogma molekulární biologie

34.

Jaký je hlavní rozdíl mezi párovým zarovnáním a vícenásobným zarovnáním sekvencí?

a)

Při párovém zarovnání se zarovnávají pouze dvě sekvence, zatímco při vícenásobném zarovnání více než dvě sekvence.

b)

Párové zarovnání se používá pro sekvence DNA, zatímco vícenásobné zarovnání sekvencí se používá pro sekvence proteinů.

c)

Zarovnání více sekvencí je přesnější než párové zarovnání.

d)

Zarovnání dvojic je rychlejší než zarovnání vícenásobných sekvencí.

35.

Jaký význam má evoluční konzervace v analýze sekvencí?

a)

Ukazuje na přítomnost transponovatelných elementů

b)

Naznačuje funkční význam určitých genomových oblastí

c)

Usnadňuje PCR amplifikaci cílových genů

d)

Koreluje s vyšší mírou mutací

36.

Co je na obrázku?

a)

Cambridge Nanopore

b)

Oxford Nanopore

c)

Ukončení řetězce vložením ddNTP

37.

Jaký termín popisuje dvě sekvence, které pocházejí ze společné sekvence předků?

a)

Analog

b)

Homolog

c)

Ortholog

d)

Paralog

38.

Jaký je hlavní rozdíl mezi ortology a paralogy?

a)

Ortologové se vyskytují u stejného druhu, zatímco paralogové u různých druhů

b)

Ortologové mají různé funkce, zatímco paralogové mají stejné funkce

c)

Ortologové vznikají v důsledku genových speciací, zatímco paralogové vznikají v důsledku duplikací

d)

Ortologové jsou evolučně konzervovanější než paralogové

39.

Jak se nazývá postup porovnávání sekvencí za účelem zjištění vzorců zachování a variability?

a)

Syntéza sekvencí

b)

Evoluční analýza

c)

Zarovnání sekvencí

d)

Genetické profilování

40.

Jaké faktory se podílejí na výsledku zarovnání sekvencí DNA?

a)

Substituční matice

b)

Penalizace za mezeru

c)

Penalizace za délku mezery

d)

Všechny uvedené

41.

Jak se používají substituční matice při bodování zarovnání proteinů?

a)

K penalizaci neshod mezi sekvencemi

b)

K přidělování skóre na základě fyzikálně-chemických vlastností aminokyselin

c)

K určení pravděpodobnosti bodových mutací

d)

Vše z uvedeného

42.

Proč je často informativnější porovnávat sekvence proteinů než sekvence DNA?

a)

Proteinové sekvence jsou kratší a snáze se zarovnávají

b)

Mnoho změn v DNA nemění specifikované aminokyseliny

c)

Proteinové sekvence jsou evolučně konzervovanější

d)

Vše z uvedeného

43.

Jak ovlivní zarovnání sekvencí nastavení vysoké sankce za mezeru?

a)

Podporuje vkládání více a větších mezer

b)

Odrazuje od vkládání mezer, což vede k celkově menšímu počtu mezer

c)

Nemá žádný vliv na vkládání mezer

d)

Vede ke kombinaci malých a velkých mezer

44.

Co znamená zkratka PAM v kontextu substitučních matic?

a)

Percent Accepted Mutations

b)

Protein Alignment Method

c)

Pairwise Alignment Matrix

d)

Phylogenetic Annotation Model

45.

Co platí pro matici PAM40 ve srovnání s PAM120?

a)

Modeluje evolučně vzdálenější sekvence

b)

Vhodná pro zarovnání sekvencí s vyšší podobností

c)

Obsahuje více akceptovaných mutací

d)

Používá se pro zarovnání celých genomů

46.

Co je na obrázku?

a)

Kladogram

b)

Fylogram

47.

Jaký je hlavní účel zarovnání sekvencí v bioinformatice?

a)

Určit délku sekvence

b)

Najít podobnosti a evoluční vztahy mezi sekvencemi

c)

Převést DNA na protein

d)

Vypočítat molekulovou hmotnost sekvence

48.

Který algoritmus se používá pro globální zarovnání sekvencí?

a)

BLAST

b)

Smith-Waterman

c)

Needleman-Wunch

d)

FASTA

49.

Která matice se běžně používá pro hodnocení zarovnání proteinových sekvencí?

a)

BLOSUM

b)

PHRED

c)

FASTQ

d)

BWA

50.

Který nástroj byste použili pro rychlé vyhledávání podobných sekvencí v databázi?

a)

Needleman-Wunsch

b)

Excel

c)

BLAST

d)

Clustal Omega

51.

Jaký je hlavní účel genetického mapování?

a)

Identifikovat geny a jejich umístění na chromozomech

b)

Určit pořadí nukleotidů v DNA

c)

Analyzovat proteinové struktury

d)

Studovat evoluční vztahy mezi organismy

52.

Která technika se používá k analýze exprese genů pomocí fluorescenčního značení?

a)

Real-time PCR

b)

Western blotting

c)

In situ hybridizace

d)

ELISA

53.

Jaký je hlavní rozdíl mezi genomem a proteomem?

a)

Genom je tvořen DNA, zatímco proteom je tvořen RNA

b)

Genom se studuje pomocí sekvenování, zatímco proteom pomocí PCR

c)

Genom zahrnuje všechny geny, zatímco proteom zahrnuje všechny proteiny

d)

Genom je stabilní, zatímco proteom se mění v závislosti na podmínkách

54.

Co je na obrázku?

a)

Fylogenetický strom

b)

Chromatogram ze Sangerova sekvenování

c)

Dot plot zarovnání dvou sekvencí

d)

QR kód

55.

Co je na obrázku?

a)

Výstup z Oxford Nanopore sekvenování

b)

Chromatogram ze Sangerova sekvenování

c)

Elektroforéza na agarózovém gelu

d)

Výstup z Illumina sekvenování

56.

Co je na obrázku?

a)

VCF soubor

b)

SAM soubor

c)

FASTQ soubor

d)

FASTA soubor

57.

Co je na obrázku?

a)

Poziční frekvenční matice

b)

Sekvenční logo

c)

Substituční matice

d)

Konsenzuální sekvence

58.

Který z následujících parametrů NENÍ důležitý při návrhu PCR primeru?

a)

Obsah GC

b)

Teplota tání (Tm)

c)

Molekulová hmotnost primeru

d)

Tvorba sekundárních struktur

59.

Proč je nežádoucí, aby primer tvořil primer-dimery?

a)

Zvyšuje to chybovost DNA polymerázy

b)

Primery amplifikují samy sebe místo cílové sekvence

c)

Snižuje to teplotu tání templátové DNA

d)

Způsobuje to degradaci templátu

60.

Kdy je vhodnější použít lokální zarovnání místo globálního?

a)

Když jsou sekvence stejně dlouhé

b)

Když hledáme konzervované domény v jinak nepodobných sekvencích

c)

Když porovnáváme sekvence ze stejného druhu

d)

Když porovnáváme sekvence ze stejného druhu

61.

Co znamená E-value v kontextu výsledků BLAST?

a)

Délka zarovnání

b)

Procento identických pozic

c)

Očekávaný počet náhodných hitů s podobným skóre v dané databázi

d)

Evoluční vzdálenost mezi sekvencemi